简介:高通量测序技术速度快、成本低、通量高,广泛应用于miRNA领域研究。本研究基于高通量测序技术所产生的海量小RNA数据,结合已有的数据分析软件,开发了一套快速高效一键化的miRNA分析流程。该流程整合多个生物信息学数据分析软件,对多个miRNA高通量测序数据集进行标记、整合和去冗余分析,只需运行一次核心程序就可以实现对多个miRNA高通量测序数据的分析,避免每个样本单独数据分析的技术重复,精简后的数据集能大幅度减少软件计算量,显著提高软件运行效率。本研究利用快速高效miRNA分析流程分析黄颡鱼性腺XX卵巢、XY精巢、YY精巢的miRNA高通量测序数据,获得一批准确的黄颡鱼保守miRNA。在相同参数设置下,miRNA分析流程可以显著节约分析时间。该流程最终输出结果为多样本整合后的miRNA表达数据,便于研究者直接进行样本之间的比较和miRNA的表达差异,减少研究者手动整合分析结果的操作步骤。miRNA分析流程针对多样本miRNA测序数据具有明显的优势,样本越多测序量越大,软件运行效率越高。针对日益积累的海量小RNA测序数据,miRNA分析流程高效快速一键化数据处理优势将会越来越明显。
简介:随着养猪生产的进一步产业化,使养猪企业生产经营方式和养殖规模日趋庞大。与此同时,猪场产生的大量粪尿、废物和有机废水等给环境造成的污染问题也日益严重。如何有效利用猪场的各种废弃物,化害为利,及早防止造成环境污染,改善和保护环境,促进经济。环境和社会的协调发展,是养猪业发展过程中所面临的新问题。在经营管理中.把猪场经济系统与其它经济有机结合起来,建立一个高产,优质、高效、低耗的人工生态型畜牧场是十分必要和势在必行的。绿化是猪场环境改善最有效的手段之一,它不但对猪场环境的美化和生态平衡有益,而且对工作、生产也会有很大的促进。绿化对于建立人工生态型畜牧场,无疑将起着十分重要的补充和促进作用。
简介:本实验通过无性生殖的方法得到了花羔红点鲑肌钙蛋白(Tnc)基因,并在使用生物信息学资源和生物软件的条件下,通过CODEHOP的方法对特定的氨基酸序列设计简并引物,并对得出的结果进行同源性分析同时构建其相对系统进化树。结果表明:通过CODEHOP的方法所设计出的引物简并度较其他方法得到的引物简并度低,DNA熔解温度(Tm值)修改较方便,产物具有较强的特异性;肌钙蛋白具有高度的保守性,将肌钙蛋白基因片断做结果比对,其编码的氨基酸序列与斑马鱼同源性可达96%,与大西洋鲑Salmosalar同源性为92%,白斑狗鱼Esoxlucius同源性为92%,虹鳟Oncorhynchusmykiss同源性为91%,斜带石斑鱼Epinepheluscoioides同源性为91%,斑点叉尾鮰Ictaluruspunctatus同源性为85%。
简介:扬中四面环江,由5个不相连的小岛组成。总面积332km^2,江岸线超过120km^2。长江大堤面积228km^2,大堤外长江水域面积104km^2,其中江滩面积1667hm^2.由于江滩处于大江堤之外,长江潮汐带中间,具有重要的行洪泄洪和生态环保功能。20世纪80年代以前,我市开始对江滩资源进行开发利用,但开发的规模和效益比较低下。80年代初期,逐步加大了对江滩资源的开发力度。现总计开发江滩面积440hm^2,其中用于水产养殖面积为200hm^2,为稳定我市水产养殖面积,促进水产养殖业的结构调整,起到了不可替代的作用。为保持江滩开发的可持续发展,进一步挖掘江滩开发的潜力,根据江滩湿地自然生态特点,借鉴大水面围栏养殖技术,我们设计出了一种“深挖塘、低筑埂、高围栏”的江滩新型开发方式。该方式在最大程度上保护了江滩原有的生态环境和功能,且工程投资小,效益高。为江滩资源的综合开发利用及可持续发展提供了一种可靠的途径。本文旨在对江滩围栏养殖工程选址的原则、条件、形式以及设计的要求、建造作一简要探讨。