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  • 简介:采用SDS和CTAB两种方法分离提取金丝小枣基因组DNA,并比较其提取效果.结果表明,改进后的CTAB法可获得高质量、高得率的基因组DNA,可用于金丝小枣的各种分子生物学研究.

  • 标签: 金丝小枣 基因组DNA 提取方法 分子生物学 CTAB
  • 简介:五唇兰组织内含有大量的酚类、多糖以及此生代谢产物,DNA提取较为困难。为获得高质量的五唇兰基因组DNA,文中采用传统十六烷基三甲基溴化铵(CTAB)法、常规十二烷基硫酸钠(SDS)法和改进的CTAB法对五唇兰基因组DNA提取进行比较。结果表明:改进的CTAB法比传统CTAB法和常规SDS法都好,可以得到质量较好的DNA,电泳条带清晰,通过紫外分光光度计检测,A260/A280为2.0以上。

  • 标签: 五唇兰 基因组DNA 提取
  • 简介:植物叶片中含有的多糖、蛋白质和多酚等物质,很大程度会影响总DNA提取质量。本研究以剑叶虾脊兰(Calanthedavidii)和银带虾脊兰(Calantheargenteo-striata)幼嫩叶片为材料,采用改良CTAB法提取DNA,设置样品重量(0.05g,0.10g,0.20g)、清洗时间(10min,20min,30min)、水浴温度(25℃,60℃,45℃)、水浴时间(2h,1h,0.5h)4因素3水平正交试验,探究不同因素、不同处理对DNA得率和纯度的影响,以获取最佳提取条件。研究发现剑叶虾脊兰和银带虾脊兰DNA的最佳提取条件均为:样品重量0.2g、清洗时间30min、水浴温度60℃、水浴时间2h。该处理下剑叶虾脊兰DNA产率最高为490.5ng/μL,A260/A280均值为1.953;该处理下银带虾脊兰DNA产率最高为139.83ng/μL,A260/A280均值为1.967。各因素对剑叶虾脊兰DNA产率影响次序为:样品重量>清洗时间>水浴温度>水浴时间;各因素对银带虾脊兰DNA产率影响为:样品重量>水浴温度>清洗时间>水浴时间。本研究为虾脊兰属的分子生物学研究提供科学依据。

  • 标签: 虾脊兰属植物 正交试验 DNA提取方法优化 分子生物学
  • 简介:目的建立-种灵敏、可靠、快速对水中大肠埃希菌富集和DNA提取的最佳方法组合,以便应用TaqMan探针实时荧光PCR技术进行定量检测。方法膜过滤洗脱环节,采用3种不同的方法进行富集洗脱,通过平板计数法比较各方法富集洗脱效果;DNA提取环节,采用4种方法进行DNA提取。所得DNA进行实时荧光PCR扩增,定量检测DNA拷贝数,比较各方法DNA提取效率;并采用最优的方法组合,对模拟水样进行膜过滤和DNA提取,考察全过程的回收率和灵敏度。结果采用加表皮葡萄球菌过滤+漩涡混合器+玻璃棒刮擦洗脱方法(C法),洗脱效率能达到75%-93%;TritonX-100法和磁珠法的线性范围达到6个数量级稀释度(10^0-10^-5),r2分别为0.998和0.999,然而,TritonX—100法更省时,更简便,经济性更好。采用该最优的方法组合,其全过程的回收率为79.7%~104.0%且灵敏度达到1cfu/ml。结论c法+Triton-100法组合可以快速、准确、经济地对饮用水中大肠埃希菌进行富集和DNA提取

  • 标签: 大肠埃希菌 细菌富集 DNA提取 饮用水 食品安全 食源性致病菌
  • 简介:探索从微量植物检材中提取DNA的有效方法,并尝试应用于法庭科学实践。方法:采用优化改良的硅珠法,从10种不同的植物叶子中提取DNA(8种常见植物,2种毒品原植物)。通过紫外分光光度法、琼脂糖凝胶电泳、PCR扩增及限制性内切酶消化对提取DNA进行检测;最后以实际案例中的植物检材为研究对象,验证提取方法。结果:通过该方法提取的植物DNA纯度较高,质量较好。PCR扩增的条带清晰、明亮,无杂带。结论:该方法可有效去除次生物质对DNA的干扰,提取的基因组DNA可满足PCR扩增及以PCR为基础的实验需要,可以应用于法庭科学实践。

  • 标签: 法庭科学 植物物证 DNA提取
  • 简介:方案4提取DNA的OD260/OD280比值在1.835~1.909之间,比较了4个方案提取高良姜基因组DNA的效果,结果用改良CTAB法方案4提取的基因组DNA的OD260/OD280比值在1.8~2.0之间

  • 标签: 南药高良姜 基因组提取 提取方法
  • 简介:方案4提取DNA的OD260/OD280比值在1.835~1.909之间,比较了4个方案提取高良姜基因组DNA的效果,结果用改良CTAB法方案4提取的基因组DNA的OD260/OD280比值在1.8~2.0之间

  • 标签: 南药高良姜 基因组提取 提取方法
  • 简介:摘要:应用煮沸法、微波炉提取法、异丙醇沉淀提取法、改良碱裂解法、氯化锂法等五种质粒DNA提取方法提取农杆菌pBI121质粒DNA。结果表明,这些方法相对于经典的碱裂解法都有一定的优点,其中的煮沸法、改良碱裂解法、氯化锂法,实验操作时间短,不使用有毒的酚和氯仿,提取的质粒DNA质量也较好,可以满足分子生物学的常规实验要求,适合在中学实验教学中应用。

  • 标签: 质粒DNA 提取方法 中学实验
  • 简介:一、鼠肝匀浆解剖小(或大)白鼠,取下肝脏,切成薄片,用蒸馏水漂洗净。称取5mg鼠肝,加入20ml蒸馏水。用研钵捣碎肝组织,使其呈匀浆状,注意整个匀浆时间不能超过1分钟。浆液用二层纱布过滤。二、DNA提取1.肝匀浆滤液中加入2ml20%SDS(十二烷基磺酸钠),搅拌均匀,使肝细胞脂质膜溶解。置于60-65°C范围内保温10分钟。其间应不停地搅拌。2.在上述液体中加入7.5ml5mol/1氯酸钠,

  • 标签: 鼠肝 十二烷基磺酸钠 蒸馏水 肝匀浆 温度计 提取物
  • 简介:本试验采用甜叶菊组培苗叶片为材料,以RAPD分子标记检验水浴温度与时间、取样重量以及优化步骤等三个DNA提取影响因素,进而以SRAP和MSAP分子标记技术对RAPD结果进行验证,以提高甜叶菊组培苗DNA提取效率。结果表明,水浴温度、时间为70℃30min(A2),取样量为0.1g(B2)时,提取到常规步骤9的上清液V(C4)即可满足常规分子标记要求,且提取时间可减少1~1.5h。

  • 标签: 甜叶菊 DNA提取 分子标记
  • 简介:目的建立一套系统、完整的粪便日本血吸虫虫卵DNA提取法及PCR优化体系。方法利用蛋白酶K和苯酚法从感染日本血吸虫尾蚴的家兔粪便中提取DNA,根据日本血吸虫基因(AF00369)设计特异性引物,以粪便中提取DNA为模板,采用PCR方法扩增目的基因片段,对PCR方法的各种反应条件进行优化并采用有限稀释法推测PCR检测法可检测到的最低虫卵数。结果以感染家兔的粪便中提取DNA为模板.用PCR方法可扩增到分子量大小约为400bp的特异性条带,测序结果经BLAST工具进行分析.与日本血吸虫基因(AF00369)比对的同源性为96%;25μlPCR反应体系的最优化反应条件:MgCl21.5μl;dNTP0.5μl;引物1.0μl;DNA模板5.0μl;TaqDNA聚合酶0.5μl。扩增程序为:94℃预变性5min、94℃变性30s、53℃退火30s、72℃延伸30s,30个循环、72℃延伸7min、4℃保存。PCR检测法可检测到的最低虫卵数为0.015个。结论成功建立感染家兔粪便中虫卵DNA提取方法及PCR血吸虫基因片段检测方法,同时对PCR反应条件进行优化,为从分子角度检测日本血吸虫虫卵DNA提供科学的实验依据。

  • 标签: 日本血吸虫 虫卵DNA 粪便 聚合酶链式反应
  • 简介:对新鲜的血液或者血痕,采用直接扩增和chelex-100直接处理提取DNA,一般都能获得完整、均衡的DNA分型,但在日常检案过程中,陈旧血痕、载体潮湿、委托方送检的样本由于保存不当导致血液和少量血痕检材腐败的情况也比较常见。这类检材DNA采用普通的chelex-100直接提取很难获得比较完整的DNA分型。结合一列检案,分别用chelex-100、磁珠法、微量DNA提取试剂盒三种方法专门针对腐败血液进行比较分析。

  • 标签: chelex-100 磁珠法 微量DNA提取试剂盒 纯化柱
  • 简介:目的:比较提取高质量艰难梭菌基因组总DNA方法方法:采用4种不同方法提取艰难梭菌基因组DNA,比较作为模板用于扩增艰难梭菌看家基因磷酸丙糖异构酶(tpi)基因的优缺点。结果:除沸水浴法,其他3种方法制备的艰难梭菌DNA均能成功用作PCR扩增的模板。CTAB/NaCl法进行提取可有效去除多糖成分,但操作要求较高。碱裂解法操作简便、省时、成本低经济可靠,提取DNA量及纯度较合适;试剂盒抽提出的产物纯度和产量明显高于CTAB/NACL、碱裂解法(P〈0.05),但成本高。结论:四种方法各具优缺点,应根据实验室条件和实验要求进行选择。

  • 标签: 艰难梭菌 TPI DNA提取
  • 简介:为有效获得蚜茧蜂基因组DNA,并保留其虫体做形态鉴定。本文对常规试剂盒提取方法(柱离心法)进行改进,采用穿刺法提取7种蚜茧蜂的基因组DNA,同时以研磨法提取4种常见蚜茧蜂成虫基因组DNA做对照,比较两种方法提取的基因组DNA的纯度和产量,并通过线粒体COI基因序列扩增进行验证。结果表明:穿刺法能从单头蚜茧蜂中提取DNA而不影响形态鉴定。该方法提取DNA产物产量在29~55ng/μL,提取物的OD260/OD280在1.51~1.91,可以稳定地进行线粒体COI基因序列扩增,PCR扩增条带清晰完整。

  • 标签: 蚜茧蜂 基因组DNA DNA提取 PCR
  • 简介:采用改良CTAB法提取了降香黄檀(DalbergiaodoriferaT.Chen)新鲜叶片和硅胶干燥后放置3个月的叶片基因组DNA,并对影响RAPD反应的各因素进行了优化。结果显示新鲜的降香黄檀叶可以得到质量较高的DNA,硅胶保存后部分叶片所提的DNA有降解。优化后反应体系为:25μL反应体系中包括,模板的DNA20ng,TaqDNAPolymerase2.5U,Mg^2+5mmol·L^-1,dNTP0.3mmol·L^-1,引物(S37)0.4μmol·L^-1。反应条件为94℃预变性4min;94℃,30s,36℃1min,72℃2min,40个循环;72℃延伸10min.

  • 标签: 降香黄檀 DNA提取 RAPD
  • 简介:在法医物证检验工作中,一般的腐败尸体由于软骨腐败速度较慢,选择软骨检材进行检验,且采用Chelex-100法提取DNA就可得到理想的STR分型结果,但在本案中的腐败软骨,由于未被软组织包裹,长时间暴露于空气和泥水中,且在温度适宜的情况下,加速了腐败,增加了检验难度,单纯依靠此法检测存在失败的可能。笔者运用二种不同的DNA提取法对高度腐败的软骨进行DNA提取,并进行了比较。

  • 标签: DNA提取方法 腐败 软骨 Chelex-100法 泥水 检验工作
  • 简介:通过对牡蛎肠道微生物总DNA提取方法进行优化,以OD260/OD280比值、琼脂糖凝胶电泳、DNA浓度及PCR反应为指标,分析比较提取近江牡蛎肠道微生物总DNA方法,结果表明,SDS-溶菌酶法的结果最优,其次是CTAB提取法,最后依次是DNA简约提取法、试剂盒法。

  • 标签: 牡蛎 肠道微生物 DNA提取 电泳 PCR
  • 简介:以8份广西桑树种质资源为材料,比较了改良的CTAB法和植物基因组DNA试剂盒法(离心柱)提取桑树基因组DNA的效果。结果表明:两种方法都能得到桑树样品清晰的DNA电泳条带,DNA纯度高,改良的CTAB法提取DNA浓度在308.70μg/mL~384.30μg/mL之间,平均值是331.45μg/mL;植物基因组DNA试剂盒法提取DNA浓度在180.50μg/mL~305.60μg/mL,平均值是212.01μg/mL,改良的CTAB法提取DNA产量较高,用SRAP引物组合Me2-Em8进行扩增两种方法提取DNA,均获得了清晰的扩增图谱,各样品的扩增效果条带清晰、多态性强。这两种桑树基因组DNA提取方法都能满足桑树分子标记研究的需要。

  • 标签: 桑树 基因组DNA 提取方法 比较