简介:摘要目的了解浙江省丽水市一例输入新型冠状病毒(SARS-CoV-2)感染核酸复阳病例的基因组序列特征及变异情况。方法采集该患者的咽拭子和深咳痰液样本,对样本进行病毒核酸提取和实时荧光定量PCR检测,采用高通量测序法对病毒基因组开展测序,对序列进行比对和分析,构建系统进化树,鉴定特异性突变位点。结果获得长度为29 815 bp的SARS-CoV-2基因组序列,覆盖病毒编码区全长。同武汉参考株(MN908947)序列相比,存在13个核苷酸突变及一段19 bp长度的缺失,13个核苷酸变异位点没有聚集性。该序列包含了D614G突变,与我国国内本土病例相关性较远,特征符合L基因型欧洲进化分支B.1.1特点,不含有最近南非和英国报道的新型变异毒株的氨基酸关键性突变位点。结论该例SARS-CoV-2感染核酸复阳病例为西班牙输入病例,病毒基因组序列属于L基因型欧洲进化分支B.1.1。
简介:摘要目的分析胰腺癌组织富含亮氨酸重复序列蛋白55(LRRC55)基因mRNA表达和启动子区甲基化状态并探讨其临床意义。方法收集2019年5月至2021年5月间海军军医大学第一附属医院普外科37例行手术切除并经病理学证实的胰腺导管腺癌组织及其癌旁正常组织。另收集2例正常胰腺组织标本、2例健康成人外周血标本作为对照。记录患者的年龄、性别、肿瘤部位、肿瘤大小、分化程度、临床分期、是否淋巴结转移及血CEA、CA19-9水平。采用亚硫酸氢盐测序法(BSP)检测2例胰腺癌组织及癌旁组织、2例正常胰腺组织、2株胰腺癌细胞株(PaTu8988、ASPC1)LRRC55基因启动子区CpG岛甲基化状态。应用实时定量PCR法检测35例胰腺癌及癌旁组织LRRC55基因mRNA的表达水平,并分析其与胰腺癌临床特征之间的关系。结果胰腺癌组织和胰腺癌细胞株LRRC55基因启动子区CpG岛呈高甲基化状态,平均甲基化率分别为53%、71%,而癌旁组织和正常胰腺组织LRRC55基因为低甲基化状态,平均甲基化率分别为8%、11%;胰腺癌组织和对应癌旁胰腺组织LRRC55基因mRNA的相对表达量分别为0.21(0.02,1.00)、0.98(0.33,3.66),胰腺癌组织LRRC55基因mRNA表达量显著低于癌旁组织,差异有统计学意义(P=0.003)。相关性分析结果显示,胰腺癌组织LRRC55基因mRNA表达与肿瘤分化、CEA显著相关,而与患者年龄、性别、肿瘤部位及大小、CA19-9水平、有无淋巴结转移及临床分期均无相关性。结论胰腺癌组织及腺癌细胞株均存在LRRC55基因异常甲基化;LRRC55基因高甲基化与其基因表达降低有关,与胰腺癌组织的分化程度和CEA水平相关。该基因可能是胰腺癌的潜在抑癌基因。
简介:目的探讨血液透析患者脂代谢紊乱的临床特征及低密度脂蛋白受体相关蛋白(LRp)5'端四核苷酸重复序列基因多态性对脂代谢的影响.方法比较血液透析组患者(112例)与对照组(372例)血清TC、TG、HDL-C、低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)、载脂蛋白(Apo)A1、ApoB、ApoE及脂蛋白(Lp)(a)水平,聚合酶链反应-限制性片断长度方法检测LRP5'端四核苷酸重复序列基因多态性.结果血液透析组脂代谢紊乱主要表现为血清TG水平显著增高,HDL-C水平显著降低.血清TG水平高于正常者为37例(33.0%),HDL-C低于正常者为12例(10.7%).血液透析组高血压的发生率为73.6%(78/106),心血管疾病为25.0%(26/104).伴心血管疾病患者TG水平显著高于无心血管疾病患者,伴高血压患者与无高血压患者血脂水平差异无统计学意义.基因多态性分析显示,LRP5'端四核苷酸重复序列基因型91/91、91/87与等位基因91bp频率较高,2组间差异无统计学意义.血液透析组LRP5'端四核苷酸重复序列不同基因型间血脂水平差异无统计学意义.结论TG水平与血清白蛋白水平、透析时体外循环血流量显著相关;HDL-C与尿素清除指数显著相关.LRP5'端四核苷酸重复序列基因多态性对血液透析患者血脂水平无显著影响.
简介:摘要目的观察微小RNA(miRNA,miR)-182通过靶向特定富含AT碱基DNA序列结合蛋白2(SATB2)基因对结直肠癌细胞增殖迁移的作用,探讨其对SATB2/烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸氧化酶4(nox4)通路的调节机制。方法对数期生长人结肠癌细胞(HT-29)细胞,采用脂质体转染法将si-miR-182、Control-si转至HT-29细胞,分别设为Si-miR-182组、N-miR-182组,另取不做任何处理细胞为对照组。测定3组细胞中miR-182基因表达、增殖和迁移、SATB2、nox4、E-钙黏蛋白(E-cadherin)、波形蛋白(Vimentin)mRNA和蛋白表达。重复计量资料比较采用重复测量方差分析,两两样本比较采用LSD-t检验。结果Si-miR-182组miR-182基因相对表达量(0.35±0.05)低于对照组(1.24±0.26)和N-miR-182组(1.20±0.25),差异均有统计学意义(t=7.517、7.455,P<0.05);Si-miR-182组培养24、48、72 h MTT试验吸光度(A)值均低于对照组和N-miR-182组,差异均有统计学意义(24 h:t=2.667、2.664;48 h:t=4.559、4.524;72 h:t=7.257、6.981;P<0.05);与培养24 h比较,3组培养48、72 h MTT试验A值均升高(48 h:t=5.507、5.092、3.741;72 h:t=11.330、10.637、9.229;P<0.05),且72 h MTT试验A值高于48 h,差异均有统计学意义(t=7.411、6.941、5.214,P<0.05)。Si-miR-182组细胞迁移率[(53.90±3.19)%]低于对照组[(81.66±5.92)%]和N-miR-182组[(80.35±5.40)%],差异均有统计学意义(t=9.231、9.430,P<0.05);Si-miR-182组细胞SATB2、E-cadherin mRNA和蛋白相对表达量高于对照组和N-miR-182组(SATB2:t=10.930、11.158;E-cadherin:t=9.288、9.369;P<0.05),nox4、Vimentin mRNA和蛋白相对表达量低于对照组和N-miR-182组,差异均有统计学意义(nox4:t=8.955、7.590;Vimentin:t=6.543、6.644;P<0.05)。结论沉默miR-182基因可显著抑制结直肠癌细胞增殖及迁移能力,可能通过激活SATB2、E-cadherin的表达、抑制nox4、Vimentin的表达、参与SATB2/nox4通路共同调控。
简介:目的探讨液体衰减反转恢复序列(FLAIR)在脑部疾病MRI检查中的应用价值。方法对39例脑部疾病患者同时行MRT2加权像及FLAIR检查,比较两种序列对病灶的显示情况。结果FLAIR共检出病灶225个,常规T2加权像检出109个,FLAIR显示病灶的能力更为清晰,病灶与正常脑组织的对比度更高,在显示脑组织深部皮层下及脑室旁病灶方面更有优势,可显示常规T2加权像未能显示的小病灶。结论FLAIR可作为颅脑MRI检查常规序列的补充,有利于提高病变的检出率,减少漏诊。