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  • 简介:通过研究蛋白蛋白作用,从而更好地对蛋白功能进行注释,甚至应用于药物开发,是蛋白组学的主要任务之一.人类基因组的大规模测序和其他各种高通量的生物技术的采用为蛋白质调控网络的研究创造了条件.本文回顾了近年来生物信息学在蛋白蛋白作用方面取得的最新研究成果,对各种计算方法进行了比较,并对该领域今后的发展方向做了预测.

  • 标签: 蛋白与蛋白相互作用 计算生物学 蛋白调控网络
  • 简介:猪繁殖呼吸综合征病毒(PRRSV)核衣壳(N)蛋白在病毒粒子组装和释放过程中发挥重要的作用。为筛选N蛋白宿主细胞相互作用蛋白,本研究分离健康猪肺泡巨噬细胞(PAM),构建了PAM的酵母cDNA文库,利用酵母双杂交方法筛选其中PRRSVN蛋白作用蛋白,结果获得3个阳性克隆。

  • 标签: 猪繁殖与呼吸综合征病毒 蛋白相互作用 N蛋白 猪肺泡巨噬细胞 鉴定 CDNA文库
  • 简介:在模拟生理条件下,采用分子荧光、紫外光谱法研究了水溶液中Cd2+牛血清蛋白(BSA)的相互作用.研究表明,在pH=7.0缓冲液中,以280nm作为激发波长,342nm作为发射波长,Cd2+对BSA的荧光发射有较强猝灭作用.实验测定了Cd2+BSA在289K,306K和319K温度下的结合常数Ka分别为5.31×10^4,5.22×10^4,4.70×10^4,其热力学参数ΔHm=-3.07kJ·mol-1;ΔSm=79.83J·mol-1·K-1.结果表明导致BSA荧光猝灭是由于分子内的非辐射能量转移而引起的静态猝灭,他们之间的主要作用力是静电作用力.

  • 标签: 蛋白相互作用 牛血清蛋白 分子光谱 镉(Ⅱ) 非辐射能量转移 静电作用力
  • 简介:采用紫外-可见吸收光谱、圆二色谱和荧光光谱等方法对一系列阳离子卟啉牛血清白蛋白相互作用情况进行了研究.研究表明,阳离子卟啉通过静电引力牛血清白蛋白(BSA)作用,作用位点位于BSA表面.较高的正电荷有利于增强卟啉BSA的作用力.

  • 标签: 阳离子卟啉 BSA 静电引力
  • 简介:目的研究不同酸度条件下,加替沙星牛血清白蛋白之间的相互作用.方法采用荧光光谱和紫外光谱法进行研究.结果运用荧光猝灭双倒数图计算了在不同条件下二者的结合常数K,根据Foster非辐射理论计算在正常生理条件下二者的结合距离r,并通过热力学参数确定了二者的作用力类型.结论加替沙星牛血清白蛋白之间有较强的相互作用,以电荷作用力为主.

  • 标签: 荧光猝灭 牛血清 血清白蛋白 加替沙星 紫外光谱法
  • 简介:采用荧光光谱法研究了水溶液中四溴荧光素、四氯四溴荧光素、二碘荧光素、乙基罗丹明B、健那绿B等5种荧光染料探针牛血清白蛋白(BSA)的相互作用.实验表明,这5种染料探针同牛血清白蛋白结合时,疏水作用力起决定性作用,静电力起次要作用,相比之下牛血清白蛋白(BSA)结合阴离子的能力最强,其次为中性分子,最后为阳离子.通过疏水作用力,5种染料均是以非极性苯基进入BSA疏水性腔体中同色氨酸残基发生作用,弱氢键的形成加强了这种作用力,且使得光谱间能量转移效率明显提高.5种染料探针的极性部位由于极性和空间效应的原因难以进入腔体内部,致使反应均按接近1∶1的方式进行.

  • 标签: 荧光染料探针 牛血清白蛋白 荧光 反应机理
  • 简介:摘要在pH=7.0,t=37℃条件下,采用荧光光谱和紫外可见-吸收光谱研究了β-紫罗兰酮β-乳球蛋白相互作用。研究的结果表明这种相互作用使β-乳球蛋白发生内源荧光猝灭,其机制为静态猝灭。通过计算得到了两者的结合常数(k=0.605×103L/mol)和结合位点数(n=1)。

  • 标签: &beta -紫罗兰酮 &beta -乳球蛋白 荧光猝灭 同步荧光谱 紫外可见-吸收光谱
  • 简介:在长期进化中,植物形成了抵御病毒等病原微生物侵染的精细防御系统。在病毒侵染、复制和传播过程中,其编码的一些蛋白,如外壳蛋白、运动蛋白、复制酶类等能够植物基因编码的蛋白发生相互作用。酵母双杂交系统是体外研究蛋白质间相互作用的有利工具,不但可以用于研究已知蛋白质的互作,还可以发现新蛋白,揭示特定蛋白互作网络作用机制,在植物蛋白病毒蛋白互作研究中已得到广泛的利用。本文主要综述利用酵母双杂交系统研究植物病毒蛋白作用的国内外进展。

  • 标签: 酵母双杂交 植物 病毒
  • 简介:利用酵母双杂交技术和双分子荧光互补(BiFC)技术,对控制花器官发育的B类蛋白,即PPI(GenBank登录号:GU812176)两个AGAMOUS-like蛋白即已被分别命名的PAGl(Capana02g001695)和PAG2(Capana07g001940)间的互作关系进行了研究。结果表明,PPI蛋白PAG1和PAG2蛋白均存在特异性相互作用,说明辣椒花器官发育过程中尸州蛋白可能与PAGl和PAG2形成蛋白复合体,共同控制雄蕊的发育。这有助于进一步揭示辣椒雄蕊发育的分子机理。

  • 标签: 辣椒 PPI PAG1 PAG2 酵母双杂交 双分子荧光互补
  • 简介:摘要许多疾病是由于信号转导通路分子发生功能障碍所导致的,后基因组时代可以通过对这些分子进行调控来控制信号转导通路,达到治疗和预防疾病的目的。EGFR是哺乳动物细胞中参与生长、增殖和分化通路中的重要信号分子,本文以乳腺癌作为研究对象,采用功能-网络-通路的思路对EGFR信号分子功能、相互作用网络及其参与的通路进行分析。

  • 标签: EGFR 蛋白相互作用网络 信号通路
  • 简介:运用荧光光谱对酒石酸美托洛尔牛血清蛋白(BSA)之间的相互作用进行了研究.实验结果表明:酒石酸美托洛尔对BSA的内源荧光有较强的猝灭作用,猝灭机制为动态猝灭.测定了酒石酸美托洛尔BSA在不同温度下的表观结合常数Ksv,Ksv分别为2.271×10~5、3.698×10~5、5.923×10~5.同时也测定了两种物质分子之间的结合常数结合位点数,其中不同温度下酒石酸美托洛尔BSA的结合位点数都约为1,说明酒石酸美托洛尔BSA有单一的结合位点且受温度影响较小.在酒石酸美托洛尔BSA的作用过程中反应的焓变ΔH〉0、熵变ΔS〉0,说明酒石酸美托洛尔BSA之间的主要相互作用为疏水作用力;吉布斯自由能ΔG〈0,表明结合过程是一个熵增加、吉布斯自由能降低的自发过程.

  • 标签: 生物医学光子学 酒石酸美托洛尔 牛血清白蛋白 荧光光谱 紫外吸收光谱
  • 简介:摘要:在本实验室条件下,指导本科生毕业论文实验。通过对“甲硝唑牛血清白蛋白作用研究”这一课题的教学,发现同学们在实验过程中能够展现出良好的实验热情,但也暴露出一下问题,如缺乏实验耐性、操作不规范、实验数据记录不完整等。这与老师的管理和学生的科研素质都有一定的关系。笔者根据自己的实验教学经验,反思实验实践过程中的不足之处,提出应对措施,为以后获得更好的教学效果打下基础。

  • 标签: 本科论文 教学反思 甲硝唑 牛血清白蛋白 荧光光谱
  • 简介:为了探究口含烟烟碱(NIC)在人体胃部的吸收特性,配制了特定浓度的柠檬酸-柠檬酸钠缓冲溶液使其pH=2.0,并在该条件下配制不同浓度的烟碱溶液样品,随后用该样品作用于胃蛋白酶,利用多种光谱学方法(分子荧光光谱、紫外光谱、红外光谱、圆二色谱)和分子模拟对接技术观察添加不同浓度烟碱前后胃蛋白酶的光谱学变化,初步研究了NIC蛋白酶(Pepsin)相互作用机理。光谱学分子模拟对接结果表明:1)NICPepsin之间为静态荧光猝灭机制;2)NICPepsin之间通过氢键和范德华力自发的发生相互作用;3)NICPepsin之间存在着一个高亲和力的结合位点;4)NIC和Pepsin之间的相互作用不仅使Pepsin中氨基酸残基的微环境极性增加,同时使得Pepsin多肽链的C=O、C-N和N-H发生了变化,进而导致Pepsin的构象和空间结构发生变化,同时NIC的加入对Pepsin活性呈明显的增强效应。以上研究结果对口含烟产品开发、质量控制和安全评价具有重要理论意义。

  • 标签: 烟碱 胃蛋白酶 光谱学 分子对接 作用机理
  • 简介:摘要目的通过蛋白作用网络探讨糖尿病靶点新型冠状病毒(2019-nCoV)受体血管紧张素转换酶2(ACE2)的关系,为临床用药提供新思路。方法从GeneCards、OMIM数据库获取糖尿病靶点,将关联分数超过10的靶点纳入,并手动添加ACE2蛋白。通过String获取初始蛋白作用关系网络,将其导入Cytoscape3.7.1软件,筛选出ACE2直接相关的蛋白靶点作为最终分析的靶标,再次导入String,得到待分析蛋白作用关系网络,并对其进行模块识别及GO分析和KEGG通路分析。通过对ACE2所在模块评分,分析其对整个网络的影响。结果最终从糖尿病靶点中筛选得到19个ACE2相关蛋白,通过聚类分析发现3个功能模块,模块涉及G蛋白藕联受体结合、抗氧化剂活性、胰岛素样生长因子受体结合等生物过程,主要涉及的信号通路有肾素-血管紧张素系统信号通路、2型糖尿病信号通路,以及FOXA2信号通路。评分结果显示,模块1内REN、AGT、INS、NOS3、IL6、CRP的评分最高。结论ACE2糖尿病关键蛋白有广泛的联系,COVID-19可能冲击糖尿病患者RAS,导致糖尿病合并COVID-19患者的高死亡率,临床可考虑使用RAS抑制剂减轻COVID-19感染对糖尿病患者的影响。

  • 标签: COVID-19 糖尿病 蛋白相互作用网络 RAS DPP4
  • 简介:顺铂淬灭红细胞膜蛋白的内源性荧光存在浓度依赖关系,这种性质可用以测定铂蛋白作用程度,在氯离子和硫酸根存在下,顺铂的淬灭作用减弱,二者作用pH有关,低pH条件作用较强,根据顺铂对醋酸汞荧光素标记膜蛋白的荧光的影响,认为铂蛋白巯基结合,基于共存阴离子的影响,讨论了顺铂-膜蛋白可能的反应机制。

  • 标签: 顺铂 红细胞 膜蛋白 相互作用 荧光分光光度法
  • 简介:摘要尿酸的重吸收和排泄依赖尿酸转运蛋白作用,人体内尿酸转运蛋白数目众多,如葡萄糖转运蛋白9(GLUT9)、有机阴离子转运体1(OAT1)、尿酸盐转运蛋白1(URAT1)等,但单一尿酸转运蛋白的错义翻译很少直接导致高尿酸血症的发生,尿酸转运蛋白相互作用蛋白,如跨膜整合蛋白2B(ITM2B)、乙醛脱氢酶16家族A1(ALDH16A1)、PDZ结构域蛋白1(PDZK1)等在高尿酸血症的发生、发展过程中同样有着举足轻重的地位。因此不仅仅研究单一尿酸转运蛋白的错义翻译,同时关注尿酸转运蛋白及其相互作用蛋白在尿酸代谢中的作用,有利于更加深入了解高尿酸血症的发病机制。

  • 标签: 高尿酸血症 尿酸转运蛋白 蛋白质相互作用
  • 简介:摘要:关键蛋白质是这样的蛋白质:如果被删除,就会导致细胞死亡或不育。关键蛋白质的识别对于理解维持生命的基本要求是非常重要的。此外,对关键蛋白的全面分析有助于深入理解基因突变与人类疾病之间的关系,从而揭示人类疾病的一般规律。实验方法预测关键蛋白质不仅价格不菲,而且很耗时。已经提出了多种基于蛋白相互作用网络识别关键蛋白质的计算方法。本文概述了关键蛋白质的研究现状,并进行了展望。首先分类介绍了现有的关键蛋白质识别方法,然后介绍了关键蛋白质识别有关的数据集。最后,对关键蛋白质识别面临的挑战和未来研究进行了展望。

  • 标签: 蛋白质相互作用 关键蛋白质 中心性 基因表达
  • 简介:目的:筛选癌性锚蛋白重复序列(Gankyrin)相互作用蛋白。方法:构建诱饵(Bait)质粒pGB-Psmd10-1,采用β-半乳糖苷酶滤膜分析检测其自身转录活性,以Bait质粒筛选人Hela细胞MATCHMAKERcDNA文库,共转染重复验证阳性克隆,并测序鉴定。结果:成功构建Bait质粒,经验证对报告基因LacZ无自激活作用。以Bait质粒筛选人Hela细胞cDNA文库,获得83个克隆,其中5个克隆经重复验证确定为阳性克隆,测序结果显示其cDNA为Psmc4的3段不同剪接体(NM_006503.2,NM_153001.1)。结论:在人Hela细胞中,Psmc4为Cankyrin相互作用蛋白

  • 标签: 癌性锚蛋白重复序列 酵母双杂交 Psmc4 HELA细胞
  • 简介:摘要烟碱受体(nAChRs)是乙酰胆碱在体内的主要受体之一,为兴奋型跨膜阳离子通道,在神经系统和非神经系统中都具有重要的生理功能,也被证实多种疾病相关,因此对其结构和功能的研究非常必要。已知烟碱受体蛋白的细胞内环在调控其细胞内代谢下游信号转导方面起到主要作用,然而这段蛋白序列的结构和功能目前仍然不明确。针对烟碱受体细胞内相互作用蛋白的研究现状进行总结,旨在通过其互作蛋白及互作位点信息为进一步探讨烟碱受体细胞内环的结构功能特点以及临床靶向提供思路。

  • 标签: 烟碱受体 细胞内环 互作蛋白 功能位点
  • 简介:研究植物单宁-蛋白质的相互作用在制革、医药等方面具有很重要的意义,而计算机模拟技术和理论在相关的研究中得到广泛的应用.本文综述了单宁-蛋白质反应的机理和分子模拟及理论计算中常用的方法,并展望了其应用前景.

  • 标签: 植物单宁 蛋白质 计算机模拟 相互作用 制革 皮革