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  • 简介:摘要评估longinterspersednuclearelementtype1(LINE-1)去甲基水平作为肝癌风险检测指标的有效性。通过检索文献数据库,使用随机效应模型和亚组分析对LINE-1去甲基水平进行评估。纳入的7项研究2135例样本中,肝癌的LINE-1去甲基水平显著高于对照组,组织和血液样本分析显示LINE-1的去甲基水平存在差异,其中,血液样本间存在显著差异。不同的检测法研究显示LINE-1的去甲基水平存在差异。研究仅对样本来源和检测方法与肝癌LINE-1去甲基进行分析,为不同样本来源和检测方法分析LINE-1甲基提供了新证据。

  • 标签: 肝癌,长散布核元件,甲基化 Meta分析
  • 作者: 刘芳远 冯学敏 季晓磊 苏秀兰
  • 学科: 医药卫生 >
  • 创建时间:2022-12-13
  • 出处:《中华肝脏病杂志》 2022年第09期
  • 机构:内蒙古医科大学附属医院临床医学研究中心,呼和浩特 010010 内蒙古大学生命科学院,呼和浩特 010010 内蒙古医学细胞生物学重点实验室,呼和浩特 010010,内蒙古医科大学附属医院临床医学研究中心,呼和浩特 010010,内蒙古医科大学附属医院感染科,呼和浩特 010010,内蒙古医科大学附属医院临床医学研究中心,呼和浩特 010010
  • 简介:摘要目的基于m6A甲基调节基因对肝癌进行聚类分型并构建模型评估预后风险。方法基于13个m6A甲基调节基因在肝癌中的表达情况,使用一致性聚类分析对来自TCGA数据库的肝癌患者进行分型,并对所得亚型的功能和预后意义进行研究。进一步筛选标记基因构建风险预测模型,用于评估肝癌患者的预后。结果基于m6A甲基调节基因进行分型所得到的2个亚组在肝癌患者预后方面差异具有统计学意义(P=0.048),并在预后较差的亚组中筛选得到了38个在肝癌中与m6A甲基相关的预后标志物;利用单因素cox分析鉴定出2个与肝癌不良预后有关的m6A调节基因:YTHDF1和YTHDF2(风险比>1,P<0.05);通过Lasso回归构建了风险预测模型能够有效预测肝癌患者4年内的预后状态(4年和3年的曲线下面积分别为0.685、0.669),并使用来自亚洲肝癌患者的数据集对该模型进行了验证。结论此研究为基于m6A甲基肝癌诊断和治疗提供新思路,且风险预测模型可以用于评估肝癌患者的短期预后情况。

  • 标签: 肝癌 甲基化 评估模型 N6-甲基腺苷 聚类分析
  • 简介:表观遗传学的研究表明,脑肿瘤细胞中某些基因的高甲基可以用来标记肿瘤预后,甲基后的沉默产物可作为化疗反应的生物标记分子,而对DNA甲基抑制剂的研究已成为肿瘤治疗的新方向。总之,在脑肿瘤的发生和发展中。DNA甲基起着重要的作用。本文总结了肿瘤甲基方面的最新进展。

  • 标签: 脑肿瘤 DNA甲基化抑制剂 表观遗传学 肿瘤预后 高甲基化 肿瘤细胞
  • 简介:包括靶向性治疗在内的新疗法已使癌症患者的整体生存期有所延长,但对晚期恶性肿瘤患者而言,治愈率并无改善。缺乏检出早期癌症的能力是其根本原因。此外,目前应用的肿瘤临床分期和分型方法不能满足临床肿瘤治疗有效性评估的需求。因此,建立、整合包括肿瘤行为在内的表观遗传学病理机制新理念,并提出肿瘤分期和分型系统新标准实属当务之急。

  • 标签: DNA甲基化 生物标志物 癌症 诊断 表观遗传学
  • 简介:摘要乳腺癌是女性最常见的恶性肿瘤之一,也是导致女性癌症患者死亡的第二大凶手。近几年,我国乳腺癌的发病率逐年升高,并且患病年龄呈低龄趋势。乳腺癌发病机制复杂,与多种因素有关,如年龄、家族史和基因变异。随着表观遗传学的发展,DNA的修饰在乳腺癌发生发展中有着重要的作用。文章对DNA甲基及羟甲基在乳腺癌中的研究进行综述。

  • 标签: 乳腺肿瘤 DNA甲基化 羟甲基化 分子生物学
  • 简介:为探索有效分离两样品间差异甲基片段的方法,以DNMT1(DNAmethyltransferase1,DNMT1)表达抑制前后的肝癌细胞系7721-sMT1和7721-pMT1为研究对象,结合消减杂交和磁珠分离的方法,在两细胞系全基因组DNA范围内进行扫描差异性甲基片段;将这些片段进行生物信息学分析,发现所获38条差异甲基片段分布于不同的染色体上,但集中于重复序列、基因的启动子区,此特点符合DNA甲基位点分布规律.实验结果证明消减杂交结合磁珠分离的方法,能筛选出两样品间的差异甲基片段,该方法的建立为筛选肿瘤细胞中特异性差异甲基片段作为肿瘤诊断的标志物提供了可能性.

  • 标签: 消减杂交 DNA甲基化 差异甲基化片段 表观遗传学 CPG岛 DNMT
  • 简介:DNA甲基在胶质瘤的发生、发展中起重要作用。多条重要通路相关基因启动子区域的CpG岛甲基,其甲基发生频率与胶质瘤的发生发展、组织类型和病理分级密切相关。某些基因的DNA甲基可为胶质瘤的早期诊断提供分子生物学标志物,同时由于DNA甲基具有可逆性,可以为胶质瘤基因治疗提供新的靶点,还可以用来评价预后。

  • 标签: 神经胶质瘤 DNA 甲基化
  • 简介:摘要目的运用基因芯片技术筛查与黑素瘤相关的DNA异常甲基位点,初步构建黑素瘤特异性甲基谱。方法采用Illumina Human Methylation 450K全基因组甲基芯片对6例黑素瘤组织及其瘤旁组织标本进行全基因组DNA检测,得出差异DNA甲基位点。采用Gene Ontology(GO)富集分析及KEGG_Pathway分析了解基因功能。结果基因芯片检测结果显示,黑素瘤组织与瘤旁组织存在差异甲基位点,共27 779个,其中16 673个为高甲基位点,11 106个低甲基位点。提高筛选条件为P < 0.01、︳Δβ︳> 0.2,过滤掉所有单核苷酸多态性相关探针、位于XY染色体上的探针以及交叉反应的探针,共筛选得到4 883个差异甲基位点,其中1 459(30%)个位于启动子区(包括TSS1500、TSS200、5′UTR、1st Exon)。GO富集分析显示,差异甲基基因参与的生物学过程主要包括细胞生长、分化、黏附、运动迁移、信号转导及转录调控等。KEGG_Pathway分析显示,差异甲基基因主要参与黏着斑、癌症通路、转化生长因子β信号通路、磷脂酰肌醇信号通路、黑素生成、趋化因子信号通路、黏合连接、钙信号通路、细胞黏附分子、MAPK信号通路、Wnt信号通路、JAK-STAT信号通路。基于"启动子区高甲基位点对应的前16个基因、出现甲基频率最高(CpG位点≥ 7)的基因、具有一定的功能或参与某条信号通路"条件,选出8个基因(KAAG1、DGKE、SOCS2、TFAP2A、GNMT、GALNT3、ANK2、HOXA9)作为黑素瘤候选生物标志物。结论黑素瘤组织存在较多高甲基基因,8个差异甲基基因有可能作为黑素瘤的生物标志物。

  • 标签: 痣和黑素瘤 表观基因组学 DNA甲基化 芯片分析技术 生物学过程 信号通路
  • 简介:目的探讨p73基因异常甲基在非霍奇金淋巴瘤(non—Hodgkin’slymphomas,NHL)中的分布,去甲基p73基因的再表达。方法采用甲基特异性PCR(Methylationspecificpolymerasechainreaction,MSP)方法检测22例非霍奇金淋巴瘤p73基因CpG岛甲基状态。使用反转录PCR(Reversetransoriptionpolymerasechainreaction,RT-PCR)方法检测CdR药物作用前后P73基因mRNA的表达情况。结果非霍奇金淋巴瘤p73基因甲基的发生率为27.3%(6/22),高度恶性比低度恶性更易发生甲基,其发生率分别为42.8%和0%,5-杂氮-2’.脱氧胞嘧啶(5-aza-2’-deoxycytidine,CdR)在4.0~8.0μmol/L时可诱导非霍奇金淋巴瘤细胞p73去甲基。结论p73基因甲基可能是非霍奇金淋巴瘤发病的原因之一,去甲基治疗是可行的。

  • 标签: P73基因 甲基化 去甲基化 MSP RT-PCR
  • 作者: 吴汉生 黄树杰 庄伟涛 丁宇 高枕 乔贵宾
  • 学科: 医药卫生 >
  • 创建时间:2021-06-25
  • 出处:《国际肿瘤学杂志》 2021年第04期
  • 机构:汕头大学医学院第一附属医院胸外科 515041 广东省人民医院(广东省医学科学院)胸外科,广州 510000 南方医科大学第二临床学院,广州 510515,广东省人民医院(广东省医学科学院)胸外科,广州 510000 汕头大学医学院临床系 515031,广东省人民医院(广东省医学科学院)胸外科,广州 510000
  • 简介:摘要N6-甲基腺嘌呤(m6A)甲基修饰的生物学作用已被逐渐深入研究,在肿瘤中显示出越来越高的价值。近年来,随着对表观遗传学在RNA修饰方面的深入研究,诸多研究表明m6A甲基修饰在肺癌的发生与发展中发挥了重要作用。m6A相关修饰蛋白具有成为肺癌临床诊治靶标的潜在应用价值。

  • 标签: 肺肿瘤 m6A RNA甲基化
  • 简介:摘要DNA甲基是表观遗传修饰最基本的方式,在维持正常细胞功能、胚胎发育和肿瘤发生、动脉粥样硬化中起着重要的作用,是当前学术研究的重点和热点。随着研究的深入,各种各样的甲基检测方法被开发出来同时在临床应用也初见端倪,甲基的深入研究必将对人类健康产生深远的影响。

  • 标签: 表观遗传 DNA甲基化 PCR 检测 重亚硫酸盐 单亲遗传病 肿瘤 动脉粥样硬化 老化
  • 简介:DNA甲基与衰老的研究是近20a来分子生物学研究的热点之一。本文综述了近年来国内外文献,概括DNA甲基理论研究进展,探讨影响甲基与衰老的主要因素,以揭示两者之间可能存在的联系,并分析了与甲基和衰老相关疾病的发生机制。

  • 标签: 衰老 DNA甲基化 基因
  • 简介:目的研究环境内分泌干扰物邻苯二甲酸二(2-乙基已基)酯[Di—(2-ethylhexy)phthalate,DEHP]作用于孕鼠后,胎鼠睾丸组织基因组DNA甲基水平的变化及3种DNA甲基转移酶的表达情况;探讨DEHP所致表观遗传修饰改变在睾丸下降过程中的作用。方法妊娠昆明小鼠(KMmice)随机分为3组,即正常对照组、玉米油对照组和DEHP实验组,每组15只。玉米油对照组和DEHP实验组自妊娠第12.5天到妊娠第18.5天分别持续经口予以玉米油和DEHP,用量按每日500mg/kg,正常对照组不予灌药。采用高效液相色谱仪检测基因组DNA甲基水平,实时荧光定量PCR检测3种DNA甲基转移酶的表达量。结果正常对照组和玉米油对照组DNA甲基水平和3种甲基转移酶的表达均无统计学意义(P〉0.05):DEHP实验组DNA甲基水平比对照组增高约10%。与对照组相比,差异有显著统计学意义(P〈0.05);实验组3种甲基转移酶的表达量均比对照组高,与对照组相比,差异有显著统计学意义(Dnmt1,P〈0.05;Dnmt3a,P〈0.01;Dnmt3b,P〈0.05)。结论环境内分泌干扰物DEHP通过影响3种甲基转移酶的表达而导致基因组DNA甲基水平升高,从而抑制睾丸下降过程中多种基因的表达,发生隐睾。DNA甲基等表观遗传学修饰的改变可能是DEHP诱发隐睾的分子机制之一。

  • 标签: DNA甲基化 转移酶类 二乙基已基邻苯二甲酸/免疫学 隐睾
  • 简介:摘要:目的:观察原发性肝癌患者甲基酶( Methylase)、甲基 CPG结合蛋白 2( MECP2)蛋白的表达差异,以及西藏麻黄提取液对肝癌甲基蛋白和 Wnt通路蛋白表达的影响。方法:①人体组织标本研究:留取 65例初诊为原发性肝癌患者手术组织,分为肝癌组;依据 BCLC分期,分为 A期和 B期;根据肿瘤体积,分为单发组和多发组;根据瘤体的大小,分为 >5cm组和 <5cm组;对照组选取 52例慢性肝炎患者。②肝癌细胞株 SM7721细胞实验研究,观察麻黄提取液和 5-氟尿嘧啶对肝癌细胞的抑制作用。采用蛋白质印迹法( West Blot)检测 Wnt通路( FOS、 Wnt6、 Wnt10)蛋白表达情况;双抗体夹心法测定血清甲基酶( Methylase)和甲基 CPG结合蛋白 2( MECP2)的表达情况。结果:①人体组织标本研究结果表明:肝癌组较对照组 Methylase升高,差异无统计学意义( P=0.057); BCLC分期 B期、多发组、 >5cm组与对照组比较,差异均有显著性( P=0.048、 0.042、 0.045); MECP2多发组与对照组比较,差异有统计学意义( P=0.041)。②肝癌细胞株 SM7721细胞实验研究结果:麻黄组 Methylase低于肝癌组及 5-FU组,差异有统计学意义( P=0.047)。麻黄组 MECP2低于肝癌组,差异有统计学意义( P=0.046)。麻黄对 Wnt通路蛋白表达发现,麻黄组 FOS、 Wnt6、 Wnt10蛋白表达均下降,与肝癌组比较,差异有统计学意义( P=0.041、 0.045、 0.037),其中 Wnt10,麻黄组与 5-FU比较,差异有统计学意义( P=0.043)。结论:麻黄提取液可以显著降低 Methylase、 MECP2表达,该机制可能与 Wnt信号通路的 FOS、 Wnt6、 Wnt10蛋白改变密切相关。

  • 标签: 西藏麻黄 原发性肝癌 甲基化蛋白表达 Wnt信号通路 抗肿瘤作用
  • 简介:大肠癌是常见消化道恶性肿瘤,近年发病率有上升趋势。迄今,大肠癌的确切发病机制仍不十分清楚,随着分子生物学技术的发展和广泛应用,大肠癌的分子遗传学特征已逐渐被人们所了解。目前,普遍认为大肠癌发病是一个涉及多基因多步骤的复杂过程,多个癌基因激活和抑癌基因失活的致癌模式逐渐为人们所认识。在肿瘤的发生发展中一系列肿瘤抑制基因通过突变和染色体缺失而失活,CpG岛甲基畸变近来被认为是肿瘤中抑癌基因改变的途径之一。近年来的研究表明,大肠癌相关抑癌基因因CpG岛异常甲基而失活在肿瘤的发展过程中起重要作用,而且是肿瘤发生的早期事件,其检测有助于肿瘤的早期诊断,评价肿瘤的发展及预后,对指导临床工作有重要意义。本文就抑癌基因甲基与大肠癌的关系作一综述。

  • 标签: 抑癌基因 大肠癌 发病机制 分子生物学 甲基化 肿瘤分期
  • 简介:DNA甲基属于一种表观遗传修饰,主要发生在CpG双核苷酸序列中的胞嘧啶上,是在DNA甲基转移酶催化下,以S-腺苷甲硫氨酸为甲基供体,将甲基转移到胞嘧啶上,生成5-甲基胞嘧啶的一种反应。DNA甲基在植物生长过程中具有极其重要的作用。综述了植物DNA甲基的特征、调控机制,及其对植物基因表达影响的研究进展。

  • 标签: DNA甲基化 植物发育 调控
  • 简介:摘要慢性阻塞性肺疾病(COPD)是一种年龄和吸烟相关的进行性肺疾病,由于慢性支气管炎和肺气肿的影响,呈现出不可逆性气流的受限。COPD的发病率和死亡率不断增加,但是并没有有效的治疗策略。DNA甲基是目前研究中备受关注的表观遗传学调控机制,与COPD的发生与发展密切相关。因此,针对DNA甲基进行治疗可能存在重要的临床价值。

  • 标签: 慢性阻塞性肺病(COPD) DNA甲基化 吸烟 治疗