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  • 简介:紫外线B(UV-B)对于植物生长发育具有重要调节作用,其中UVRESISTANCELOCUS8蛋白作为UV-B光受体植物响应UV-B过程中起关键作用。草莓种重要经济果树,目前关于草莓UV-B光受体报道较少。为研究草莓中UV-B受体蛋白,本研究采用同源克隆方法获得‘丰香’草莓中编码UV-B光受体蛋白cDNA序列,进行了生物信息学分析并构建了原核生物表达载体pET32a-UVR8,利用中心点响应面法优化了重组蛋白诱导条件(包括诱导温度,IPTG浓度,菌液浓度诱导时间)。结果表明:克隆得到了编码草莓UVR8蛋白全长cDNA序列,命名为FaUVR8,生物信息学分析表明该序列长1317bp,编码438氨基酸,预测分子量为47.28kD,等电点pI为5.85,重建蛋白质三维结构表明该蛋白包含7β-片状螺旋结构;原核表达得到69.7kD融合蛋白,对四诱导条件优化表明将工程菌培养至菌液OD600=0.7,加入浓度为0.55mmol/LIPTG,27.72℃下诱导9h,可获得最大量重组蛋白79μg/mL。研究结果可为后期寻找与FaUVR8蛋白互作下游蛋白,以及进步开展其功能研究提供参考。

  • 标签: 草莓 FaUVR8 生物信息学 原核表达
  • 简介:对青薯9号、大西洋、小白花E1074种基因型马铃薯茎尖进行玻璃化法超低温保存,并运用甲基化敏感扩增多态性(MSAP)技术分析4种材料超低温保存前后DNA甲基化变异情况。结果表明:经玻璃化法超低温保存,四品种成活率分别为86.93%,/o、78.03%、71.57%65.82%。成活率再生率因基因型而异,且不同基因型之间差异显著。用MSAP技术分析超低温保存前后植株甲基化结果显示:用16对引物组合对4品种进行扩增,平均扩增出493条带;与对照相比,4品种基因组CCGG序列中有8.4%~14.3%DNA发生甲基化变化。经超低温保存后,去甲基化甲基化都有发生,并以去甲基化变化为主要趋势。本文运用MSAP技术对马铃薯超低温保存前后植株进行胞嘧啶甲基化分析表明,使用MSAP检测超低温保存后再生植株DNA甲基化遗传变异非常有效。

  • 标签: 马铃薯 玻璃化法 超低温保存 DNA甲基化 甲基化敏感扩增多态性 遗传变异
  • 简介:艾纳香(Blumeabalsamifera)作为贵州道地药材,其次生代谢产物,如类黄酮、艾纳香素等具有重要药理作用。葡萄糖基转移酶(UFGT)艾纳香类黄酮代谢途径中关键酶。本研究通过对艾纳香转录组进行测序,借助引物PCR成功克隆得到其葡萄糖基转移酶基因cDNA序列,并对其进行了相应生物信息学分析。分析发现,艾纳香UFGT基因cDNA全长1527bp,共编码508氨基酸,所编码蛋白分子量为56.155kD,等电点为5.30,属于疏水性蛋白,可能定位于微体中。此外,艾纳香UFGT蛋白结构中0l螺旋占33.07%,延伸链占10.83%,无规则卷曲56.10%,与三级结构预测结果致。本研究对于探究黔产艾纳香类黄酮物质生物合成分子机制指导意义,并为将来类黄酮生物合成提供帮助。

  • 标签: 艾纳香 UFGT 基因克隆 生物信息学
  • 简介:为了明确苹果三倍体杂种后代中基因组DNA甲基化水平及模式变化特征,本文以‘金冠’ב四倍体嘎拉’苹果6l份三倍体后代为试验材料,采用MSAP分子标记技术对其进行了分析。结果表明:(1)61份三倍体杂种后代总甲基化率10.74%~28.86%之间,全甲基化率7.87%~24.22%之间,半甲基化率2.10%~11.84%之间。与母本相比,总甲基化全甲基化呈上升趋势,半甲基化呈下降趋势;与父本相比,均呈下降趋势。(2)苹果三倍体杂种基因组加倍重组过程中,发生了大量过超甲基化去甲基化变异,少量发生了次甲基化现象,极少部分甲基化状态介于双亲之间。(3)共获得4条DNA甲基化差异片段,3条能够苹果基因组中检测到,且同源性较高,分别位于第1条第12条染色体叠连群,但是具体功能没有描述。研究结果表明,苹果三倍体杂种后代DNA甲基化水平与倍性相关性不大,在其形成过程中发生了大量超甲基化变异,为苹果三倍体育种中表观遗传变异研究提供依据。

  • 标签: 苹果 三倍体杂种 DNA甲基化
  • 简介:以小白菜为试验材料,水培条件下,研究叶面喷施不同浓度黄腐酸(0.08%,0.15%,0.25%)对硝酸盐胁迫下(120mmol/L)小白菜活性氧代谢及相关基因表达影响。结果表明,硝酸盐胁迫可引起小白菜叶片中MDA、O2^-H2O2含量增加,生长受到抑制;硝酸盐胁迫下施用黄腐酸(fulvicacid,FA)能显著促进小白菜生长发育,提高膜稳定指数抗氧化酶活性,增加脯氨酸可溶性糖等渗透调节物质含量,减少O2^-H2O2积累,其中以处理Ⅳ(0.15%FA)处理效果最好;随黄腐酸浓度增加,活性氧代谢相关基因Cu/Zn-SODPOD表达水平呈先升后降趋势,CAT基因表达水平持续增加,APX基因表达水平则表现为先降后升随后下降趋势,其中Cu/Zn-SOD、PODAPX基因表达水平均在处理Ⅳ(0.15%FA)达到顶峰,CAT基因表达水平处理Ⅴ(0.25%FA)最高。适宜浓度黄腐酸可有效缓解硝酸盐胁迫对小白菜所造成伤害,增强其抗盐性。本研究通过喷施外源黄腐酸,研究其对硝酸盐胁迫下小白菜生长、活性氧、渗透调节、抗氧化酶活性及相关基因表达影响,为探讨黄腐酸调控蔬菜盐害提供理论依据。

  • 标签: 黄腐酸 硝酸盐胁迫 小白菜 活性氧 基因表达
  • 简介:水稻育性恢复基因Rf-1目前水稻克隆恢复基因。通过位于Rf-1位点特异性CAPS(cleavableamplifiedpolymorphicsequences)标记对滇I型、野败型、红莲型及BT型恢复系基因型分析,发现这四种不同胞质恢复系Rf-1位点具相同带型,滇I型保持系具有不同带型。结果表明这四种不同胞质系统恢复系均具有Rf-1基因。该结论与从恢复系选育系谱分析结果相

  • 标签: 水稻 育性恢复基因 细胞质雄性不育系 Rf-1位点 CAPS标记
  • 简介:糖基转移酶(GTs)花色苷合成过程中最重要修饰酶之,其花色苷合成过程中发挥重要作用。本研究以日本蛇根草为材料,依据其转录组测序结果,设计引物通过RT-PCR方法成功克隆得到OjGT1基因完整cDNA序列,随后对OjGT1功能结构域、生理化学参数、亲/疏水性、信号肽,结构等进行生物信息学分析。分析结果显示,OjGT1基因完整CDS长度为1413bp,翻译形成蛋白分子量为52.087kD,等电点为5.12,编码形成亲水性蛋白质,不含信号肽。同时结构与三级结构分析显示,OjGT1蛋白结构主要以不规则卷曲为主,其次α螺旋,延伸链所占比重最小。OjGT1基因成功克隆与生物信息学分析,将为后续研究茜草目其它植物糖基转移酶提供参考,同时也为日本蛇根草花色苷生物合成研究提供科学依据。

  • 标签: 日本蛇根草 OjGT1 基因克隆 生物信息学分析
  • 简介:不饱和脂肪酸衍生物植物胁迫应答中发挥着重要生理功能,其介导途径中转录因子结合相应顺式作用元件,特异性调控防御相关基因表达,增强植物对环境胁迫抗性。本综述概述逆境胁迫下植物不饱和脂肪酸衍生物合成代谢途径介导防卫信号途径,总结了信号转导中相关转录因子分类、结构及功能研究进展,旨在为植物不饱和脂肪酸衍生物介导途径调控网络分子育种方面的利用提供参考,以期通过转录因子遗传修饰改良植物抗逆性。

  • 标签: 植物 不饱和脂肪酸衍生物 抗逆 信号通路 转录因子
  • 简介:细菌脂多糖由O-抗原,核心多糖脂质A三部分组成,脂质A细菌内毒素活性根源。植物脂多糖与细菌脂多糖组成基本相似,但不具有微生物脂多糖高毒性。目前,对植物脂多糖合成机制缺乏最基本认识,因此研究植物脂多糖合成具有重要科学价值。作者水稻基因组中发现含有大肠杆菌EcLpxA功能结构基因,命名为OsLpxA,该基因催化水稻脂质A合成步反应。本研究用水稻(Oryzasativasubsp.Japonica)苗期叶片为材料,提取总RNA并以此为模板,用反转录PCR扩增OsLpxA基因siRNA靶序列,并将其连接到表达载体pTCK303,构建了RNA干扰载体pTCK303-OsLpxA-RNAi。将该载体通过农杆菌介导法转化水稻,共获得59株具有潮霉素抗性转化苗。然后利用潮霉素特异性引物对全部抗性苗进行PCR检测,其中有38株转化苗呈阳性,表明潮霉素标记基因已整合到了水稻基因组中。最后,利用定量PCR检测38株阳性苗中OsLpxA基因在转录水平表达变化。结果表明,其中27株阳性苗中导入OsLpxA基因RNA干扰结构成功地降低了目的基因表达。该结果为后续对OsLpxA基因功能研究提供参考。

  • 标签: 水稻 UDP-N-乙酰葡萄糖胺酰基转移酶基因 RNA干扰 脂质A