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217 个结果
  • 简介:葡萄砧木具有抗葡萄根瘤蚜和线虫等土传虫害、抗寒、抗旱、耐盐碱等优良特性,可调控葡萄生长和品质,利用葡萄抗逆砧木进行嫁接栽培已成为葡萄产业发展的必然趋势。因此,开展葡萄砧木改良研究具有十分重要的意义。随着生物技术的发展,DNA分子标记技术已广泛应用于葡萄砧木改良研究,本文对近10年分子标记技术在葡萄砧木品种鉴定、系谱分析、遗传图谱构建等方面的研究应用进行了综述,并指明未来葡萄砧木的研究方向。

  • 标签: 葡萄砧木 DNA分子标记 品种鉴定 系谱分析 遗传图谱
  • 简介:介绍了目前已在木耳属真菌中广泛应用的几种DNA分子标记技术(RFLP、RAPD、AFLP、ISSR、SRAP、SCAR、ITS、IGS),以及这些标记在木耳属真菌系统发育、分类研究、种间和种内鉴定、遗传多样性分析等方面的应用,并展望了这些标记技术在木耳属真菌中的应用前景。

  • 标签: 木耳属 系统发育 遗传多样性 基因定位
  • 简介:目的建立并评价FTA-DNA直接提取法在病原真菌分子鉴定中的应用。方法采用whatmanFTA-DNA直接提取法从25个不同种属的45株培养的菌株和6例临床标本中提取病原真菌DNA,用于病原真菌的测序鉴定。配制不同浓度的孢子悬液探索该方法的检测限和安全性。结果45株菌株扩增后均能得到1条清晰的DNA扩增片段,并成功测序。应用该方法亦成功从腹水、胸水、口腔拭子、宫颈拭子来源的临床标本中直接提取DNA并成功鉴定病原真菌。该DNA提取方法联合降落PCR能检测到1.0×103个cell/mL的孢子悬液,1.0×104个cell/mL及以下浓度的孢子悬液可以被FTA卡完全灭活。结论FTA-DNA直接提取法可快速有效地从培养的菌株及部分临床标本中提取并保存病原真菌DNA,用于病原真菌的测序鉴定。

  • 标签: 真菌 分子鉴定 FTA卡 DNA提取方法
  • 简介:文中综述了核糖体基因在黏菌分子系统学研究中应用现状,并就目前黏菌分子系统中存在的问题及发展方向提出了看法。

  • 标签: 黏菌 分子系统学 核糖体DNA
  • 简介:CleavageofchromosomalDNAintooligonucleosomalsizefragmentsisanintegralpartofapoptosis.ElegantbiochemicalworkidentifiedtheDNAfragmentationfactor(DFF)asamajorapoptoticendonucleaseforDNAfragmentationinvitroGeneticstudiesinmicesupporttheimportenceofDFFinDNAfragmentationandpossiblyinapoptosisinvivo.RecentworkalsosuggeststheexistenceofadditionalendonucleasesforDNAdegradation.Understandingtherolesofindividualendonucleasesinapoptosis,andhowtheymightcoordinatetodegradeDNAindifferenttissuesduringnormaldevelopmentandhomeostasis,aswellasinvariousdiseasedstates,willbeamajorresearchfocusinthenearfuture.

  • 标签: 细胞凋亡 DNA断裂 核酸内切酶
  • 简介:<正>Apoptosisisahighlyregulatedphysiologicalprocesscriticalindevelopmentandtissuehomeostasis.Abnormalapoptosiscanleadtodiseaseconditionsincludingneurodegeneration,autoimmunityandcancer.DNAfragmentationisanintegralpartofapoptosisandhaslongbeensuspectedtobeofcriticalimportanceincleaninguppotentiallyantigenicDNAandgeneticmaterialcapableofinducingneoplasmictransformationinneighboringcells.DirectevidenceforthisfunctionofDNAfragmentationhowever,isstilllacking.TheidentificationofaheterodimericDNAfragmentationfactor45and40(DFF45andDFF40,alsocalledICADforInhibitorofCaspaseActivatedDNaseandCADforCaspaseActivatedDNaserespectively)aswellas

  • 标签: 细胞凋亡 DNA断裂 体内稳态
  • 简介:[背景]西花蓟马于2003年入侵中国后,迅速传播扩散并在局部区域造成严重危害,对我国蔬菜、花卉及果树产业的健康发展构成了巨大威胁.[方法]以线粒体DNA标记技术,对采自我国13个省(市)不同地理区域西花蓟马种群的175条COⅠ基因进行序列变异及群体遗传结构分析.[结果]试验共检测到13个单倍型,各地理种群西花蓟马的单倍型多样性Hd较高,为0.691,而核苷酸多样性π较低,为0.00652.总体固定指数Fst为0.24359,基因流Nm为0.78;种群之间固定指数和基因交流分析表明,我国各地理种群间可能出现了一定分化.种群间AMOVA分析显示,我国西花蓟马的遗传变异主要来自种群内部.对国内外不同地理种群COⅠ基因序列的单倍型进行聚类分析表明,我国西花蓟马有2个品系,即温室品系和羽扇豆品系,其中羽扇豆品系来源于新西兰和荷兰,而广泛存在的温室品系存在多个入侵来源.[结论与意义]我国西花蓟马各地理种群的发生,既与国际贸易活动有关,又与国内蔬菜、花卉、水果等的调运以及观光旅游密不可分.研究结果对西花蓟马的有效阻截及其种群扩张趋势监测意义重大.

  • 标签: 西花蓟马 线粒体DNA 基因变异 遗传结构 地理种群 单倍型
  • 简介:AsthetopologicalpropertiesofeachspotinDNAmicroarrayimagesmayvaryfromoneanother,weemployedgranulometriestounderstandtheshape-sizecontentcontributedduetoasignificantintensityvaluewithinaspot.Analysiswasperformedonthemicroarrayimagethatconsistedof240spotsbyusingconceptsfrommathematicalmorphology.Inordertofindoutindicesforeachspotandtofurtherclassifythem,weadoptedmorphologicalmultiscaleopenings,whichprovidedmicroarraysatmultiplescales.Successiveopenedmicroarraysweresubtractedtoidentifytheprotrusionsthatweresmallerthanthesizeofstructuringelement.Spot-wisedetails,intermsofprobabilityoftheseobservedprotrusions,werecomputedbyplacingaregularlyspacedgridonmicroarraysuchthateachspotwascenteredineachgrid.Basedontheprobabilityofsizedistributionfunctionsoftheseprotrusionsisolatedateachlevel,weestimatedthemeansizeandtextureindexforeachspot.Withthesecharacteristics,weclassifiedthespotsinamicroarrayimageintobrightanddullcategoriesthroughpatternspectrumandshape-sizecomplexitymeasures.Thesesegregatedspotscanbecomparedwiththoseofhybridizationlevels.

  • 标签: DNA 斑点 图像 微阵列 数学形态学 粒度分析
  • 简介:Apoptosiscanbetriggeredbyavarietyofstimuliincludingdeathfactors,anti-cancerdrugsandfactor-deprivation.Theseapoptoticcellsareswiftlyphagocytosedbymacrophagestopreventthereleaseofnoxiousorinflammatorymaterialsfromdyingcells.ThemolecularanalysisofFasligand(adeathfactor)-inducedapoptosisindicatedthatacascadeofproteases(caspases)isactivatedduringthisprocess,whicheventuallyactivatesaspecificDNase(caspase-activatedDNase).CADexistsasacomplexwithitsinhibitor(ICAD)inproliferatingcells.Whenthecellsaretriggeredtoapoptosis,caspases,inparticularcaspase3,inthedownstreamofthecaspasecascadecleaveICAD,whichreleasesCADtocauseDNAdegradationinnuclei.

  • 标签: 细胞凋亡 蚕噬作用 染色体DNA损毁
  • 简介:质粒载体在基因治疗中占据重要地位。传统质粒DNA在真核生物中可能会引起严重的炎症反应,未甲基化的CpG序列可能抑制基因的表达,最好的解决办法是在生产质粒载体过程中将细菌调控序列整体消除。微环DNA是一种新颖的小环超螺旋表达框,它是传统质粒在大肠杆菌体内通过位点特异性重组得到的。微环DNA缺乏抗性标记基因、复制原点等细菌序列,增强了在临床上的安全性。体内、外研究表明,微环DNA提高了转基因表达效率。我们就重组酶系统及微环DNA的生产、纯化和转染效率等方面的研究进行了综述

  • 标签: 微环DNA 纯化 重组酶 进展
  • 简介:The2004SoutheastAsiaTsunamikillednearly5,400peopleinSouthernThailand,includingforeigntouristsandlocalresidents.TorecoverDNAevidenceasmuchaspossiblefromtheseriouslydecomposedbodies,weexploredproceduresofsamplepreparationfrombothboneandtoothsamplesaswellasbothmitochondrialandnuclearmarkers.DespitehavingfailedtorecoverenoughDNAfornuclearmarkertyping,wesucceededinobtainingfullyinformativeresultsformitochondrialmarkers(HV1andHV2)from258toothsampleswithasuccessrateof51%(258/507).UsinganorganicDNAextractionmethodcoupledwithanultrafiltrationstep,weobtained16STR(including13CODISloci,onesexdiscriminationlocus,andtwoIdentifilerloci)profilesfor834sampleswithasuccessrateof79%(834/1,062).Inaddition,bycomparingtheallelicfrequenciesbetweenthetypedsamplesasagroupandotherindexpopulations,weconcludethattheThaitsunamivictimsareacombinedgroupofseveralpopulations.Ourresultsprovidevaluableevidenceandprotocolsforthefutureforensicpractice.

  • 标签: 海啸 泰国 鉴定技术 DNA 线立体
  • 简介:Eelfamilyisahugeone,inwhichmanykindsofeelsespeciallysomemigratoryeels,bearstrongresemblancetoeachother,andarethereforedifficulttobeidentified.Inthisstudy29randomprimerswereusedtomakeRAPDanalysisforJapaneseseel(Anguillajaponica),Europeaneel(Anguillaanguilla)andPikeeel(Muraenesoxcinereus).Andtotally299fragmentswerecounted.Sharedorspecificfragmentswerecountedandgeneticsimilarityorgeneticdistancewerecalculated.ThegeneticsimilaritybetweenJapaneseeelandPikeeelis0.68andthegeneticdistancebetweenthemis0.32;thosebetweenEuropeaneelandPikeeelare0.72and0.28respectively,andbetweenJapaneseeelandEuropeaneelare0.74and0.25respectively.Themethodhasbeenshowntobesuitabletomolecularidentificationofeels.Itprovidesanalternativeapproachtodeterminetherelationshipbetweenspecies.

  • 标签: 随机扩增多态性DNA分析 鳗鱼 种类 遗传距离 分类
  • 简介:DNA聚合酶III是为DNA的复制负责的五eubacterialDNA聚合酶之一双。在DNA聚合酶III核心酶的十个子单元之中,高山哈子单元两个都为polymerizing催化反应DNA海滨。在这研究,我们提取了高山的genomic序列哈从159的子单元定序eubacterial染色体,并且执行了基于顺序的种系发生、结构的分析。我们发现所有eubacterial染色体有至少一座高山哈子单元,哪个形式homodimers或heterodimers。种系发生并且领域高山的结构的分析以及拷贝数字变化哈在每个细菌的子单元显示高山的分类哈子单元进四个基本的组:polC,dnaE1,dnaE2,和dnaE3。这个分类具有在染色体作文分析的本质。我们也巩固了命名惯例在基因注解避免进一步的混乱。

  • 标签: 真细菌 DNA聚合酶Ⅲ Α亚基 基因组 氨基酸序列 比较分析
  • 简介:在源于mitochondrial机能障碍的氧化phosphorylation的改变长被假设了涉及tumorigenesis。线粒体最近被显示了在调整规划房间死亡和房间增长起一个重要作用。而且,mitochondrialDNA(mtDNA)变化在各种各样的癌症房间被发现了。然而,在tumorigenesis的这些mtDNA变化的角色仍然保持大部分未知。这评论集中于基本mitochondrial遗传,mtDNA变化和与癌症联系的结果的mitochondrial机能障碍。潜在的分子的机制,调停从mtDNA变化的致病和到tumorigenesis的mitochondrial机能障碍也被讨论。

  • 标签: 线粒体DNA突变 功能障碍 程序性细胞死亡 分子机制 氧化磷酸化 MTDNA
  • 简介:将个体DNA提取出来后,按一定方式进行混合,构成混合DNA样品池。这种混合DNA样品可用于病因未明的遗传性及遗传易感性疾病的研究。在研究常染色体隐性遗传性耳聋致病基因时,发现与染色体9q的D9S922和D9S301位点有相关性。此方法比通常的连锁分析法省时省力。在肿瘤相关基因或责任基因的研究、法医学的个体认定、基因突变的检测等方面均显示出实用性,值得推广

  • 标签: DNA池 基因诊断
  • 简介:生物安全研究的范畴涉及任何由生物威胁所造成的风险。随着害虫优先考虑级别的不断变化,以及国家和部门间相互协作的不断加强,对DNA分子鉴定技术的标准化提出了更迫切的要求,而DNA条形码的出现为此类问题的解决提供了很好的机遇。我们以前人对毒蛾和果蝇的研究为例,比较了DNA条形码技术与PCR-RFLP等传统方法的鉴定效果,在此基础上提出了建立一个可对不同入侵种进行快速和准确鉴定的条形码技术平台的构想。

  • 标签: DNA条形码 生物安全 入侵种 物种鉴定
  • 简介:目的:拼接DNA片段并克隆。方法:用T4DNA连接酶将DNA片段以平末端随机连接,随后用限制性内切酶切割,琼脂糖电泳分离酶切产物,挑选特定片段纯化回收,与线性化的载体质粒连接,转化大肠杆菌感受态细胞。结果:通过以上步骤,成功拼接了不同DNA片段,构建了含有目的拼接片段的重组质粒。结论:该方法简便、易行、可靠,可作为拼接、克隆DNA的备选方案,在分子生物学研究和基因工程中应用。

  • 标签: 平末端DNA 随机连接 DNA拼接 基因克隆
  • 简介:Humanpolymorphonuclearleukocytes(PMN)havebeenreportedtocompletelylackofDNA-dependentproteinkinase(DNA-PK)whichiscomposedofKuproteinandthecatalyticsubunitDNA-PKcs,neededfornonhomologousend-joining(NHEJ)ofDNAdouble-strandbreaks.PromyelocyticHL-60cellsexpressavariantformofKuresultinginenhancedradiationsensitivity.ThisraisesthequestioniflowefficiencyofNHEJ,instrumentalforthecellularrepairofoxidativedamage,isanormalcharacteristicofmyeloiddifferentiation.HereweconfirmedthecompletelackofDNAPKinPMNproteinextracts,andtheexpressionofthetruncatedKu86variantforminHL-60.However,thisdegradationofDNA-PKwasshowntobeduetoaDNA-PK-degradingproteaseinPMNandHL-60.Inaddition,byusingaprotease-resistantwholecellassay,bothKu86andDNA-PKcscouldbedemonstratedinPMN,suggestingthepreviouslyreportedabsenceinPMNofDNA-PKtobeanartefact.ThelevelsofKu86andDNA-PKcsweremuchreducedinPMN,ascomparedwiththatofthelymphocytes,whereasHL-60displayedamarkedlyelevatedDNA-PKconcentration.Inconclusion,ourfindingsprovideevidenceofreduced,notdepletedexpressionofDNA-PKduringthematurestagesofmyeloiddifferentiation.

  • 标签: 粒细胞 人类 蛋白激酶 基因修复 表达 非同源末端连接