简介:摘要目的探讨单泛素化组蛋白H2B(H2Bub)在食管癌组织中的表达及其与预后的相关性。方法选取2010年5月至2015年12月在山西省肿瘤医院行胸段食管癌根治术的患者75例,用免疫组织化学法检测食管癌及癌旁组织H2Bub蛋白的表达水平。分析H2Bub表达水平与患者临床病理特征的关系,采用Kaplan-Meier法分析H2Bub表达水平与生存的关系。结果食管癌及癌旁组织中H2Bub蛋白均阳性表达,但癌组织中无弱阳性表达者,癌旁组织中有弱阳性表达者;癌组织H2Bub强阳性表达率为84.0%(63/75),高于癌旁组织的22.7%(17/75)(χ2=34.68,P<0.001)。同癌旁组织相比,癌组织中64.0%(48/75)H2Bub表达上调,2.7%(2/75)表达下调。癌组织H2Bub较癌旁组织表达上调与患者性别、年龄、肿瘤长径、淋巴结是否转移、T分期均无关(均P>0.05),而低分化癌组织中H2Bub表达上调患者比例低于中分化和高分化癌组织[43.8%(7/16)比66.7%(34/51)、87.5%(7/8),P=0.037]。H2Bub中等阳性(12例)和强阳性(63例)表达的食管癌患者中位总生存时间分别为70个月(95% CI 45~95个月)、68个月(95% CI 54~82个月),差异无统计学意义(P=0.606);癌组织H2Bub表达较癌旁组织上调的48例患者中,食管癌低分化组(7例)中位总生存时间短于高分化组(7例)及中分化组(34例)[36个月(95% CI 24~37个月)比68个月(95% CI 38~98个月)、68个月(95% CI 44~91个月)],差异均有统计学意义(均P<0.05)。结论与癌旁组织相比,食管癌组织中H2Bub表达水平上调;低分化食管癌患者H2Bub表达水平上调明显,且预后差。
简介:摘要目的利用生物信息学鉴别与食管鳞癌预后及免疫相关的长链非编码RNA(lncRNA),并构建预后风险模型。方法从癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载食管鳞癌患者的转录组数据及临床资料。从分子数据库得到免疫基因,与转录组数据取交集得到免疫相关基因。使用相关性分析得到免疫相关lncRNA。通过单因素COX分析获得与预后相关的免疫lncRNA。依据这些lncRNAs在样本中的表达量,构建COX预后风险评分模型,计算风险值。依据风险值,区分出高低风险组。通过受试者工作特征曲线(ROC)比较曲线下面积,评估模型的有效性。结果从TCGA数据库下载得到95例食管鳞癌样本,免疫基因与转录组数据取交集得到免疫相关的基因331个。通过相关性分析和单因素COX分析得到6个显著与预后相关的免疫lncRNA(分别为LINC02159、AC092484.1、AC099850.3、AC125807.2、AC105277.1和AC037459.3),并构建基于这6个lncRNA的预后风险模型,依据患者的风险值,以中位数为临界点,将患者分为高低风险组。通过生存分析比较5年生存率,发现高风险组的生存率显著低于低风险组(P<0.01)。ROC曲线结果表明曲线下面积(AUC)为0.844。结论免疫预后相关lncRNA可以预测食管鳞癌患者的预后,并为食管鳞癌免疫相关lncRNA研究及治疗提供线索。