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  • 作者: 李思其 高兴林
  • 学科: 医药卫生 >
  • 创建时间:2021-10-10
  • 出处:《中华结核和呼吸杂志》 2021年第10期
  • 机构:南方医科大学 广东省人民医院 广东省医学科学院 广东省老年医学研究所呼吸与危重症医学科,广州510080,广东省人民医院 广东省医学科学院 广东省老年医学研究所呼吸与危重症医学科,广州510080
  • 简介:摘要机体的免疫功能与肿瘤的发生发展密切关联,一方面,机体可以通过免疫效应机制,包括固有免疫和特异性免疫,发挥抗肿瘤作用;另一方面,肿瘤细胞通过免疫逃逸机制逃避免疫系统的识别和清除。越来越多的证据表明表观遗传调控在实体肿瘤免疫调节中占有重要地位,其中,DNA甲基作为目前研究最久、最深入的表观遗传机制,除了促进肿瘤的恶性转化,也影响机体免疫细胞对肿瘤的免疫应答。本文主要针对DNA甲基对实体肿瘤免疫反应的调节作用进行阐述。

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  • 简介:摘要乳腺癌是女性最常见的恶性肿瘤之一,也是导致女性癌症患者死亡的第二大凶手。近几年,我国乳腺癌的发病率逐年升高,并且患病年龄呈低龄趋势。乳腺癌发病机制复杂,与多种因素有关,如年龄、家族史和基因变异。随着表观遗传学的发展,DNA的修饰在乳腺癌发生发展中有着重要的作用。文章对DNA甲基及羟甲基在乳腺癌中的研究进行综述。

  • 标签: 乳腺肿瘤 DNA甲基化 羟甲基化 分子生物学
  • 简介:摘要目的运用基因芯片技术筛查与黑素瘤相关的DNA异常甲基位点,初步构建黑素瘤特异性甲基谱。方法采用Illumina Human Methylation 450K全基因组甲基芯片对6例黑素瘤组织及其瘤旁组织标本进行全基因组DNA检测,得出差异DNA甲基位点。采用Gene Ontology(GO)富集分析及KEGG_Pathway分析了解基因功能。结果基因芯片检测结果显示,黑素瘤组织与瘤旁组织存在差异甲基位点,共27 779个,其中16 673个为高甲基位点,11 106个低甲基位点。提高筛选条件为P < 0.01、︳Δβ︳> 0.2,过滤掉所有单核苷酸多态性相关探针、位于XY染色体上的探针以及交叉反应的探针,共筛选得到4 883个差异甲基位点,其中1 459(30%)个位于启动子区(包括TSS1500、TSS200、5′UTR、1st Exon)。GO富集分析显示,差异甲基基因参与的生物学过程主要包括细胞生长、分化、黏附、运动迁移、信号转导及转录调控等。KEGG_Pathway分析显示,差异甲基基因主要参与黏着斑、癌症通路、转化生长因子β信号通路、磷脂酰肌醇信号通路、黑素生成、趋化因子信号通路、黏合连接、钙信号通路、细胞黏附分子、MAPK信号通路、Wnt信号通路、JAK-STAT信号通路。基于"启动子区高甲基位点对应的前16个基因、出现甲基频率最高(CpG位点≥ 7)的基因、具有一定的功能或参与某条信号通路"条件,选出8个基因(KAAG1、DGKE、SOCS2、TFAP2A、GNMT、GALNT3、ANK2、HOXA9)作为黑素瘤候选生物标志物。结论黑素瘤组织存在较多高甲基基因,8个差异甲基基因有可能作为黑素瘤的生物标志物。

  • 标签: 痣和黑素瘤 表观基因组学 DNA甲基化 芯片分析技术 生物学过程 信号通路
  • 作者: 吴汉生 黄树杰 庄伟涛 丁宇 高枕 乔贵宾
  • 学科: 医药卫生 >
  • 创建时间:2021-06-25
  • 出处:《国际肿瘤学杂志》 2021年第04期
  • 机构:汕头大学医学院第一附属医院胸外科 515041 广东省人民医院(广东省医学科学院)胸外科,广州 510000 南方医科大学第二临床学院,广州 510515,广东省人民医院(广东省医学科学院)胸外科,广州 510000 汕头大学医学院临床系 515031,广东省人民医院(广东省医学科学院)胸外科,广州 510000
  • 简介:摘要N6-甲基腺嘌呤(m6A)甲基修饰的生物学作用已被逐渐深入研究,在肿瘤中显示出越来越高的价值。近年来,随着对表观遗传学在RNA修饰方面的深入研究,诸多研究表明m6A甲基修饰在肺癌的发生与发展中发挥了重要作用。m6A相关修饰蛋白具有成为肺癌临床诊治靶标的潜在应用价值。

  • 标签: 肺肿瘤 m6A RNA甲基化
  • 简介:摘要m6A甲基可以调节机体RNA的代谢,参与乳腺癌的发病过程。m6A甲基转移酶、m6A去甲基酶、m6A结合蛋白共同调节m6A甲基修饰的动态可逆过程。近年来研究显示甲基转移酶样蛋白(METTL)3、MELLT14、KIAA1429、去甲基酶脂肪和肥胖相关蛋白、YTH结构域家族蛋白1~3等相关因子在乳腺癌中异常表达,可能通过调节m6A甲基和去甲基过程影响乳腺癌的发生与发展,对其进行深入研究将为乳腺癌的临床诊治提供一个新的思路和靶点。

  • 标签: 甲基化 乳腺肿瘤 调控蛋白
  • 简介:摘要目的应用甲基芯片与生物信息技术,筛选大气污染细颗粒物(PM2.5)对人支气管上皮(HBE)细胞的差异甲基位点及其包含的基因和通路,为进一步研究PM2.5对HBE细胞毒理学机制提供科学依据。方法于2020年8月,用10 μg/ml和50 μg/ml PM2.5水溶物染毒HBE细胞24 h,即PM2.5 10 μg/ml染毒组(低剂量组)和PM2.5 50 μg/ml染毒组(高剂量组);用未染毒的HBE细胞作为对照组,将DNA片段与芯片进行杂交,芯片扫描读取数据后分析数据,筛选差异甲基位点,进行差异甲基位点的GO分析和KEGG分析,功能表观遗传模块(FEMs)分析整体差异甲基位点的相互作用关系。结果与对照组比较,低剂量组共筛选出127个差异甲基位点,包含89个基因,其中甲基水平升高的有55个位点,甲基水平降低的有72个,甲基差异位点主要集中在Body区域和UTR区域。与对照组比较,高剂量组共筛选出238个差异甲基位点,包含168个的基因,其中甲基水平升高的有127个位点,甲基水平降低的有111个,其差异位点也主要集中在Body区域和UTR区域。通过FEMs分析,筛选出8个相互作用最多的基因,其中6个基因有明显甲基水平变化。在低剂量组的甲基差异位点中找到与细胞凋亡相关的MALT1基因;在高剂量组的甲基差异位点中找到与癌变相关的PIK3CA、ARID1A基因;在FEMs分析结果中找到与肿瘤抑制相关的TNF基因。结论PM2.5染毒HBE细胞后,引起DNA甲基水平明显变化,筛选出细胞凋亡和癌变相关基因,提示PM2.5致癌致突变作用可能与DNA甲基有关。

  • 标签: 甲基化 细颗粒物 基因 人支气管上皮细胞 DNA 生物标志物
  • 简介:摘要DNA甲基是一种重要的表观遗传学调控机制,包括基因启动子甲基及基因体甲基。DNA甲基异常与恶性肿瘤的发生和进展密切相关,既往对启动子甲基与肿瘤的相关性已有较为清晰的阐述。然而随着全基因组DNA甲基的深入研究,发现基因体区域存在更为广泛的甲基,基因体甲基在肿瘤相关基因表达、细胞分化、肿瘤发生发展等中也发挥重要作用。本文就近年来基因体甲基对肿瘤的影响进行综述,深入阐述基因体甲基对肿瘤的作用及调控机制,为基因体甲基在肿瘤领域的研究及应用提供线索。

  • 标签: DNA甲基化 肿瘤 基因体甲基化
  • 简介:摘要砷是一种广泛存在于自然环境中的具有致癌作用的非金属物质。慢性砷暴露会造成全身多器官损伤,因其发病机制不明确、缺乏特效药及早期生物学标志物等因素,长期以来成为科技工作者研究的重点和热点。表观遗传修饰不仅与砷暴露存在相关性,而且可通过调控关键分子的表达参与砷诱导的早期损伤,成为砷暴露机制研究的重要方向。DNA甲基作为表观遗传修饰的重要模式之一,有望为地方性砷中毒提供新的治疗靶点。但DNA甲基是如何调控砷诱导关键基因的表达参与砷中毒的发生发展,以及与砷中毒机制之间的关系,尚待深入研究,现就DNA甲基在砷中毒发病机制的研究进展做一综述。

  • 标签: 砷中毒 DNA甲基化 表观遗传学
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  • 简介:摘要表观遗传修饰包括DNA甲基、组蛋白修饰、非编码RNA等,是决定基因表达的重要因素。越来越多的研究表明,表观遗传调控可能在脓毒症的发生发展过程中占有重要地位。由于DNA甲基的机制明确,研究手段也相对成熟,因此其在脓毒症相关研究中受到了广泛关注。现通过回顾近年来对于脓毒症中DNA甲基机制的研究,从病原学和免疫学等方面阐明DNA甲基修饰在脓毒症病理生理进程中所起到的关键作用,同时对DNA甲基在脓毒症诊断、预后和治疗中的应用潜力进行总结,为进一步研究指明方向。

  • 标签: 表观遗传学 甲基化 脓毒症
  • 作者: 田天 王腾 程琰 李笑天 赵欣之
  • 学科: 医药卫生 >
  • 创建时间:2020-08-10
  • 出处:《中华围产医学杂志》 2020年第06期
  • 机构:复旦大学生物医学研究院,上海 200032;复旦大学附属儿科医院儿科研究所,上海 201102 ,复旦大学生物医学研究院,上海 200032 ,复旦大学附属妇产科医院产科,上海 200090 ,复旦大学生物医学研究院,上海 200032;复旦大学附属儿科医院儿科研究所,上海 201102;上海交通大学医学院附属国际和平妇幼保健院中心实验室 200030
  • 简介:摘要目的探讨APELA基因启动子区甲基水平与子痫前期的关联。方法系统回顾2007年至2017年GEO基因表达数据库中APELA基因cg02779075位点在6项胎盘全基因组甲基研究中与子痫前期关联的甲基改变。检测研究间异质性后,使用随机效应模型进行meta分析。同时回顾性收集2008年至2010年复旦大学附属妇产科医院17例子痫前期和24例正常产妇共41份胎盘组织样本,MassARRAY定量CpG位点甲基水平,用荧光实时定量聚合酶链反应检测APELA基因表达。采用t检验或Mann-Whitney U检验对数据进行统计分析。结果(1)经检索获得的6项全基因组甲基研究,异质性检测表明研究间存在显著异质性(I2=0.64,P=0.016),使用随机效应模型进行meta分析,cg02779075位点在子痫前期胎盘中甲基水平显著下调(Pmeta=6.7×10-6)。(2)胎盘组织分析中,与正常产妇相比,子痫前期产妇CpG1[0.12(0.00~0.25)与0.21(0.09~0.33),U=-2.569]和CpG2[0.07(0.01~0.14)与0.17(0.09~0.34),U=-4.160]位点甲基水平显著下调(P值均<0.05)。子痫前期胎盘中APELA基因表达上调,但差异无统计学意义(U=0.891,P=0.384)。结论子痫前期产妇胎盘中APELA基因启动子区甲基调控异常。

  • 标签: 子痫前期 肽类激素 胎盘 DNA甲基化
  • 简介:摘要目的观察甲基寡核苷酸诱导热休克蛋白A2(HSPA2)基因甲基对胰腺癌细胞增殖和凋亡的影响。方法检测2017年1月至2018年12月桂林医学院附属医院诊治的90例胰腺癌患者(PAN组)和50例胰腺良性疾病患者(CON组)HSPA2基因甲基,Kaplan-Meier生存分析比较胰腺癌患者中HSPA2基因甲基和未甲基生存时间的差异。合成设计不同寡核苷酸(MON、UON、CON-a、CON-b和CON)转染PANC-1胰腺癌细胞,比较转染前、后PANC-1胰腺癌细胞HSPA2基因甲基、吸光度、细胞增殖和凋亡的差异。结果PAN组胰腺癌患者HSPA2基因甲基率显著低于CON组(13.3%比82.05%,χ2=61.537,P<0.05)。PANC-1、SW1990、HPAF-Ⅱ及CFPAC-1胰腺癌细胞中HSPA2为未甲基状态。PAN组胰腺癌患者中HSPA2基因甲基者生存期显著高于HSPA2基因未甲基患者[(16.88±0.67)个月比(11.34±0.51)个月,Logrank=15.195,P<0.01]。MON组可成功诱导PANC-1胰腺癌细胞HSPA2基因甲基,S期、G2/M期和增殖指数均显著低于UON组、CON-a组、CON-b组和CON组PANC-1胰腺癌细胞(S期分别为25.8±1.9、32.6±2.7、32.4±2.5、32.7±2.9、32.8±2.3,G2/M期分别为7.7±1.1、9.5±1.4、9.4±1.5、9.7±1.6、9.5±1.5,增殖指数分别为0.35±0.06、0.43±0.06、0.44±0.05、0.45±0.07、0.46±0.05,F=36.140、45.250、102.210,P<0.05),G0/G1期和凋亡率均显著高于UON、CON-a、CON-b和CON组(G0/G1期分别为61.3±2.1、55.8±3.2、55.2±3.5、54.9±3.7、55.1±2.9,凋亡率分别为24.7±1.8、21.6±2.1、21.4±2.3、21.5±2.5、21.6±2.4,F=47.280、72.140,P<0.05)。结论胰腺癌的发病机制与HSPA2基因去甲基有关,HSPA2基因去甲基为胰腺癌患者生存时间影响因素。甲基寡核苷酸可诱导胰腺癌HSPA2基因甲基失活而抑制细胞增殖并促进凋亡。

  • 标签: 胰腺癌 甲基化寡核苷酸 热休克蛋白A2 细胞增殖 凋亡
  • 简介:摘要目的分析亚砷酸钠(NaAsO2)致人肝星状细胞(LX-2细胞)纤维及自噬相关的DNA甲基位点,筛选与纤维及自噬相关的特异性甲基基因。方法采用DNA甲基芯片Illumina Infinium Methylation EPIC BeadChips(850K甲基芯片)对LX-2细胞(对照组)及NaAsO2干预(低、中、高剂量组:终浓度分别为5、10、15 μmol/L NaAsO2,干预48 h)致LX-2细胞纤维及自噬模型进行全基因组DNA检测,寻找差异甲基位点。对筛选出的差异甲基基因进行GO功能富集分析和KEGG信号通路富集分析,了解基因功能。结果高剂量组细胞纤维及自噬模型构建成功。850K甲基芯片检测结果显示,高剂量组与对照组间存在25 817个显著差异甲基位点,其中高甲基位点12 083个、低甲基位点13 734个。GO功能富集分析显示,差异甲基基因参与的分子功能主要包括蛋白结合、离子结合、催化活性、酶结合。KEGG信号通路富集分析显示,差异甲基基因参与的通路主要包括代谢通路、癌症通路、磷脂酰肌醇-3-激酶-蛋白激酶B(PI3K-Akt)信号通路、内吞作用、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路。进一步在启动子区,筛选出11个与纤维相关的差异甲基基因和29个与自噬相关的差异甲基基因。结论NaAsO2诱导LX-2细胞纤维及自噬过程中存在大量差异甲基位点,筛选出与纤维及自噬相关的特异性甲基基因。

  • 标签: 亚砷酸盐类 人肝星状细胞 肝纤维化 自噬 DNA甲基化
  • 简介:摘要N6-甲基腺嘌呤(m6A)是发生在腺苷N6位置的甲基,是真核mRNA上最普遍的内部修饰。越来越多的证据表明,m6A可调节基因表达,从而调节细胞的自我更新、分化、侵袭和凋亡等过程。m6A被m6A甲基转移酶复合物安装,被m6A去甲基酶除去,被甲基结合蛋白识别,继而调节RNA代谢,包括翻译、剪接、输出、降解等。m6A水平的改变通过调控CDCP1、MYC、MZF1等肿瘤相关基因的表达参与肿瘤的发生发展。本文就m6A在肾癌中的研究进展进行综述,以期为阐明肾癌发生发展的机制、探索新的治疗策略提供依据。

  • 标签: 肾肿瘤 N6-甲基腺嘌呤 基因 细胞运动
  • 简介:摘要头颈肿瘤是近年来最常见的恶性肿瘤之一,预后较差,其确切的分子机制和预后因素尚不清楚。识别特异性的生物标志物可使有效的靶向治疗策略应用到头颈肿瘤诊断治疗中,从而改善患者预后。越来越多的证据证实DNA甲基在肿瘤的起始和进展中起重要作用。本文就DNA甲基与头颈肿瘤的关系及研究进展做一综述。

  • 标签: 头颈部肿瘤 DNA甲基化 肿瘤干细胞
  • 简介:摘要随着DNA甲基检测技术的日益成熟和发展,体内外研究表明铅暴露与DNA甲基状态有关并影响人类健康。本文通过回顾以往的文献报道,就铅暴露对DNA甲基状态的影响做一综述,为职业人群铅中毒的预防及早期诊断提供新视角。

  • 标签: 环境暴露 职业暴露 DNA甲基化 表观遗传学
  • 简介:摘要肺纤维化为许多肺部疾病的终末期病变,以成纤维细胞异常增殖,细胞外基质过度沉积,组织疤痕形成和肺组织重塑为病理特征。近年研究表明,DNA甲基参与了多个器官的纤维过程,包括肺纤维、肝纤维和肾纤维等。在临床诊断和治疗中,DNA甲基的重要性也愈发明显。本文对DNA甲基在肺纤维中的研究进展做一综述,旨在探究肺纤维的发病机制及抗纤维治疗新思路。

  • 标签: DNA甲基化 肺纤维化 表观遗传学
  • 简介:

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  • 简介:摘要DNA甲基是肺癌发生发展中的重要变化,随着高通量测序技术的发展,其在肺癌诊断、治疗、预后中的价值逐渐被关注。近年来,多项研究发现组织DNA异常甲基与肺癌患者预后密切相关,有望通过检测组织DNA甲基水平,对肺癌患者预后进行有效预测。本综述系统性回顾既往研究,就组织DNA甲基在预测肺癌患者预后中的相关进展作一简单总结。

  • 标签: 肺肿瘤 DNA甲基化 预后
  • 简介:摘要核酸甲基是基因表观遗传学修饰的一种重要方式,也是肿瘤最常见的驱动性分子事件。检测核酸甲基游离形式不但能够对肿瘤进行早期辅助诊断及预后判断,而且可避免传统肿瘤组织活检方法侵入性和肿瘤异质性等问题。本文将回溯游离核酸甲基检测在肿瘤诊断中的应用现状,剖析游离核酸甲基检测面临的挑战,并对其临床应用前景进行展望。

  • 标签: 肿瘤 甲基化 游离核酸 液体活组织检查