简介:摘要目的构建预测电离辐射诱导DNA双链断裂(DSB)水平的随机森林分类模型,初步研究DSB在基因组中的分布规律。方法将GRCh38参考基因组分为50 kb的片段,根据MCF-7细胞的测序数据把片段分为电离辐射诱导的DSB低水平和高水平区域,以8种表观遗传学特征作为输入,随机将数据集的2/3列为训练集,1/3列为测试集,构建含100棵决策树的随机森林分类模型。分析分类模型中表观遗传学的特征重要性,展示这些标记在不同DSB水平区域的富集差异。结果随机森林分类模型在测试集上预测的准确率为99.4%,精准率为98.9%,召回率为99.9%,受试者操作特征曲线下面积为0.994。8个特征中H3K36me3和DNase标记的重要性最高,富集分析表明DSB高水平区域的这两类标记明显高于DSB低水平区域。结论以表观遗传学数据作为特征输入,随机森林分类模型可在50 kb基因组区域上准确预测电离辐射诱导的DSB水平,分析表明这些DSB可能主要分布在基因组中转录活跃的部位。
简介:摘要目的研究DNA双链断裂(DNA double-strand breaks,DSB)修复能力的影响因素及其与分化型甲状腺癌(DTC)发生风险的关系。方法回顾性分析河南省肿瘤医院2020年1月至3月收治的140例甲状腺疾病患者,其中男性26例,女性114例,年龄18~78岁。依据病理结果将患者分为DTC组(90例)与对照组即甲状腺良性结节(benign thyroid nodules,BTN)组(50例),应用流式细胞仪测定所有患者外周血T淋巴细胞的DSB修复能力,通过Wilcoxon秩和检验对2组数据进行比较,评估DSB修复能力与DTC发生风险的关系。并根据BTN组DSB修复能力中位数将DSB修复能力分为高和低2组,采用Logistic 回归法对可能影响DSB修复能力的因素进行分析。采用SPSS 22.0软件对数据进行统计学分析。结果DTC组的DSB修复能力中位数为27.87%,BTN组中位数为36.75%,DTC组的DSB修复能力低于BTN组,差异有统计学意义(Z=-3.999,P<0.05);通过Logistic 回归分析发现DTC患者比BTN患者的DSB修复能力低(OR=2.245,95%CI:1.067~4.725,P=0.033),有辐射暴露史的人群DSB修复能力降低(OR=2.698,95%CI:1.271~5.725,P=0.010)。结论DSB修复能力较低的人患DTC的风险可能增加,辐射暴露可能是DSB修复能力降低的危险因素。
简介:AventadorLP700-4还是延续了Lamborghini的一贯设计风格,显得粗犷而霸气,浑身充满了如蛮牛般的力量。而从整体感觉上,我们也能从其身上看到Murcielago、Renventon以及SestoElementoConcept的影子。
简介:一三月初的一个黄昏,跟着父亲学习古老石匠技术的索拉杰同父亲及他们村上几个年青人一起从知莫乡年克村去到银河乡木尔基沟的冉斯则村。他个子不太高,长相也不太漂亮,穿着一件灰色有些破旧的毛衣,外面套着一件藏族男人们出门时爱穿的既保暖又防湿的毪衫,棕色,衫子的边嵌着色彩鲜明的氆氇。一条紫红色的绸腰带很随意地拴在腰间,在腰后面露
简介:CleavageofchromosomalDNAintooligonucleosomalsizefragmentsisanintegralpartofapoptosis.ElegantbiochemicalworkidentifiedtheDNAfragmentationfactor(DFF)asamajorapoptoticendonucleaseforDNAfragmentationinvitroGeneticstudiesinmicesupporttheimportenceofDFFinDNAfragmentationandpossiblyinapoptosisinvivo.RecentworkalsosuggeststheexistenceofadditionalendonucleasesforDNAdegradation.Understandingtherolesofindividualendonucleasesinapoptosis,andhowtheymightcoordinatetodegradeDNAindifferenttissuesduringnormaldevelopmentandhomeostasis,aswellasinvariousdiseasedstates,willbeamajorresearchfocusinthenearfuture.