简介：在介绍定量结构-活性关系（QSAR）的基本原理后，重点评述了QSAR各种方法的主要原理、优缺点及其在农药设计中的研究应用进展，包括取代基多参数法（Hansch法）、Free-Wilson法、分子轨道法(MO)、距离比较法(DISCO)、比较分子力场分析法(CoMFA)、分子模拟法（MS）、分子对接法（MD）、人工神经网络法（ANN）以及Leapfrog法等。

简介：应用Cerius2软件中的遗传函数算法（GFA）和分子力场分析方法（MFA）对18个新型茉莉酸类化合物具有的对大麦和番茄的生物活性进行定量构效关系（QSAR）研究,所建模型都通过了显著性检验,交叉验证系数rC2V均大于0.810,表明模型都具有良好的预测可靠性。计算研究表明：分子的热力学性质（各种原子类型AlogP描述符）、空间结构状态（Jurs-RPSA参数）、电性描述符（Dipole-mag和HOMO）和结构描述符（HondAcceptor）是影响活性的主要二维因素。用三维QSAR方法研究了茉莉酸类化合物与其受体有效相互作用时所需的理化特征,并进一步验证了二维QSAR模型的可靠性。该研究可为进一步了解茉莉酸类化合物在植物体内的信号传导机制和研制具有生态农药性质的茉莉酸类植物生长调节剂提供理论指导。

简介：Comparativemolecularfieldanalysis(CoMFA),athreedimensionalquantitativestructure-activityrelationship(3D-QSAR)methodwasappliedtoaseriesofdiindolylmethane(DIM)analogstostudytherelationshipbetweentheirstructureandtheirinductionofCYP1A1-associatedethoxyresorufin-O-deethylase(EROD)activity.ADISCOmodelofpharmacophorewasdervedtoguidethesuperpositionofthecompounds.Thecoefficientofcross-validation(q^2)andnoncross-validation(r^2)forthemodelestablishedbythestudyare0.827and0.988respectively,thevalueofvarianceratio(F)is103.53andstandarderrorestimate(SEE)is0.044.ThesevaluesindicatethattheCoMFAmodelderivedissignificantandmighthaveagoodpredictionforthecatalyticactivityofDIMcompounds.Asaconsequence,thepredictedactivityvaluesofnewdesignedcompoundswereallhigherthanthatofthereportedvalue.

简介：利用径向基函数神经网络（RBFNN）方法对37种姜黄素类似物的化学结构与其抗利什曼原虫活性进行了定量构效关系的研究，建立了RBFNN非线性模型，得到了较高的复相关系数（R2=0.9736），说明该模型具有良好的稳定性和预测能力。

简介：研究了68个TR（ThyroidHormoneReceptor，甲状腺激素受体）配体化合物的化学结构与活性的定量构效关系．采用实验室新近提出的三维原子场全息相互作用矢量，对化合物进行了结构参数化表达，采用逐步回归对变量进行筛选后，建立了定量构效关系模型．复相关系数和交互检验复相关系数R^2=0．767，Q^2=0．625（TRα），R^2=0．734，Q^2=0．61（TRβ）．模型具有良好的稳定性和预测能力，证明了该三维原子场全息相互作用矢量在分子结构表征和生物活性预测上的适用性，并可应用于潜在和新型的TR配体化合物的设计和开发．

简介：沙粒病毒（Arenaviruses）遍布全球,其中的拉沙热病毒可引起致命的拉沙热.通过应用比较分子场分析（CoMFA）和比较相似性指数分析法（CoMSIA）对47个广谱沙粒病毒抑制剂进行了三维定量构效关系（3D-QSAR）分析.使用立体场、静电场、疏水场和氢键受体场组合获得最优模型CoMSIA的统计结果为Q2=0.518,R2ncv=0.972,R2pre=0.911,说明该模型的可靠性和较好预测能力.此外,模型等势线图直观地解释了分子结构与其活性的关系,为进一步设计新型高效的沙粒病毒抑制剂提供了理论依据.

简介：采用20种天然氨基酸的47个informationindices描述符、33个connectivityindices描述符和44个eigenvalue-basedindices描述符分别进行主成分分析,得出一种新的氨基酸描述符-SVICE.将其分别对三肽血管收缩素转化酶（ACE）、抗菌十八肽（AMP）、苦味活性二肽（BTT）序列表征后,建立结构与活性的SMR-MLR模型,并采用内外部双重验证的方法检验模型的稳定性.所建模型相关统计参量如下：复相关系数（Rcum2）、留一法（LOO）交互校验复相关系数（RCV2）和外部样本校验复相关系数（Qext2）分别为0.988,0.964,0.985;0.990,0.970和0.855;0.949,0.887,0.830.结果表明,运用SVICE描述符建立的MLR模型拟合、预测能力均较好,能较好解释肽类药物的活性与结构间的关系从而为新的强活性肽类药物的分子设计和改造提供了指导.

简介：应用Cerius^2软件中的主成分分析法（PCA）和Var．Jarvis-Patrick聚类方法对新型含噻唑和三唑环的亚胺类杂环化合物进行分类，再用遗传函数算法（GFA）和分子力场分析方法（MFA）分别进行了二维／三维定量构效关系研究（QSAR），所建模型都通过了显著性检验。CV-r^2均大于0．910，表明模型都具有良好的预测可靠性。计算研究表明：分子的热力学性质（各种原子类型AlogP描述符）、空间结构状态（Jurs参数和Shadow参数）和电拓扑状态指数（S—aaCH）是影响活性的主要二维因素。三维研究结果表明，分子的静电作用强弱对活性影响较大。最后根据药物分子设计理论设计了一系列亚胺类化合物，并用所建最优二维／三维QSAR模型进行活性预测与相互验证，筛选出活性可能较高的6个化合物。该研究可为高效亚胺类杀菌剂的研制提供理论指导。

简介：综合运用密度泛函理论、分子力学、统计学及比较分子力场分析等方法研究了抗肿瘤药物5,8-二甲基乙酰紫草素衍生物的二维（2D）、三维（3D）定量构效关系（QSAR）.所建最优2D-QSAR方程的交叉验证系数（q^2）和拟合相关系数（R^2）分别为0.618和0.736.CoMFA模型的q^2和非交叉验证系数（r^2）分别为0.703和0.982,预测相关系数R^2pred为0.746.结果表明,所建立的2D/3D-QSAR模型都具有良好的统计学意义及合理、可信的预报能力,可以预测未知化合物的活性。基于此研究结果,设计了4个具有较高抗肿瘤活性的新化合物.

简介：为提高小样本定量构效关系（QSAR）预测精度，基于支持向量机全局核函数与局部核函数提出了一种新的建模方法：先依不同核函数筛选描述符，再依保留描述符构建支持向量机回归（SVR）子模型．子模型预测活性值与实验值组成混合样本．以均方误差（MSE）最小为原则，对混合样本再次基于SVR实施核函数寻优与子模型筛选，基于最优核函数和保留子模型以留一法完成预测．对2个小样本体系的QSAR研究表明，该方法兼具局部核函数和全局核函数的优点，既有较强的学习能力，又有较好的推广能力，预测精度高，稳定性好．

简介：应用分子力学、半经验量子化学RM1方法优化了32个抗野生型HIV-1病毒毒株的二芳基嘧啶类（DAPYs）化合物分子结构，从分子构象模型中提取了多种参数并结合疏水性参数与指示性参数建立QSAR多元线性回归方程．回归方程显示：分子体积V的增大会降低其抑制活性，而左苯环与嘧啶环间二面角日增大可以提高抑制活性．同时指示性参数工表明左苯环CN基团加入可以明显增加抑制活性，嘧啶环上R1位置苯基与硝基的加入可以极大降低抑制活性．

简介：以Winmopac7软件中AM1量子化学半经验分子轨道方法计算苯酚、邻苯二酚、间苯二酚、对苯二酚和邻苯三酚的水合物的结构参数,利用多元线性回归方法研究了以上5种酚的扩散系数与其分子结构参数之间的关系.结果表明,4种苯酚衍生物的扩散系数与分子的电子能量（Ee）,分子的总偶极矩（μT）,分子的体积（Vm）有较好的相关性.其回归方程为DT=1.155×10-5＋3.675×109Ee＋4.734×10-7μT-9.28×10-3Vm,R2=0.9992SD=1.428×10-7利用此方程预测邻苯三酚的扩散系数为（2.045±0.143）×10-6cm2/s.此结果表明,AM1量子化学半经验分子轨道方法在对酚类化合物的扩散系数的研究和预测上具有可适用性,此方法也为其他有机化合物在水溶液中的扩散系数的研究和预测提供了新思路和新方法.

简介：用比较分子力场分析(CoMFA)方法对三小类1,3-氮硫杂环化合物防治芦笋茎枯病的定量构效关系进行了研究.分别研究了每一小类及综合的QSAR模型,发现对于各小类,苯环上取代基的变化影响其活性,从整体来看,影响活性的因素则集中在杂环上.所得的QSAR模型为进一步合成更高活性的化合物提供了指导.

简介：用分子对接和三维全息原子场作用矢量方法对36个来曲唑类衍生物和34个阿那曲唑类衍生物与芳香化酶的作用模式进行了研究,建立了三维定量构效关系模型,并在分子水平上阐述了其结合机制.运用多元线性回归（MLR）建模,同时采用内部及外部双重验证的办法对所得模型稳定性能进行深入分析和检验.MLR建模的复相关系数（Rcum）、留一法交互校验复相关系数（QCV）和外部样本校验复相关系数（Qext）分别为0.863,0.782,0.796和0.931,0.825和0.641.预测模型具有良好的稳定性和预测能力.采用AutoDock4.2软件对药物与受体之间的结合方式进行了研究.运用这些信息能为进一步设计合成强效芳香化酶抑制剂,或筛选潜在的具有更强抑制活性的天然化合物提供帮助.

简介：实验测定了9种硫代磷酸酯类化合物（倍硫磷、氨磺磷、氯硫磷、杀螟松、碘硫磷、皮蝇硫磷、异氯磷、甲基对硫磷、乙基溴硫磷）对斑马鱼（Brachydaniorerio）的急性毒性96h-LC50值，分别为0．95、4．52、1．95、3．03、0．85、0．56、3．44、3．44和0．82mg·L^-1，其中倍硫磷、碘硫磷、皮蝇硫磷和乙基溴硫磷属于剧毒，其他5种（氨磺磷、氯硫磷、杀螟松、异氯磷和甲基对硫磷）属于高毒．以分子电性距离矢量（MEDV-13）有效表征硫代磷酸酯类化合物的分子结构，应用基于预测的变量选择与模型化（VSMP）方法建立急性毒性（-lgLC50）与分子结构（MEDV-13）的定量相关模型，模型的估计相关系数为0．9922，LOO检验相关系数为0．9796，表明模型具有良好的估计能力与稳健性．影响急性毒性的主要结构因素是由2个MEDV描述子表达的3个子结构碎片，即-CH3、-cCc和≥N=.其中子结构-CH3、-cCc与硫代磷酸酯类化合物母体骨架密切相关，而≥N=则反映取代基的变化．

简介：采用新型的的三维原子场全息作用矢量（3D—HoVAIF）研究了200种芳香化合物的化学结构与其生物毒性的定量构效关系（QSAR）．首先对芳香化合物进行了结构参数化表达，然后采用逐步回归（SMR）对变量进行筛选，建立了三维定量构效关系模型．其87个无氢键分子的模型和113个有氢键分子的模型的复相关系数和标准偏差分别为R2=0．801，SD=0．473和R2=0．929，SD=0．318．模型具有良好的稳定性和预测能力，证明了该三维原子场全息作用矢量在分子结构表征和生物毒性预测上的适用性．

简介：分别采用人工神经网络BP算法（网络结构为3-9-1）和线性回归分析方法对17个4-X-N-Y-6-氮杂雄-4-烯-3-酮衍生物在4℃时与小牛子宫雌激素受体的亲合力参数Iog1/K（iKi为衍生物对3BHSD的抑制常数）与分子的范德华体积V、最高被占据分子轨道能量EHOMO和9号碳原子的净电荷Q之间建立了QSAR模型,ANN模型的相关系数R=0.9999,标准偏差SD=0.0014。MLR模型的相关系数R=0.9470,标准偏差SD=0.4459。结果表明人工神经网络是一种比较精密的拟合方法,具有良好的预测效果。

简介：作为参与调控细胞生理功能的关键因子的c-JunN-末端激酶,与多种人类疾病的发生发展密切相关。本文运用低能构象搜索及分子对接方法得到的两组构象,对N-苯甲基靛红肟类化合物进行三维定量构效关系（3D-QSAR）研究。结果表明,基于分子对接构象,以立体场、静电场、氢键供体场和氢键受体场组合得到的CoMSIA模型最佳,相应的统计学参数：交叉验证相关系数q2为0.759,相关系数r2为0.966,测试集的相关系数r2pred为0.703。根据RB方法所得到的CoMSIA模型的三维等值线图,总结出对抑制剂活性起关键作用的因素：化合物的N取代基及R6位处于残基Ile70、Asp150、Ala151、Asn152和Ser193组成的疏水性空腔,因此引入体积较大的取代基有利于活性的提高,同时在N取代基上加以吸电子或氢键受体基团的取代将有助于提高抑制剂活性。靛红环位于负电荷残基Glu147附近,引入供电子或氢键供体基团有利于抑制剂活性的提高。同时结果之间可以相互解释并验证彼此的有效性,可为设计高特异性高活性的JNK3抑制剂提供线索和参考。

简介：Methetraxate(MTX),aclassicaldihydrofolatereductaseinhibitor,wasasuccessfulclinicalantitumoragent,havingpotentinhibitoryactivitiestoseveralkindsoftumors.Unfortunately,thecancercellkswereeasiertoproduceresistancetoMTXwhichendedinthefailureofchemotherapy.Inordertoovercometheresistanceoftumorcells,anewkindofdihydrofolatereductaseinhibitorscallednonclassicalantifolateincludingtriazines,pyrimidinesandquinazolinesweredesignedandsynthesized.Becauseofthedifferentantitumormechanismsbetweenthetwokindsofcompunds,thecancercellsresistanttoMTXmaystillbesensitivetothenonclassicalantifolate.Accordingtothistheory,somenonclassicalantifolate2,4-diamino-5-methyl-6-(substitutedbenzylamino)quinazolineswiththegeneralstructureshowninFIg.1weresynthesizedandtheirantitumoractivitiesweredeterminedinthisthesis.

简介：ＳｔｕｄｉｅｓｏｎｔｈｅＳｙｎｔｈｅｓｉｓ，ｔｈｅ２Ｄａｎｄ３ＤＱＳＡＲＡｂｏｕｔＬｉｐｏｐｈｉｌｉｃＡｎｔｉｆｏｌａｔｅ２，４Ｄｉａｍｉｎｏ５ｍｅｔｈｙｌ６（ＳｕｂｓｔｉｔｕｔｅｄＢｅｎｚｙｌａｍｉｎｏ）ＱｕｉｎａｚｏｌｉｎｅＣｏｍｐ...