简介:本文提出DNA序列相似度指标,建立DNA序列比对算法。首先,将水生生物DNA样本序列与现有的基因库中的DNA序列逐项比对;其次,在满足特定阈值条件下,确认样本序列的分类。利用Java编程语言来实现算法,通过MonteCarlo模拟和实际应用,验证算法的有效性。理论结果表明:在满足特定阈值条件下,通过计算DNA序列相似度,能够确定数据库中与未知DNA样本序列最相似的序列,判断样本序列的分类。模拟实验、对比研究和应用结果表明:相似度指标算法在有效判别DNA序列的分类,提高DNA序列匹配成功率,降低程序复杂度等方面具有优良特征。
简介:本文对长江水系南京和江都地区中华绒螯蟹共61个个体的线粒体COI基因进行了限制性片段长度多态性(RFLP)分析。应用PCR技术扩增了中华绒螯蟹线粒体COI基因,选用8种能识别4碱基的限制性内切酶对该基因片段进行RFLP分析。在两个群体中共检测出8种复合单倍型,其中复合单倍型AAAA从从和BBBBBAAB为两个群体所共有,它的个体数所占的百分比在两个群体(南京和江都)中分别为87.9%、12.1%和50.0%、25.0%。在南京群体中,复合单倍型间的遗传距离为0.077,而在江都群体中,复合单倍型间的遗传距离为0.004~0.077;南京和江都群体的线粒体COI基因多态度(或称核苷酸多样性指数)π值分别为0.008和0.019。结果说明长江水系中华绒螯蟹具有一定的群体内遗传多样性。
简介:<正>平顶山市有养鱼水面17.81万亩,在全省排第四位,全市水产品总产量从1990年的2218吨发展到1999年的6300吨,年均递增12.3%,养殖产量在全省排第十位,平均亩产为31.3kg。十年来,引进推广了银鱼移植增殖、网箱、高产池塘、温流水等养鱼技术。养殖品种由鲢鳙鱼、草鱼为主向鲫鱼、鲇鱼、罗非鱼、银鱼、甲鱼等名优品种过渡,建成了集中连片商品鱼基地、网箱养鱼基地、水库银鱼基地。使我市的渔业生产形成了粗养、半精养、精养等相互补充,共同发展的新格局。为渔民脱贫致富、丰富群众菜篮子、缓解吃鱼难做出了贡献。我市水产业虽然取得了一定成绩,但与周边省市相比,无论从养殖品种结构,还是养殖方式和养殖规模上仍很落后,抵御市场变化能力较弱。具体表现在,一是没有龙头水产科技企业,缺乏科技示范的带动作用;二是缺乏名