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  • 简介:2009年3月在美国和墨西哥流感样患者的呼吸道标本中鉴定出新的猪源性甲H1N1流感病毒。该病毒可人-人传播,已蔓延到112个国家和地区。为了遏制不断重组或重配的流感病毒,各国学者对甲H1N1流感病毒的分子生物学特征、复制周期及实验室诊断做了细致的研究,以研发相应的药物或疫苗,这些成就为世界各国防控今年新鉴定的猪源性甲H1N1流感病毒感染发挥了重要作用。现就猪源性甲H1N1流感病毒的鉴定、基因组结构特征做一综述。

  • 标签: 猪源性甲型H1N1流感病毒 基因组 重配
  • 简介:[目的]观察禽流感H5N1病毒对沙鼠的致病性;[方法]在生物安全三级实验室,将禽流感H5N1病毒通过滴鼻接种乙醚麻醉后沙鼠,观察14天,记录沙鼠的体温体重、临床症状、病理变化、病毒分离及抗体变化;[结果]沙鼠感染后发病主要表现在第2天至第6天,攻毒组沙鼠出现反应迟钝、皱毛、弓背、食欲下降、呼吸急促、打堆等症状,攻毒组沙鼠的体温降低和体重减轻,死亡率为44%,在第8天检出抗体,主要病理变化表现为肺出现严重淤血、水肿、出血,镜下可见肺间质充血,血管周围炎性细胞浸润,肝和胸腺淤血,肾出血,肾小管变形。

  • 标签: 沙鼠 禽流感H5N1型病毒 致病性
  • 简介:目的观察H5N1禽流感病毒对中国非人灵长类动物的易感性并建立动物模型.方法将病毒通过滴鼻接种实验猴,观察感染后动物的临床症状,采血、咽拭子及各器官组织进行血清学、病原学及病理学检查,记录抗体变化、病毒分离情况及病理学改变.结果感染后动物表现轻度食欲下降、一过性体温升高及外周血白细胞减少,肺组织病毒分离及RT-PCR阳性,病理检查感染急性期动物肺组织表现为间质性肺炎,肺泡间隔增宽,充血出血明显,肺泡受压变形,间质及肺泡内有大量炎细胞浸润,符合病毒性肺炎的改变,感染后14d动物血清IgG抗体水平较感染前升高4倍.结论H5N1病毒可感染非人灵长类动物,可以作为感染模型进行H5N1病毒的发病机制、疫苗评价、药物筛选等研究.

  • 标签: H5N1型禽流感病毒 恒河猴 食蟹猴 模型 动物
  • 简介:TheNetAcetmethodhasbeendevelopedtomakepredictionsofN-terminalacetylationsites,butmoreinformationofthedatasetcouldbeutilizedtoimprovetheperformanceofthemodel.Byemployinganewwaytoextractpatternsfromsequencesandusingasamplebalancingmechanism,weobtainedacorrelationcoefficientof0.85,andasensitivityof93%onanindependentmammaliandataset.Awebserverutilizingthismethodhasbeenconstructedandisavailableathttp://166.111.24.5/acetylation.html.

  • 标签: N-端 乙酰化作用 支持向量分析 蛋白质 变异 预测方法
  • 简介:流行性感冒A病毒(H1N1)2009,一个新猪起源流行性感冒A病毒,世界范围地被散布了并且引起了大公共害怕。高产量的transcriptomics和proteomics方法现在正在被使用识别H1N1和H1N1主人相互作用。这篇文章在H1N1诊断,处理,和H1N1病毒主人相互作用考察最近的transcriptomics和proteomics研究,到为进一步理解感染机制并且控制H1N1传播提供一些帮助。

  • 标签: 蛋白质组学 基因表达谱 A型流感病毒 转录组学 相互作用 控制传输
  • 简介:TheCoronaviridaefamilyischaracterizedbyanucleocapsidthatiscomposedofthegenomeRNAmoleculeincombinationwiththenucleoprotein(Nprotein)withinavirion.ThemoststrikingphysiochemicalfeatureoftheNproteinofSARS-CoVisthatitisatypicalbasicproteinwithahighpredictedpIandhighhydrophilicity,whichisconsistentwithitsfunctionofbindingtotheribophosphatebackboneoftheRNAmolecule.ThepredictedhighextentofphosphorylationoftheNproteinonmultiplecandidatephosphorylationsitesdemonstratesthatitwouldberelatedtoimportantfunctions,suchasRNA-bindingandlocalizationtothenucleolusofhostcells.SubsequentstudyshowsthatthereisanSR-richregionintheNproteinandthisregionmightbeinvolvedintheprotein-proteininteraction.TheabundantantigenicsitespredictedintheNprotein,aswellasexperimentalevidencewithsynthesizedpolypeptides,indicatethattheNproteinisoneofthemajorantigensoftheSARS-CoV.Comparedwithotherviralstructuralproteins,thelowvariationrateoftheNproteinwithregardstoitssizesuggestsitsimportancetothesurvivalofthevirus.

  • 标签: SARS 冠状病毒 N蛋白 结构分析 抗原性
  • 简介:流行性感冒的所有已知的子类型A病毒在野水鸟被维持,这些病毒的自然水库。流行性感冒A病毒被孤立从许多有改变病态和死亡率的动物种类。更重要地,流行性感冒A病毒与潜在地致命的结果在人引起呼吸疾病。在人的本地或全球的爆发被过量住院和死亡典型地描绘。在1997,H5N1子类型的高度病原的鸟的流行性感冒病毒在传给人的香港出现了,导致由鸟的流行性感冒病毒感染的人的死亡的首先记录的盒子。在越南,印度尼西亚,和泰国在家禽在2003年7月开始的新爆发,和高度病原的鸟的H5N1流行性感冒病毒后来在整个亚洲并且进欧洲和非洲传播了。这些病毒继续与高死亡率感染人并且引起隐约可见的世界范围的担心流行。而且,H5N1病毒爆发在整个亚洲在家禽工业上有破坏效果。因为H5N1病毒爆发看起来从南部的中国发源,我们这里在中国检验H5N1流行性感冒病毒,与他们的生物性质上的一个重音。

  • 标签: 甲型流感病毒 H5N1型 生物学特性 高致病性禽流感 H5N1禽流感病毒 H5N1亚型
  • 简介:Thesurfaceglycoproteinhemagglutinin(HA)helpstheinfluenzaAvirustoevadethehostimmunesystembyantigenicvariationandisamajordrivingforceforviralevolution.Inthisstudy,theselectionpressureonHAofH5N1influenzaAviruswasanalyzedusingbioinformaticsalgorithms.Mostoftheidentifiedpositiveselection(PS)siteswerefoundtobewithinoradjacenttoepitopesites.SomeoftheidentifiedPSsitesareconsistentwithpreviousexperimentalstudies,providingfurthersupporttothebiologicalsignificanceofourfindings.ThehighestfrequencyofPSsiteswasobservedinrecentstrainsisolatedduring2005–2007.PhylogeneticanalysiswasalsoconductedonHAsequencesfromvarioushosts.Viraldriftisalmostsimilarinbothavianandhumanspecieswithaprogressivetrendovertheyears.OurstudyreportsnewmutationsinfunctionalregionsofHAthatmightprovidemarkersforvaccinedesignorcanbeusedtopredictisolatesofpandemicpotential.

  • 标签: H5N1病毒 选择压力 血凝素 演变 系统发育分析 流感病毒
  • 简介:预言潜水艇的能力从它的顺序的蛋白质的细胞的本地化是很重要的,它关于蛋白质的功能提供信息。我们在场一个计算工具,PredSL,它利用神经网络,Markov链,隐藏的Markov建模的侧面,和得分为潜水艇的预言的矩阵在从N终端氨基酸顺序的真核细胞的房间的蛋白质的细胞的本地化。它试图分类蛋白质进五个组:叶绿体,thylakoid,线粒体,能分泌的小径,和“其它”。当在一个五倍的交叉验证过程测试了时,PredSL分别地为植物和非植物数据集表明86.7%和87.1%全面精确性。与TargetP,迄今为止是最广泛地使用的方法,和LumenP相比,PredSL的结果在大多数情况中是可比较的。当在Saccharomycescerevisiae染色体的试验性地验证的蛋白质上测试了时,PredSL可比较地表现如果比为一样的任务的任何可得到的算法不好。而且,PredSL是为这些的预言有能力的唯一的方法代替作为通过URL:http://bioinformatics.biol.uoa.gr/PredSL/的独立应用可得到的细胞的本地化。

  • 标签: 基因序列 蛋白质 亚细胞 缩氨酸
  • 简介:抗性种质N9659含有野生二粒小麦(资源编号:AS846)的抗白粉病基因,并对陕西关中地区白粉病优势小种表现为高抗。为了研究其抗白粉病基因的遗传规律,用高感品种辉县红、阿勃、陕160和阿勃21个缺(单)体系分别与N9659进行杂交,F1和F2苗期接种关中地区白粉病流行小种。结果显示,组合辉县红×N9659、阿勃×N9659、陕160×N9659及阿勃21个缺(单)体系和N9659杂交组合的所有F1均表现为高抗白粉病,F2的白粉病抗感比例除组合阿勃5BM×N9659偏离3∶1外,其他组合均符合3∶1,表明N9659苗期白粉病抗性由1对位于染色体5B上的完全显性基因控制。

  • 标签: 小麦 白粉病 基因定位
  • 简介:目的:采用巢式PCR对甲H1N1流感病毒血凝素单克隆抗体的轻链和重链基因进行扩增,对获得的基因进行序列分析,并找出克隆鼠Igκ轻链和重链可变区基因的通用方法。方法:设计22对扩增鼠Igκ轻链可变区和重链可变区基因的引物,对6株鼠抗人甲H1N1流感病毒血凝素单克隆抗体的轻链和重链可变区基因进行克隆并测序,与NCBI公布的鼠免疫球蛋白序列比对分析。结果:巢式PCR方法可以有效避免单克隆抗体克隆过程的假基因,并且得到的单克隆抗体的氨基酸序列均符合鼠免疫球蛋白可变区特征。结论:建立了克隆鼠免疫球蛋白轻链和重链可变区基因的通用方法,为后期克隆鼠源性单克隆抗体的可变区基因提供了基础,并为研究甲H1N1流感病毒血凝素与抗体的结合位点提供了实验数据。

  • 标签: 甲型H1N1流感病毒 单克隆抗体 可变区 巢式PCR 序列分析
  • 简介:细螺旋体病是螺旋体种类引起的传染细菌的疾病。在这研究,我们克隆并且定序从L编码immunodominant蛋白质GroEL的基因。interrogansserovarAutumnalis种类N2,在Chennai在细螺旋体病的爆发期间从一个病人的尿被孤立,印度。这groEL基因另外的leptospiralserovars与相同(99%类似)的高度编码60kDa的蛋白质到那些。RecombinantGroEL是在Escherichiacoli的overexpressed。当没有反应从seronegative控制病人与sera被观察时,Immunoblot分析显示从证实的细螺旋体病病人的sera与recombinantGroEL显示出强壮的反应。另外,GroEL的3D结构作为模板从Thermusthermophilus用chaperonin建筑群cpn60被构造并且验证。结果显示了8.35的Z分数,它在对为蛋白质的期望的价值的好同意。cpn60结构的Ca踪迹和leptospiralGroEL的预言的结构的重叠与1.5的RMSD价值显示第二等的结构元素的好同意?。进一步的学习是必要的作为一个疫苗的部件为细螺旋体病的血清学的诊断并且为它的潜力评估GroEL。

  • 标签: 钩端螺旋体病 GROEL 血清型 蛋白质 同源建模 克隆
  • 简介:目的:研究SARS冠状病毒(SARS-CoV)N蛋白与CYP4F3的相互作用。方法:应用免疫共沉淀、GST—pulldown、BIACORE实验验证SARS—CoVN蛋白与CYP4F3的相互作用。结果:SARS—CoVN蛋白与CYP4F3能够相互作用,BIA-CORE实验证实CYP4F3与SARS—CoVN蛋白的亲和常数为Ko=4.3×10^-11。结论:SARS—CoVN蛋白与CYP4F3在细胞内、外均能形成复合物,这为进一步探讨SARS—CoVN蛋白在SARS致病机理中的作用奠定了基础。

  • 标签: SARS冠状病毒 N蛋白 CYP4F3 相互作用
  • 简介:流行性感冒A病毒(H1N1),人的地方性的紧张的一个基因分类,鸟并且猪流感,穿过种类障碍到人并且显然获得了人的能力到人的传播。因为NS1蛋白质禁止抗病毒的干扰素/生产,H5N1子类型的一些紧张是高度剧毒的。另一蛋白质NS2调停到通过出口的细胞质的从原子核的病毒的ribonucleoprotein的出口信号。在这份报纸,我们学习了H1N1子类型的这些蛋白质的结构功能关系并且决定了他们的致病力的原因。我们的结果证明非保守的变化稍微稳定了或使动摇NS1或NS1-dsRNA建筑群的结构的域,稍微因此增加了或减少NS1蛋白质并且因而的函数提高了或减少H1N1病毒的致病力。不同紧张的NS2蛋白质在不同领域带了非保守的变化,导致功能的细微损失。这些变化稍微减少了病毒的致病力。因此,结果证实这些病毒的蛋白质的结构功能关系。

  • 标签: H5N1亚型 蛋白质结构 NS2 A型流感病毒 高致病性 生理盐水
  • 简介:目的:探讨N-myc下游调节基因1(N-mycdownstream-regulatedgene1,NDRG1)在乳腺癌中表达。方法:收集乳腺癌病例及相应的临床资料包括随访资料,应用免疫组织化学技术检测良性病变(BBD)47例,无淋巴结转移乳腺癌(NMBC)83例,有淋巴结转移乳腺癌(MBC)107例及配对淋巴结转移灶(PLNM)107例中NDRG1的表达,分析NDRG1表达与乳腺癌临床病理指标间(患者年龄、肿块大小、临床分期、组织学类型和分级、淋巴结转移、雌孕激素受体和c-erbB2水平、绝经史)及生存状态的关系。结果:通过免疫组化技术检测乳腺癌中NDRG1的表达,结果显示阳性表达率分别为BBD(95.7%,45/47),NMBC(96.4%,80/83),MBC(98.1%,105/107),PMLN(90.7%,97/107),MBC组织中NDRG1阳性表达率显著高于PMLN中阳性表达率(P=0.021)。NDRG1与组织学分级相关(P=0.041),即分化越差的癌表达NDRG1越强。NDRG1的表达状态与乳腺癌患者的生存预后无显著性相关(P=0.196)。结论:NDRG1表达与乳腺癌淋巴结转移和分化有一定关系。

  • 标签: N-myc下游调节基因1 乳腺癌 临床病理
  • 简介:美国能源部阿贡国家实验室研究人员表示,通过与中国和新加坡的同行开展合作,他们成功获得了H5N1禽流感病毒中最重要的一种蛋白的晶体和特征结构,并发现如能阻断该蛋白中的两种亚单元的结合,将有望找到对付流感病毒的新药或疫苗。

  • 标签: H5N1禽流感病毒 结构特征 蛋白 科学家 国家实验室 美国能源部
  • 简介:目的探讨睾丸内注射法pEGFP-N1在精细胞的整合和在早期胚胎中表达.方法选择4头本地山羊,双侧睾丸注射不同剂量质粒DNApEGFP-N1,注射后PCR和Southern杂交检测pEGEP-N1在精子中的整合.结果pEGFP-N1整合到精子基因组中,转染效率最高发生在注射后第40天,转染阳性率最高为81%;绿色荧光蛋白在精子及其体外受精的部分胚胎中表达,胚胎阳性率最高的达66.7%.结论通过睾丸内注射pEGFP-N1能整合进入精子基因组,并能通过体外受精在山羊早期胚胎中表达;睾丸内注射法可能是一种可行、简单并利于推广的制备转基因山羊的方法.

  • 标签: 早期胚胎 精子 睾丸 表达 体内 绿色荧光蛋白
  • 简介:为了研究禽流感H5N1病毒在各个器官的增殖和病理变化,在生物安全实验室,我们将禽流感H5N1病毒通过尾静脉接种BALB/C小鼠。结果小鼠在不经过适应的情况下,直接感染发病,甚至死亡。在观察的7天内,感染小鼠临床症状主要表现呼吸急促,体温、体重下降。尸检表现肺出血,心外膜坏死以及肝脏的坏死。组织病理检查表现心、肝、肺等多器官的病变。肺的病变伴有纤维化的弥漫性肺泡损伤;心肌外膜大量淋巴细胞浸润、坏死;肝细胞大量坏死,淋巴细胞浸润。心、肝的坏死病变在H5N1禽流感病毒相关的研究中未见报道。经过对各个组织器官的病毒载量的检测,未发现病毒在各个病变组织中的复制。免疫组化的检测,各个组织中也未检出阳性的细胞反应。因此,我们认为H5N1禽流感病毒感染小鼠引起多个器官组织的损伤,甚至死亡,不是病毒在器官的复制,而可能是病毒感染小鼠,产生炎症细胞因子的高度表达,损伤多个器官组织所致。

  • 标签: 禽流感H5N1病毒 BALB/C小鼠 尾静脉接种 多器官病变