简介：为研究人血小板因子4(hPF4)的生物学性能和用于肿瘤生物治疗的可能性,运用反转录聚合酶链反应(RTPCR)从人红白血病细胞系HEL细胞总RNA中扩增出hPF4基因cDNA序列,将其克隆至pUC18载体中.序列分析证实克隆片段与文献报道的hPF4基因cDNA序列完全一致,说明已成功克隆到hPF4基因cDNA.

简介：设计合成两对覆盖PCV2基因组奎长的引物，对PCV2分离株S2、P11、L进行全基因测序。将所测序列与GenBank上已公布的PCV2毒株序列进行同泺性比较，并绘制系统发育进化树。结果显示。所测毒株与其它地城的24株PCV2分离株的基因组序列同源性很高。3个分离株之问的奎基因核苷酸同源性在95.4％-99.3％。序列分析表明欧洲分离株和美洲分离株分别构成PCV2的两个夫的分支：欧洲系和美洲系。S2、P11属于欧洲系，L属于美洲系。

简介：采用聚合酶链反应从炭疽芽孢杆菌减毒株ＹＢ１中扩增其保护性抗原（ＰＡ）的编码区基因，将其克隆至ｐＧＥＭ－Ｔ载体中，并分步测定其序列。序列测定表明，该基因长２２０５ｂｐ，编码７３５个氨基酸残基，与文献报道的标准菌株Ｓｔｅｒｎｅ株的ＰＡ序列只有４个碱基的差异。

简介：目的对我国登革2型病毒1998年广东省南海市流行株GD08/98结构蛋白基因进行序列测定及分析,为追踪其地域来源、基因组结构与致病性的关系及研究开发登革病毒新型疫苗奠定基础.方法根据登革2型国际标准株NGC序列,设计2对重叠引物,RT-PCR扩增,分别克隆到pMD18-T载体,转化受体菌DH5α,挑取阳性克隆进行PCR、酶切鉴定及序列测定.结果此登革病毒株结构蛋白基因序列长度为2325bp,编码775个氨基酸.与其它登革2型病毒株ThNH81/93、NGC、44、TSV01、04及S1进行比较,其核酸序列同源性分别为98%、94%、94%、92%、92%、90%.结论GD08/98病毒株的结构基因序列基本类似于已发表的其它登革2型病毒株.GD08/98株与ThNH81/93株同源性最高,推测其可能来源于泰国.

简介：【背景】米尔顿姬小蜂是一种入侵我国台湾地区的植食性小蜂，能够严重影响水果的产量和食用价值。目前在我国大陆没有分布，由于其个体微小，与近似种区别较小，通过传统的形态学分类方法难以鉴定，因此有必要研究其基因片段序列，探讨分子鉴定方法。【方法】利用PCR方法扩增并测定了米尔顿姬小蜂线粒体16SrRNA和COI基因的部分序列，并对各序列的碱基组成进行了分析。然后根据COI基因部分序列，利用DNAMAN的MaximumLikelihood方法构建了米尔顿姬小蜂与膜翅目其他科的系统发育树。【结果】16SrRNA基因的PCR扩增产物为426bp，COI基因的PCR扩增产物为488bp。通过测序获得米尔顿姬小蜂16SrRNA和COI基因部分序列，序列分析表明，16SrRNA和COI基因的A＋T含量均较高，存在较强的A＋T偏向性。系统发育树显示，米尔顿姬小蜂与蚜小蜂科的Encarsiaberlesei亲缘关系最近，与姬小蜂科的Chrysocharisnautius、C．eurynota亲缘关系较远。【结论与意义】本研究为米尔顿姬小蜂的分子鉴定提供了依据。

简介：【背景】米尔顿姬小蜂是一种入侵我国台湾地区的植食性小蜂,能够严重影响水果的产量和食用价值。目前在我国大陆没有分布,由于其个体微小,与近似种区别较小,通过传统的形态学分类方法难以鉴定,因此有必要研究其基因片段序列,探讨分子鉴定方法。【方法】利用PCR方法扩增并测定了米尔顿姬小蜂线粒体16SrRNA和COⅠ基因的部分序列,并对各序列的碱基组成进行了分析。然后根据COⅠ基因部分序列,利用DNAMAN的MaximumLikelihood方法构建了米尔顿姬小蜂与膜翅目其他科的系统发育树。【结果】16SrRNA基因的PCR扩增产物为426bp,COⅠ基因的PCR扩增产物为488bp。通过测序获得米尔顿姬小蜂16SrRNA和COⅠ基因部分序列,序列分析表明,16SrRNA和COⅠ基因的A+T含量均较高,存在较强的A+T偏向性。系统发育树显示,米尔顿姬小蜂与蚜小蜂科的Encarsiaberlesei亲缘关系最近,与姬小蜂科的Chrysocharisnautius、C.eurynota亲缘关系较远。【结论与意义】本研究为米尔顿姬小蜂的分子鉴定提供了依据。

简介：以从我国湖南长沙和湘西犬小肠中采集的2条泡状带绦虫作为研究对象，用引物JB11及JB12扩增泡状带绦虫的pnad1片段，应用ClustalX1．81程序对序列进行比对，同时利用DNAscar5．0中的Megalign程序进行同源性分析。结果显示来自湖南长沙和湘西的2条泡状带绦虫的pnad1序列均为391bp。研究结果为泡状带绦虫进一步的分类、鉴定和遗传变异研究奠定了基础。

简介：摘要目的探讨作为结肠癌癌前病变的结肠腺瘤性息肉（CAP）中肠道菌群的改变特征。方法随机收集2017年11月至2018年4月在昆明医科大学第一附属医院进行结肠镜检查的结肠腺瘤性息肉患者（CAP组）30例和无腺瘤息肉的健康个体（HC组）30名。通过内镜下电凝电切治疗，收集CAP患者的腺瘤组织和健康志愿者（HC）的肠黏膜组织，提取基因组DNA，对细菌16S rRNA基因V3~V4区进行扩增，通过Illumina MiSeq平台进行序列测定，实验结果使用秩和检验（Wilcoxon检验）进行比较法分析。结果CAP患者的腺瘤组织中肠道菌群α多样性高于健康肠黏膜组织（Chao指数、Ace指数P<0.01）。门水平分析中，CAP组中拟杆菌门（FC=0.38）的丰度显著降低（P<0.01）；属水平分析中，拟杆菌属（FC=0.32）、埃希菌属（FC=0.57）、瘤胃球菌属（FC=0.42）、Blautia（FC=0.27）、Dorea（FC=0.57）在CAP组中丰度降低（P<0.05）；假单胞菌属（FC=2.43）、乳球菌（FC=2.84）、土芽孢杆菌属（FC=2.07）和不动杆菌属（FC=2.36）丰度升高（P<0.05）。结论与HC肠黏膜组织相比，CAP患者腺瘤组织中菌群的丰度和多样性存在显著的差异，表明腺瘤性息肉患者黏膜中菌群存在失衡现象。这种肠道微环境的失衡，对研究结肠腺瘤性息肉的发生和发展具有重要意义。

简介：摘要目的对呼吸道标本中新型冠状病毒进行二代测序(NGS)，获取基因组序列并分析测序影响因素。方法2020年1月，收集广东省新型冠状病毒感染病例的上呼吸道和下呼吸道标本共计8份，运用RNA建库的方法进行测序，获得新型冠状病毒的基因组序列，采用生物信息学软件包(CLC Genomics Workbench 12.0)对基因组序列进行分析比较。结果从8例呼吸道标本中获得5个新型冠状病毒基因组序列，其中2份来自下呼吸道标本。与新冠病毒的核苷酸同源性为97.74%～99.90%。Ct值低的样本，测序深度、覆盖度和相对丰度高。结论标本中新型冠状病毒的Ct值低，测序质量好。

简介：鉴于泛素与植物受高温等环境胁迫下产生的一些诱导型蛋白降解有关,本研究根据擎天凤梨Ostara早期花器的全长cDNA文库,经大规模随机测序及重叠群（contigs）内EST序列的拼接,获得了擎天凤梨多聚泛素基因全长cDNA序列（GenBank登录号：GQ890686）,序列长1896bp,开放阅读框长1323bp,编码441个蛋白氨基酸残基,蛋白质分子质量为49.3kD,等电点pI为6.59。蛋白二级结构预测显示,该蛋白主要由随机卷曲、延伸链、α螺旋和β-转角组成;系统进化树分析表明与拟南芥推定的多聚泛素UBQ10（gi｜23397122｜gb｜AAN31845.1｜）亲缘关系最近;经推断它是由5个单体泛素组成的多聚泛素。本研究有助于进一步探讨该基因在低温胁迫下的反应机理以及如何采用分子调控手段增强擎天凤梨的耐低温能力。

简介：摘要目的分析杭州市首例感染新型冠状病毒（2019-nCoV）病例病毒全基因组序列特征。方法采集杭州市首例新型冠状病毒肺炎病例咽拭子和深咳痰液呼吸道标本，对标本进行病毒核酸提取和实时逆转录PCR检测，对病毒进行高通量基因组测序；从美国国立生物技术信息中心GenBank数据库中获取29条（分别来自武汉、深圳、日本、美国、澳大利亚和芬兰）2019-nCoV基因组序列和其他物种来源的30条β冠状病毒基因组进行系统发育分析。对15株武汉地区毒株基因组以突变位点进行分组，鉴定其他地区相同和特异性突变位点。结果获得29 833 bp长度的杭州首例感染2019-nCoV病例病毒的基因组序列，覆盖病毒编码区全长。系统发育分析表明，该病毒与云南蝙蝠中分离到的严重急性呼吸综合征样冠状病毒RaTG13株最为接近，相似性为96.11%；相较其他基因，E基因间相似性最高（99.56%），而编码病毒表面刺突蛋白的S基因间相似性最低（92.87%）。与来自武汉、深圳、日本、美国、澳大利亚和芬兰的29株2019-nCoV基因组序列进行比对，相似性均大于99.9%，但在一些毒株中也发现了一些单位点核苷酸多态性。结论杭州首例感染2019-nCoV病例病毒基因组序列和来自国内外疫情早期病毒基因组高度近源。

简介：分别以雷竹嫩叶的基因组DNA和幼穗的cDNA为模板，采用PCR方法扩增出长为490bp及262bp的片段。序列分析结果表明，该基因序列包含1个长为228bp的内含子。其编码区共编Ns86个氨基酸。其氨基酸序列与水稻中OsFCA、小麦中TaFCA的一致性分别为79．8％与69．9％，表明雷伢中可能存在调控开花的自主调控途径。

简介：摘要：本文提出了一种基于时间序列分析组合模型的变形监测与预报方法，该方法将ARIMA模型和指数平滑模型相结合，并利用Kalman滤波算法对模型进行优化。采用该方法对某隧道进行了变形监测与预报研究，并与传统的单一模型进行了对比分析。研究结果表明，基于时间序列分析组合模型的变形监测与预报方法具有更高的预测精度和更好的实时性。

简介：<正>句群是在语义上有逻辑联系,在语法上有结构关系,在语流中是衔接连贯的一群句子的组合。一个句群中,句子与句子的连接有一定的方式,本文着重从语义关联上探讨句群中句子与句子的序列连接。句子与句子的序列连接,在汉语中有诸多形式,主要的有以下几种:

简介：摘要目的基于六邻体蛋白和纤维蛋白的联合基因测序和系统发育分析进行腺病毒性结膜炎中人类腺病毒(HAdV)分型。方法在上海地区收集2015年1月至2017年8月病毒性结膜炎患者下结膜囊结膜拭子样本256份，提取DNA后通过PCR扩增六邻体蛋白及纤维蛋白全长，完成基因测序及种系发生学分析。结果89例(占34.76%)患者结膜拭子六邻体蛋白基因扩增阳性，包括HAdV-C1、HAdV-C2、HAdV-B3、HAdV-E4、HAdV-D8、HAdV-D19和HAdV-D37各1、7、20、6、23、17和15例，分别占1.12%、7.87%、22.47%、6.74%、25.84%、19.10%和16.85%，其六邻体蛋白种系发生学分析中均与相应参考序列原型聚合。纤维蛋白种系发生学分析中，15例HAdV-D19样本序列和1例HAdV-D37样本序列交叉聚合。结论针对六邻体蛋白和纤维蛋白基因的联合测序可以为HAdV分型和毒力分析提供丰富有效的生物学信息。

简介：相关函数表现出时间序列中任意两个值之间的相关性是如何随着时间间隔而改变的．自相关函数刻画了时间序列相邻变量之间的相关性，偏相关函数则是排除了其它中间变量的影响，真实地反映两个变量之间的相关性，并且二者紧密相连．同时两个相关图所反映的信息在时间序列分析各个方面发挥着关键作用．

简介：十二音体系的建立,对传统的旋律组织法作了彻底的变革,在音乐中奠定了序列主义的基础。但作曲家们并没有满足于“音高”的序列化,为了创造全新的音乐语言,他们的下一个目标是彻底改革传统的“节奏”组织法。

简介：支持向量机是一种基于统计学习理论的新的机器学习方法，该方法已用于解决模式分类问题．本文将支持向量机（SVM）用于混沌时间序列分析，实验数据采用典型地Mackey-Glass混沌时间序列，先对混沌时间序列进行支持向量回归实验；然后采用局域法多步预报模型，利用支持向量机对混沌时间序列进行预测．仿真实验表明，利用支持向量机可以较准确地预测混沌时间序列的变化趋势．

简介：粮食价格波动的成因一直是学术界关注的问题。本文通过对1995年1月至2005年12月全国小麦批发市场月度价格序列的分析，表明所观察的小麦价格序列的分布不符合传统线性回归模型关于独立同方差的假设，其特征比较适合使用ARCH族模型来描述。GARCH（1，1）模型的结果显示，由前期价格代表的存粮情况对现期小麦价格影响显著，前期的高价会引发未来小麦市场较大的价格波动；考察期间两次大的粮食市场改革虽然对短期小麦价格有影响，但并未引发剧烈的小麦价格波动。

简介：摘要：本文结合国内外现有文献的研究对时间序列的相关理论进行了系统、全面的阐述，以期为后续研究奠定基础。