简介：摘要目的揭示H9N2亚型禽流感病毒(avian influenza virus, AIV)血凝素(hemagglutinin, HA)基因氨基酸位点的变异情况并探讨其分子进化趋势。方法收集并比对EpiFlu数据库中2020年4月以前H9N2 AIV毒株HA基因序列信息，采用生物信息学的方法分析HA蛋白关键受体结合位点、裂解位点、糖基化位点的氨基酸差异。结果84.92%(4 067/4 809)序列HA226位点的谷氨酰胺(glutamine, Q)被亮氨酸(leucine, L)替代；来自禽类的序列发生HA-Q226 L突变的占84.75%(4 013/4 735)，来自哺乳动物的序列发生HA-Q226 L突变的占72.97%(54/74)；96.26%(4 629/4 809)序列HA蛋白裂解位点基序模式仍保持低致病性AIV的特点，但有180条来自禽类的序列HA蛋白裂解位点插入了2个碱性氨基酸；58.68%(2 822/4 809)序列新增1个或者2个潜在糖基化位点，而66.44%序列(3 195/4 809)丢失糖基化位点HA210-212。结论H9N2亚型AIV HA蛋白受体结合位点趋于结合人类受体，对哺乳动物的适应性增加，HA蛋白裂解位点和糖基化位点有向高致病性AIV的序列特征突变的倾向。

简介：摘要目的了解不同亚型禽流感病毒与不同动物来源红细胞的凝集特性，为流感环境样本监测工作选择更适宜的检测用红细胞。方法选取2009-2016年我国禽流感环境监测中分离到的不同亚型的禽流感毒株，采用红细胞凝集试验，选用5种动物红细胞(鸡、火鸡、豚鼠、马和绵羊)进行检测；应用流式细胞仪检测不同动物红细胞表面唾液酸受体的表达及类型，通过氨基酸序列分析病毒血凝素蛋白受体结合区(receptor binding domain, RBD)的特征。结果本研究共检测了14种亚型的28株禽流感病毒。结果显示所有毒株均能与火鸡和豚鼠红细胞发生凝集，其余红细胞均出现不能与某些毒株产生凝集的现象；其中1株H9N2(A/环境/安徽/43762/2015)毒株与鸡红细胞不产生凝集反应；1株H1N1(A/环境/山东/76972/2014)和2株H9N2(A/环境/重庆/79449/2014和A/环境/安徽/43762/2015)毒株与马红细胞不产生凝集反应；2株H9N2(A/环境/重庆/79449/2014和A/环境/安徽/43762/2015)和2株H13N8(A/环境/青海湖/166/2012和A/环境/青海湖/13/2012)毒株与绵羊红细胞不产生凝集反应。流式检测结果显示在火鸡、鸡和豚鼠红细胞表面可检测到两种类型唾液酸受体α2，3和α2，6，但两种受体表达比例不同；马和绵羊红细胞表面唾液酸受体只检测到表达α2，3。序列分析提示病毒RBD关键区域的氨基酸替换可能是影响病毒红细胞结合特性的重要因素。结论在禽流感病毒检测中，火鸡和豚鼠红细胞在红细胞凝集试验中敏感性最好。不同来源的红细胞其受体表达及类型会显著影响不同亚型禽流感病毒的凝集反应，同时RBD关键区域的氨基酸变化也会影响病毒与不同红细胞的结合。

简介：摘要目的了解贵州省H9N2亚型禽流感病毒(avian influenza virus，AIV)的流行与遗传变异情况，为AIV的防控提供依据。方法统计2018年10月—2019年3月贵州省活禽市场外环境AIV检出情况，对选取的H9N2亚型AIV进行基因组的提取、血凝素(hemagglutinin, HA)基因的RT-PCR扩增与测序，并对获得的HA基因序列进行同源性、遗传进化和关键位点变异分析。结果贵州省活禽市场外环境AIV检出率为52.2%，H9N2占阳性的83.7%。H9N2亚型AIV HA基因的核苷酸和氨基酸同源性分别为91.6%～100.0%和91.0%～100.0%，均属于Y280亚系，G57基因型；与致病性相关的裂解位点序列均为PSRSSRGLF和LSRSSRGLF，符合低致病性AIV的分子特征；与宿主特异性相关的受体结合关键位点存在H191N、E198T/A和Q234L三个位点的突变，具有人样受体结合特征；与毒力相关的糖基化位点均具有7个，其中因突变218位点均存在一个糖基化位点缺失，313位点均存在一个增加。与人感染毒株相比关键位点未发生重要突变。结论贵州省活禽市场外环境AIV检出率较高，污染较严重，且以H9N2为优势流行亚型；H9N2亚型AIV均属于Y280亚系，G57基因型，为低致病性AIV，毒株遗传差异在增大，关键氨基酸位点存在变异，具有感染人的风险，故应加强监测该病毒的分子遗传变异情况。

简介：摘要禽流感病毒（avian influenza virus，AIV）是一种可引起急性呼吸道传染病的人畜共患病毒。自2013年我国出现了全球首例人感染H7N9型AIV病例以来，人们对该病毒产生了担忧与恐慌。AIV在全球广泛传播，人感染不同型别AIV事件也持续发生，造成了巨大的经济损失。目前尚无针对该病的特异性治疗措施与药物，疫苗成为最有可能预防控制病毒传播的手段。现有针对H7N9型AIV的兽用与人用疫苗种类繁多，其中，4类人用H7N9型AIV疫苗已经率先进入了临床试验阶段，主要包括了病毒样颗粒疫苗、减毒活疫苗、灭活疫苗及DNA疫苗，并显示出了良好的安全性和免疫原性。因为暂无上市的人用AIV疫苗，所以其真实效力不得而知。此外，现有的流感疫苗在人群中虽然具有良好的安全性和免疫原性，但对H7N9型AIV并无交叉抗体反应。本文回顾AIV的病原学、流行病学、职业暴露人群调查与防控策略、H7N9型AIV疫苗及H7N9型AIV全人源单克隆抗体研究进展，讨论尚存的问题和挑战以及未来的发展方向，为加深对疾病的了解以及控制AIV在全球的蔓延提供防控策略与方针。

简介：摘要目的分析2013—2020年人感染H7N9禽流感密码子使用偏好及其影响因素。方法通过NCBI数据库获得病毒全基因组序列，使用CodonW、EMBOSS、R、Origin 9.0、SPSS 20.0等软件分析病毒的碱基构成、密码子偏好性参数等。结果H7N9病毒全基因组AU含量高于GC，且AU多出现在密码子末位。2013—2020年AU含量逐渐升高，而GC含量逐渐降低。病毒有效密码子数在48.71~56.17之间，提示病毒密码子使用偏性总体较弱。有效密码子数绘图和密码子适应指数分析显示病毒密码子使用偏好受自然选择和突变压力双重影响，自然选择因素更为明显。结论人感染H7N9禽流感病毒密码子使用偏好仍处在不断适应人类宿主的演化过程中，第五波疫情及后续毒株与既往毒株相比存在更加适应宿主的变化。

简介：摘要目的分析淮南市2016年度外环境标本中H7N9禽流感病毒基因组特征。方法采集活禽市场禽类粪便、笼具、台面或砧板、脱毛机、禽类饮水、污水等标本，选取H7N9、H9亚型PCR检测阳性标本(Ct值≤30)，鸡胚分离培养后提取RNA，扩增8个基因节段进行基因序列测定、分子特征与进化分析。结果2016年150份淮南市外环境标本检出H7N9亚型46份、H9亚型71份、H5亚型38份；2份H7N9亚型分离成功。基因进化分析显示，淮南市2株H7N9禽流感毒株血凝素(hemagglutinin, HA)和神经氨酸酶(neuraminidase, NA)基因均处于长三角分支内，其余6个内部基因无明显地域分布聚类；HA氨基酸受体位点出现G186V、Q226L位点变异，NA茎区缺失了"QISNT"序列，R294K、E119V耐药位点没有发生突变；聚合酶发生PA基因I550L，PB1基因I368V，PB2基因I504V突变；NS1基因出现增强致病力的位点N205S、P42S改变；耐药相关位点出现M1基因N30D、T215A，M2基因S31N突变。结论2016年淮南市活禽市场禽流感病毒高度流行，H7N9亚型感染人类的能力有所增强，M2离子通道抑制剂耐药，NA抑制剂仍为敏感有效药物。

简介：摘要目的开展2016—2018年长沙市人群感染和活禽市场(live poultry markets, LPMs)环境污染H5N6亚型禽流感病毒(avian influenza virus, AIV)监测，为防控人感染H5N6亚型AIV提供实验室数据。方法采集2016—2018年长沙市流感样病例和不明原因肺炎病例咽拭子6 909份及LPMs环境样品1 719份，利用实时RT-PCR进行A型、H5、H7、H9和N6亚型AIV核酸扩增，并对82份AIV核酸阳性样品进行高通量核苷酸测序，然后对测序结果进行BLAST比对和氨基酸(amino acids, aa)关键位点分析。结果从6 909份病例的咽拭子样品中检出H5N6亚型AIV核酸阳性1份，从1 719份LPMs环境样品中检出A型AIV核酸阳性927份(53.93%)，H5N6亚型AIV核酸阳性193份(11.23%)。高通量核苷酸测序获得14株H5N6亚型AIV的基因组序列，aa关键位点分析显示病毒血凝素(hemagglutinin, HA)蛋白连接肽第338～347位出现6个碱性aa，对禽表现为高致病性的分子特征，受体结合位点(receptor binding site, RBS)第238～240位aa(对应H3型流感病毒第226～228位编码aa)为QSG或QRG，受体特征为禽源。神经氨酸酶(neuraminidase, NA)蛋白第290位耐药基因位点aa未出现R290K突变现象，对NA抑制剂(达菲/磷酸奥司他韦)敏感；病毒PB2蛋白发生E627K和D701N(I)突变，表明病毒致病力强。结论长沙市人群感染H5N6亚型AIV为偶发，LPMs环境H5N6亚型AIV污染较重，需要进一步加强LPMs环境AIV监测。

简介：摘要目的对活禽市场家禽中分离的H5N6禽流感病毒(avian influenza virus, AIVs)进行遗传进化和分子特征分析。方法2018年12月于乌鲁木齐市活禽市场采集家禽双腔拭子和环境样本，通过接种鸡胚、血凝试验和RT-PCR等方法分离鉴定AIVs，以甲型流感病毒通用引物扩增病毒全基因组并测序，利用BLAST、Clustal W、MEGA-X和DNAStar等软件进行序列比对、系统进化和分子特征分析。结果从家禽样品中分离到6株H5N6亚型AIVs，其各基因之间的一致性较高(99.4%～100.0%)，为同一来源。BLAST分析显示除NP基因与苏州家禽中分离的H5N6毒株一致性最高(99.7%)，其余7个基因片段均与2017—2018年广东环境中分离的H5N6毒株一致性最高，在99.0%～100.0%之间。遗传进化分析显示分离株的HA属于Clade2.3.4.4.C分支，HA、NA、PB1、PA、NP、MP这6个基因均与2018年自华东地区水貂中分离的H5N6病毒株聚在同一分支，PB2和NS均与2017—2018年于广东环境中分离的H5N6病毒株聚在一起。分离株HA的裂解位点含多个连续的碱性氨基酸，为高致病性AIV，HA的S137A和T160A突变可增强病毒与人源受体SAα2，6-Gal的结合。另外，NA茎部缺失、PB2的L89V、G309D、R477G、I495V、I504V、D391E和A661E以及NS1的P42S、D92E和80～84位氨基酸缺失等突变均可增强病毒对哺乳动物的毒力和致病力。结论分离的6株高致病性H5N6 AIVs与2017—2018年分离自华东地区水貂和广东环境的H5N6 AIVs的遗传关系较近，存在的多个突变可增强病毒对哺乳动物的致病性，存在较大的公共卫生风险。

简介：

简介：摘要目的描述增城区2019年1月至2020年6月年农贸市场中禽流感病毒的污染特征，分析新冠疫情暴发对禽流感病毒市场污染的影响。方法在增城区各街镇农贸市场中抽检禽流感病毒核酸，A型流感病毒阳性的再进行H5、H7、H9分型，采用SPSS26.0进行统计描述。结果共检测了1 978份环境样本，A型流感病毒阳性率为31.24%（618/1 978），其中H9亚型占92.07%（569/618）；2019年与2020年的阳性率无统计学差异（x2=0.052，P=0.082）；不同类型样本中脱毛机内壁的阳性率最高（44.08%），冰柜（箱）内壁最低（13.33%）。结论污染增城区农贸市场的禽流感病毒优势亚型为H9，与活禽直接接触的样本更易检出禽流感病毒。新冠肺炎暴发后环境禽流感病毒阳性率与疫情暴发前没有差异，建议加强对农贸市场的监管力度。

简介：摘要目的了解江苏省首例人感染H9N2亚型禽流感病例的流行病学特点和相应H9N2禽流感病毒血凝素(hemagglutinin, HA)基因特征。方法逆转录聚合酶链反应(reverse transcription polymerase chain reaction, RT-PCR)方法检测不明原因急重症呼吸道感染病例咽拭子标本甲/乙型及各亚型流感病毒核酸。Sanger法对H9N2阳性标本进行病毒HA基因测序，与禽流感病毒数据库中的参考序列进行比对分析。构建HA基因系统进化树。结果苏州市疾病预防控制中心于2019年3月报告了江苏省首例人感染H9N2亚型禽流感病毒实验室确诊病例。HA基因序列分析表明苏州A/Suzhou/S683/2019(H9N2)病毒株为欧亚谱系Y280-like亚系分支，与A/chicken/Shanghai/S1171/2018 (H9N2)核酸序列同源性最高，为99.23%。HA蛋白裂解位点氨基酸序列为PSRSSR↓GLF，并且受体结合位点关键氨基酸中发生了Q226L突变。与F98疫苗株相比，该禽流感病毒HA潜在糖基化位点位置发生了一定程度的改变。结论苏州H9N2禽流感病毒仍为低致病性，但可能获得了适应人类宿主的部分能力。

简介：摘要目的对广州市2019年不同来源的H3N2流感病毒进行基因测序，分析H3N2流感病毒的进化变异特点。方法对广州市2019年门诊监测、暴发疫情、住院重症病例等不同标本来源的H3N2流感病毒进行分离并对其血凝素（HA）和神经氨酸酶（NA）基因进行测序，运用DNA Star 7.1、Mega 6.0软件分析病毒的变异和进化特点。结果2019年广州市H3N2流感表现为流行期Ⅰ（2019年1-8月）和流行期Ⅱ（2019年11-12月）2个流行高峰。男性和女性的H3N2流感病毒阳性率分别为13.46%（703/5 221）和11.50%（510/4 435），差异有统计学意义（χ2=8.43，P=0.00）。10~20岁年龄组H3N2流感病毒阳性率最高（25.18%，665/2 641），各年龄组阳性率差异有统计学意义。测序发现，不同标本来源的毒株高度同源，亲缘关系相近，属于3C.2a.1分支。根据流行时间和进化特点，进一步划分为Group 1~3共3个小进化分支，Group 1分支流行于流行期Ⅰ、Group 3分支流行于流行期Ⅱ，Group 2分支为2个流行期过度的进化分支，流行期Ⅱ的病毒由流行期Ⅰ的病毒进化而来，且不同分支存在基因重组的现象。在疫苗选择压力下，Group 1~3分支逐渐出现HA抗原位点突变，导致新的抗原漂移。HA抗原位点变异主要发生A和B区，Group 1分支和Group 3分支受体结合位点变异发生在前壁和后壁，Group 2~3分支在HA抗原位点A区缺失2个糖基化位点。结论2019年广州市H3N2流感病毒的遗传变异包括位点突变和基因重组。在疫苗免疫压力下H3N2流感病毒发生快速的进化变异，抗原位点变异逐渐累积，进而出现新的抗原漂移。应对H3N2流感病毒分子流行特点进行持续监测。

简介：摘要：随着我国人口数量在不断递增，环境污染也越来越严重，再加之人们环保意识不强，导致环境状况越来越差，人们也都处于亚健康状态，也就更易被流感病毒侵袭。所以，患流感人数越来越多，也就越来越多人使用中药进行抗流感病毒治疗。基于此，下文阐述中药抗流感病毒作用的研究进展，以便让大家远离流感的困扰。

简介：摘要：随着我国自然环境不断出现异常变化，导致流行性感冒发生率在逐渐上升，这在一定程流感病毒会引起流行性感冒，其是一种传染性疾病，属于呼吸道传染病，和心血管疾病相比，流行性感冒虽具有较高传染性，患病周期比较长，但患者并不会出现生命危险。一般情况下，患者习惯使用西药进行治疗，虽然此类药物效果较快，但存在副作用，且治疗同时还会损伤器官。中药属于天然药物，其中含有多糖、生物碱等多种生物活性物质，可发挥合成物质难以达到的药效，具有毒副作用小、抗病毒谱广、无环境污染等优点，且中草药中含有天然的矿物质、维生素、位置营养物质等，具有治疗、预防、营养等多种效果。为此，在进行抗流感病毒治疗期间应寻求新方法中药治疗。

简介：摘要目的研究2017—2018年佛山市活禽交易市场禽流感病毒检出率、混合流行情况和基因变异分析，评估活禽市场禽流感的潜在风险。方法采用荧光PCR检测2017年4月至2018年3月间1 440份活禽交易市场环境监测标本，对部分H9N2阳性标本进行血凝素（hemagglutinin，HA）全长测序，结合采集时间、采集地点、标本种类和基因进化情况综合分析。结果1 440份标本中甲型流感阳性422份。阳性标本中检出H9N2单独阳性标本213份（213/422，50.47%），混合阳性标本38份（38/422，9.00%）。H5N6单独阳性标本44份（44/422，10.43%），混合阳性标本26份（26/422，6.16%）。H7N9单独阳性标本4份（4/422，0.95%），混合阳性标本16份（16/422，3.79%）。来自外环境标本混合阳性检出率明显高于来自活禽标本（14.7% vs 1.75%，x2=20.10，P<0.01），零售市场混合阳性检出率高于批发市场但无明显差异（13.46% vs 8.18%，x2=1.97，P=0.1602）。9株测序的H9N2标本HA基因序列与国内疫苗株共同处于h9.4.2亚分支上。结论H9N2亚型禽流感病毒在佛山市活禽市场中存在比例较高，是与其他禽流感病毒混合感染率最高的亚型，后期应重点监测。

简介：摘要目的运用生物信息学方法探讨甲型流感病毒所致肺损伤的可能机制。方法从Gene Expression Ominbus（GEO）数据库中选择基因表达谱GSE57455、GSE63786和GSE64800，通过GEO2R工具在线分析，筛选出差异表达基因（DEGs），基于STRING构建蛋白互作网络图，筛选出显著模块；并对获取的DEGs进行Gene Ontology（GO）分析和Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes（KEGG）通路富集分析。通过Cystoscape软件筛选出具有高度连接性的关键基因，并构建生物学功能图。结果筛选得到119个交集DEGs，其中上调基因有106个，下调基因13个。GO分析显示，DEGs显著富集于免疫应答、细胞分裂等生物学过程中；显著富集于细胞外间隙、胞外区部分等细胞组成上；显著富集于趋化因子活性、细胞因子受体结合等分子功能上。KEGG通路富集显示，DEGs显著富集于细胞因子及受体相互作用信号通路、趋化因子等信号通路。同时，共筛选得到7个关键基因：FIGNL1、GBP5、ICOS、ARG1、IRF7、CYSLTR1和SLMAF8，其富集作用主要在免疫应答、精氨酸代谢、B细胞反应等生物学功能。结论FIGNL1介导的肺组织细胞受损、IRF7和GBP5介导的Ⅰ型IFN反应、ARG1介导的精氨酸代谢以及ICOS、CYSLTR1和SLAMF8介导的趋化因子和炎性因子的活化与甲型流感病毒所导致的肺损伤密切相关。

简介：摘要流感病毒持续而广泛地影响全球人类健康，其广泛的动物宿主特性、高度变异的特点导致抗原不断漂移，易感人群更迭，引起全球流感流行反复发生，也影响着季节性流感疫苗的保护效果。本研究以多种亚型的甲型流感病毒为例，从抗原性漂移对抗原性的影响、季节性流感疫苗株与流行株的匹配度、广谱流感疫苗研发的思路等方面，对相关的研究进展作一综述，以加深对流感病毒抗原性进化的理解，为流感疫苗未来研发思路提供参考。

简介：摘要目的评估季节性流感疫苗免疫血清对欧亚类禽H1N1猪流感病毒的交叉反应。方法9株人感染欧亚类禽H1N1猪流感病毒株来自江苏、河北、山东、云南、湖南、福建和天津等省份的国家级流感监测网络实验室，通过深度测序分析其血凝素特性。于2019年10月在云南省安宁市接种2019-2020年度季节性流感疫苗的儿童（2~5岁）、成人（24~57岁）和老年人（60~84岁）中各招募30名志愿者，采集其接种疫苗前和接种1个月后血清。通过血凝抑制试验评估免疫前后血清对2015年以来分离的4株人感染欧亚类禽H1N1猪流感病毒的交叉反应。结果9株欧亚类禽H1N1猪流感病毒的血凝素基因同源性较一致，但与甲型流感病毒［A（H1N1）pdm09］（以下简称“疫苗株”）的血凝素重链和轻链氨基酸基因的差异分别为90~101个和24~30个氨基酸。疫苗株抗血清对疫苗株的抗体滴度为2 560，欧亚类禽H1N1猪流感病毒以及欧亚类禽H1N1猪流感病毒抗血清对疫苗株的抗体滴度均为640。接种季节性流感疫苗的儿童、成人和老年组人群针对疫苗株的抗体滴度≥40者占比分别为90.0%、70.0%和73.3%；而对4株欧亚类禽H1N1猪流感病毒仅为46.7%、36.7%和33.3%~43.3%。结论接种季节性流感疫苗不能对欧亚类禽H1N1猪流感病毒产生有效的交叉保护作用。

简介：摘要合并细菌感染是流感常见并发症，是导致流行季节流感高病死率的主要原因之一。革兰阳性(G+)细菌，如肺炎链球菌、金黄色葡萄球菌、A群链球菌等是常见致病菌。现就流感病毒合并G+细菌感染的流行病学特征、发病机制、诊断、治疗及预防进行综述。

简介：摘要流感病毒一般引发呼吸道疾病，近年来，流感病毒引起的一些呼吸道外临床表现也逐渐引起人们关注。其中流感病毒相关性脑病/脑炎(IAE)病死率高，是引起流感病毒感染危重病例死亡的重要原因，治愈者通常存在神经系统后遗症。目前国际上对于IAE的认识普遍较少，现从临床表现、流行病学资料、危险因素、分类、治疗、预后与机制研究等方面系统回顾近年来在IAE取得的进展，以期加深对本病的认识。