简介:Computationalanalysisisessentialfortransformingthemassesofmicroarraydataintoamechanisticunderstandingofcancer.Herewepresentamethodforfindinggenefunctionalmodulesofcancerfrommicroarraydataandhaveappliedittocoloncancer.First,acoloncancergenenetworkandanormalcolontissuegenenetworkwereconstructedusingcorrelationsbetweenthegenes.Thenthemodulesthattendedtohaveahomogeneousfunctionalcompositionwereidentifiedbysplit-tingupthenetwork.Analysisofbothnetworksrevealedthattheyarescale-free.Comparisonofthegenefunctionalmodulesforcoloncancerandnormaltissuesshowedthatthemodules’functionschangedwiththeirstructures.
简介:目的观察DNA拓扑异构酶Ⅱ(TOPOⅡ)在食管癌的表达,初步探讨其临床生物学意义。方法应用S-P免疫组织化学方法检测原发性食管癌103例,其中鳞状细胞癌100例,腺癌3例,癌周正常粘膜组织32例TOPDⅡ的表达。结果TOPOⅡ在食管癌的表达明显高于癌周组织,癌周鳞状上皮基底细胞可见少数核阳性表达。鳞状细胞癌高于腺癌的表达。食管鳞状细胞癌的分化程度与TOPOⅡ的表达呈正相关。结论TOPOⅡ在食管腺癌的表达低,符合其比食管鳞状细胞癌预后差。对放疗,化疗不敏感的事实。TOPOⅡ在高,中分化食管鳞状细胞癌的表达高于低分化者,提示食管鳞状细胞癌高分化者对拓扑异构酶抑制剂化疗药敏感,预后好。
简介:目的观察HBsAg阳性患者血清标记物与HBVDNA水平间的关系.方法用时间分辩免疫荧光分析法测定HBV感染者的血清标记物,荧光定量PCR法测定HBVDNA含量.结果204例HBV感染者中,血清标记物出现三种组合,组合Ⅰ为HBsAg(+)、HBeAg(+)、抗-HBc(+)104例,血清HBVDNA阳性率为86.5%;组合Ⅱ为HBsAg(+)、抗-HBe(+)、抗-HBc(+)80例,血清HBVDNA阳性率为32.5%;组合Ⅲ为HBsAg(+)、抗-HBc(+)20例,血清HBVDNA含量均低于检测低限(<1×103拷贝/毫升).结论HBV感染者血清HBVDNA水平更能反映病毒复制的程度,应努力开展此项检测.
简介:韩国人类基因组功能分析中心成功地研制出一种特别针对韩国人胃组织基因的DNA芯片。该芯片包含了14,000个来源于胃癌细胞和正常组织的基因。
简介:TheaimofthisstudyistoinvestigatethefeasibilityandmechanismofhIL-2-preSDNAvaccineaspreventionandtherapeuticapproachagainstHepatitisB.EukaryonexpressionvectorinvolvinghIL-2andpreSgenewasconstructedwithrecombinanttechniqueandtransferredintonormalBALB/cmiceandHBVtransgenicmice(Tg-Mice)respectively.Tnenaseriesofdetectionwereperformed:detectionofanti-preS2,HBsantibodyandHBsAginBALB/cmiceandTg-micewithELISA,quantificationofHBVDNAcopiesinHBVTg-miceserumwithreal-timePCR,determinationofhepatitisdegreewithimmunopathologicalHEstaininganddetectionofliverfunction.Anti-preS1canbedetectedat4^th,6^thand10^thweekininoculatedBALB/cmice.Injectionwithgenegungainedanadvantageovermuscularandsubcutaneousinjectionsinceitacquiredjust1/10inoculationquantity(10μg/mouse).HighestexpressionofIgG2aat4^thweeksuggestedThl-mediatedimmuneresponse,whichfacilitatedHBVcleaning.OfallinoculatedHBVTg-mice,80%ofthemshowedanfi-preS2,HBsantibodypositiveandHBVDNAdecreased,and20%showednegativeforHBsAg.HEstainingtohepatictissueshowedobviousinfiltrationofinflammatorycells,swellingandgranulardegenerationofhepatocytes.Inourstudy,IL-2-preSDNAvaccinewhichcanprovokethehumoralandcellularimmuneresponseandbreaktheimmunetolerancesupportsthedesignationandconstructionofnewvaccineagainstHBVandspecificimmuneremedyforHBVcontinuousinfection.
简介:目前临床上许多医疗单位仍采用巴氏分类法诊断宫颈细胞学涂片。随着TBS诊断方法的逐渐普及,越来越多的单位开始接受这一最新的诊断报告方式。本文将542例宫颈细胞学涂片以TBS诊断报告并结合DNA倍体分析,结果有78例经TBS检查细胞形态有异常改变,但其中只有一例可以诊断为恶性(考虑为CIS),其余77例均不能作出肯定的恶性诊断。将此78例患者再取材进行DNA倍体分析,结果有6例经DNA倍体分析仪分析为多倍体(DI>2),术后病理证实均为恶性,阳性检出率为TBS诊断报告结果的6倍。由此可见,在诊断宫颈细胞学时,以“TBS”结合DNA倍体分析,对宫颈癌的早期诊断更有帮助,阳性率及准确性更高。
简介:USING3PRIMERPAIRSTODETECTHBVDNAINLIVERTISSUESFROMHEPATOCELLULARCARCINOMASWITHPCR TECHNIQUEChenMing陈明;LuLing吕凌;YaoJilu姚集鲁;Peng...
简介:模板DNA的质量直接影响PCR扩增的结果,而不同提取方法及其缓冲液的成份与浓度对提取DNA的质量有重要影响.本文以5个栽培大豆品种的叶片为材料,比较分析了SDS与CTAB两种提取方法以及不同浓度CTAB提取缓冲液对所提取的DNA质量的影响,并通过PCR进行检验.实验结果表明:用1%(W/V)、2%(W/V)浓度的CTAB提取缓冲液和1.25%(W/V)SDS提取缓冲液所提取的大豆叶片DNA的质量较好,均能满足PCR扩增模板的需求,其中以1.25%(W/V)SDS提取得到的大豆叶片DNA质量最好,以其为模板扩增的效果最佳,而4%浓度的CTAB不适宜提取大豆叶片DNA.
简介:目的获得东方田鼠的特异DNA序列.方法Aβ基因使用PCR,基因克隆,斑点杂交,DNA序列分析,生物信息学技术.结果根据小鼠MHCⅡ外显子2及其两侧序列,合成引物并扩增东方田鼠基因组DNA,将PCR产物回收、测序后,分别设计内引物扩增东方田鼠基因组DNA,其中一对引物可得到特异性扩增带,将得到的DNA片段插入PGEM-Teasy载体,进行序列分析.用这对引物扩增人、昆明小鼠、BALB/c小鼠及C57BL/6J小鼠基因组DNA,均无扩增产物.以东方田鼠特异性扩增产物为探针进行斑点杂交,除东方田鼠基因组DNA外,其他几种动物基因组DNA均为阴性结果.进一步对该DNA片段进行了BLAST同源性搜索和外显子预测,在Genbank中没有发现高度同源序列,并且找到一个可能的外显子,该外显子由69个氨基酸组成.结论获得的DNA片段为东方田鼠的特异片段,这将为从分子水平深入研究东方田鼠的遗传背景、生物进化规律以及东方田鼠抗日本血吸虫的机理奠定基础.