实时荧光定量 PCR在病毒检测中的应用效果评价

(整期优先)网络出版时间:2020-08-10
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实时荧光定量 PCR在病毒检测中的应用效果评价

于启波

黑龙江省绥化市北林区疾病预防控制中心,黑龙江绥化 152072

【摘要】目的:评价实时荧光定量PCR在病毒检测中的应用效果。方法:研究我中心2019年3月~2019年9月期间纳入的158例疑似HFMD患者,研究中使用到的核酸检测仪器选取ABI-7300进行FQ-PCR检测,观察并分析FQ-PCR检测病毒发生情况。结果:经检测,158例疑似HFMD患者中,FQ-PCR检测的EV阳性确诊为115例,阳性率72.78%,其中EV71RAN阳性有109例,CA16PNA检测的阳性53例;而ELISA检测出的EV阳性确诊为63例,阳性率39.87%,两者差异大,P<0.05。15例HFMD患者实行FQ-PCR检测到的EV阳性12例,而ELISA检测6例阳性数,差异显著,P<0.05。结论:实行FQ-PCR检测对HFMD病毒检测率提升,值得临床进一步研究。

【关键词】病毒检测;实时荧光定量;PCR;应用效果;评价

Evaluation of the application of real-time fluorescent quantitative PCR in virus detection

Yu Qibo

(Center for Disease Control and prevention, Beilin District, Suihua City, Heilongjiang Province, 152072)

[Abstract] Objective: To evaluate the application effect of real-time fluorescent quantitative PCR in virus detection. Methods: 158 suspected HFMD patients in our center from March 2019 to September 2019 were studied. Abi-7300 was selected for FQ-PCR detection by the nucleic acid detection instrument used in the study. The occurrence of virus detected by FQ-PCR was observed and analyzed. Results: of 158 suspected HFMD patients, 115 were confirmed to be ev positive by FQ-PCR, with a positive rate of 72.78%, of which 109 were ev71ran positive and 53 were ca16pna positive, while 63 were confirmed to be ev positive by ELISA, with a positive rate of 39.87%, with a large difference (P<0.05). There were 12 EV positive cases detected by FQ-PCR in 15 HFMD patients, and 6 EV positive cases detected by ELISA, the difference was significant (P<0.05). Conclusion: FQ-PCR can improve the detection rate of HFMD virus, which is worthy of further clinical study.

[Key words] virus detection; real-time fluorescence quantification; PCR; application effect; evaluation

肠道病毒(简称EV)是一种不存在包膜的小核糖核酸(RNA)病毒,依照血清学可分成脊髓灰质炎病毒、埃可病毒、肠道病毒68-71型及柯萨奇等67各血清型[1]。临床中,手足口病(简称HFMD)作为临床常见疾病,其病原体主要是由肠道病毒71型(EV71)及柯萨奇A16(CA16)构成,而EV71不仅能够引发HFMD疾病,还会严重影响中枢神经系统[2],诱发其他并发症(如脑膜炎、急性迟缓性瘫痪等等)[3],对人类的生命安全造成不同程度的损害[4]。为快速查明病因,及时控制病情,获得最佳治疗方案和时间,实行有效的检测方式对病情的后期治疗显得尤为重要

[5]。本文就此针对HFMD患者实行实时荧光定量PCR(FQ-PCR)检测,研究筛选2019年3月~2019年9月收治的158例疑似HFM患者,分析该检测方式对HFMD病毒的检测情况,正文报道叙述如下:

1 资料和方法

1.1临床资料

研究我中心2019年3月~2019年9月期间纳入的158例疑似HFMD患者,收集患者粪便7份、咽拭子128份、血清4份以及疱疹液19份,同时采集患者的血清。其中,男性69例,女性45例,年龄在0.8~6岁,平均年龄(3.4±1.02)岁。此外,选取某托幼机构中同HFMD患者有亲密接触的儿童,收集其咽拭子及血清各33份。所有标本施行病毒学培养,并将采集到的血清施行FQ-PCR和ELISA两种方式进行检测。而同HFMD接触的患者选取15例进行送检,实行ELISA法检测。

1.2方法

研究中使用到的核酸检测仪器选取ABI-7300进行FQ-PCR检测,而检测用到的试剂则由本中心内提供,病毒分离细胞是人横纹肌瘤肉RD细胞,而ELISA检测法则选用EV71IgG及CA16IgG试剂进行测定。具体措施如下:

将收集到的粪便、咽拭子、疱疹痰液标本放置装有生理盐水的容器中搅拌几次,随后行病毒学培养标本置于病毒保存液中,暂时存放需在-20℃环境,若需长久存放则应放置在-70℃环境下。

1.3观察指标

观察并分析FQ-PCR检测病毒发生情况。

1.4统计学处理

应用SPSS19.0统计学软件进行数据处理,P<0.05,差异显著。

2 结果

2.1 对比FQ-PCR和ELISA检测EV病毒情况

经检测,158例疑似HFMD患者中,FQ-PCR检测的EV阳性确诊为115例,阳性率72.78%,其中EV71RAN阳性有109例,CA16PNA检测的阳性53例;而ELISA检测出的EV阳性确诊为63例,阳性率39.87%,两者差异大,P<0.05。详见表1。

表1:FQ-PCR和ELISA检测EV病毒比较分析表(n,%)

项目

例数

EV

阳性率

FQ-PCR

158

115

72.78(115/158)

ELISA

158

63

39.87(63/158)

X2

-

-

34.785

P

-

-

0.001

2.2 对比密切接触患者的儿童FQ-PCR检测EV

15例HFMD患者实行FQ-PCR检测到的EV阳性12例,而ELISA检测6例阳性数,差异显著,P<0.05,详见表2。

表2:密切接触患者的儿童FQ-PCR检测EV比较分析表 (n,%)

组别

例数

核酸检测

抗体检测

阳性

阴性

阳性

阴性

标本培养阳性

10

10

0

7

3

标本培养阴性

5

0

5

1

4

3 讨论

HFMD是一种传染性强的疾病,属于世界性的疾病。该病主要是受粪便、咽喉分泌物、疱疹液及唾液中的病毒传播导致[6]。通常情况下,该病病症较轻,但随着病情的持续发展,患者的呼吸系统、中枢神经系统均会出现不同程度的损伤,严重可导致死亡,对患者的生命安全造成严重伤害[7]。该病多体现在神经系统等症状,且早期症状并不明显,因而患者及其家属往往会忽视,从而延误最佳治疗时机。为此,实行有效的早期检测对诊断病情具有重要意义[8]

随着医疗检测技术的不断发展,实时荧光定量PCR(简称FQ-PCR)技术属于一种新兴的检测手段,主要针对病原体核算进行的快速检测法,具有定量、快速、敏感度高及特异性强等特点,自动化程度明显,能够完全闭关操作,具有无污染、耗时短、灵敏度高等优势,可在HFMD潜伏期便能检测出是否存在手足口病病毒,继而避免病情的发展,提高检测率[9]

总而言之,实行FQ-PCR检测对HFMD病毒检测率提升,值得临床进一步研究。

参考文献

[1]罗周正,张丽艳,李贺,杜波.探讨实时荧光定量PCR仪用于流感病毒检测的效果分析[J].中国医药指南,2020,18(16):96-97.

[2]干驰,莫茜,陶悦.PCR技术在病原菌诊断中的研究进展[J].中国实验诊断学,2020,24(04):683-687.

[3]修敏,任妍妍.实时荧光定量PCR与细胞培养法在流感病毒检测中的比较[J].传染病信息,2019,32(04):336-337+340.

[4]王倩,党一兵,李天顺.手足口病检测中应用实时荧光定量PCR的应用效果[J].中国医疗器械信息,2019,25(14):62-63.

[5]高鑫,朱武洋,卢学新.实时荧光定量PCR在病毒检测中的应用[J].中国人兽共患病学报,2018,34(07):660-667.

[6]王瑞雪.实时荧光定量RT-PCR在麻疹病毒检测中的应用价值[J].河南医学研究,2018,27(05):839-841.

[7]刘丽,等.手足口病检测中应用实时荧光定量PCR的应用效果[J].当代医学,2018,24(05):18-20.

[8]王林,李亚波,王中秋.实时荧光定量PCR、细胞培养法在流感病毒检测中的对比分析[J].中国卫生检验杂志,2016,26(19):2791-2793.

[9]张桂花.荧光定量PCR法对手足口病病原学诊断价值[J].辽宁医学杂志,2015,29(03):202-203.