简介：为揭示复等位基因遗传的大白菜雄性不育分子机制，通过基于质谱的蛋白质组学同位素相对标记与绝对定量技术技术（iTRAQ），开展了大白菜核基因雄性不育蛋白质组学研究，以找到不育与可育材料中差异表达蛋白，从蛋白水平来进一步揭示大白菜雄性不育的分子遗传机制。

简介：目的探讨食管癌患者和健康人群蛋白表达的差异,筛选用于早期诊断的肿瘤标志物并建立诊断模型.方法回顾性分析2008年1月至8月新疆医科大学第一附属医院收治的127例原发性食管癌患者（食管癌组）和63例健康体检者（健康对照组）的临床资料.采用表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱（SELDI-TOF-MS）技术,应用弱阳离子交换蛋白芯片检测和分析两组受试者的血清蛋白表达谱,筛选可以用于临床食管癌早期诊断新的肿瘤标志物,建立蛋白质指纹图诊断模型.采用秩和检验分析数据.结果食管癌组与健康对照组血清蛋白质荷比（M/Z）峰值图谱明显不同.得到差异性较大的10个蛋白中,有6个在食管癌组呈高表达,M/Z为4488、5495、15964、3948、8154、8166;4个呈低表达,M/Z为8789、6682、8714、6650.建立由6个蛋白组成的蛋白质指纹图诊断模型,食管癌组患者中124例判定正确,3例误判;健康对照组患者中60例判定正确,3例误判,其准确度为96.8%（184/190）,敏感度为97.6%（124/127）,特异度为95.2%（60/63）.结论应用SELDI-TOF-MS技术筛选食管癌肿瘤标志物建立的蛋白质指纹图诊断模型灵敏度高、特异性强.

简介：摘要目的探讨甲胎蛋白(AFP)高表达和低表达肝细胞肝癌(HCC)中的差异表达基因表达谱，为HCC的分子机制研究及预后判断提供理论依据。方法从肿瘤基因图谱计划(TCGA)公共数据库获得368例包含完整临床信息的HCC转录组数据，根据组织AFP mRNA表达四分位数将样本分为AFP高表达组和AFP低表达组，每组各92例。应用R软件中的DEseq2包进行差异表达基因分析，应用ClusterProfiler包对差异表达基因进行基因本体论(GO)功能分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析，应用String数据库和Cytoscape软件构建蛋白相互作用网络，筛选关键基因。采用单样本基因集富集分析方法，通过R软件GSVA包对特征基因进行富集评分，根据得分定义特征基因集表达情况。利用RNAseq数据和实时荧光定量聚合酶链反应(RT－qPCR)进行独立数据集验证和组织验证。结果TCGA数据分析显示，AFP高表达与HCC低分化、患者人种有关(均P<0.05)。生物信息学分析共获得1 382个差异表达基因，其中931个基因在AFP高表达组织中表达上调，451个基因表达下调。GO功能分析显示，AFP高表达组织中高表达的基因主要与附属肢体发育、肢体发育、骨架系统发育等过程有关，而低表达基因则与异源物代谢、类固醇代谢、细胞对异生物刺激反应等代谢相关过程有关。KEGG通路分析显示，AFP高表达组织中高表达的基因主要参与原发性免疫缺陷、神经活性配体－受体相互作用、细胞因子－细胞因子受体相互作用通路，而低表达基因主要与视黄醇代谢、化学致癌作用、类固醇激素的生物合成等通路相关。鉴定出1个预后相关特征基因集，该基因集包括AURKB、TTK、CENPA、UBE2C、HJURP、KIF15，其高表达与HCC患者的无复发生存和总生存有关，且特征基因集富集分数与AFP表达呈正相关(r＝0.475，P<0.001)。RNAseq数据验证结果与TCGA数据分析结果基本一致。RT－qPCR检测结果显示，特征基因集中AURKB、KIF15和UBE2C在AFP高表达HCC组织中显著高表达，其表达虽然与HCC患者的无病生存、总生存无关，但AFP低表达组患者的无病生存曲线和总生存曲线均在AFP高表达组患者之上。结论AFP高表达和AFP低表达HCC在基因表达谱上存在较大差异。筛选出的特征基因集可能协同AFP共同促进HCC的发生发展，其对解释不同水平AFP HCC的作用机制有一定作用，并为HCC的预后判断提供了新的思路和依据。

简介：摘要目的应用iTRAQ技术筛选婴儿痉挛症患儿的血清生物标志物。方法选择临床明确诊断的婴儿痉挛症患儿(试验组)及健康婴儿(对照组)各15例，应用绝对定量技术(isobaric tag for relative and absolute quantitation，iTRAQ)检测其血浆差异蛋白，并进行功能注释及生物信息分析，筛选出差异明显的候选蛋白。结果与对照组相比，试验组获得59种表达倍数1.2倍以上的差异蛋白(P<0.05)，这些差异蛋白参与细胞骨架组织、整合素激活和细胞中蛋白质位置维持等重要生物学过程。从中选取5个疾病相关蛋白标志物，对其进行论述。结论婴儿痉挛症患儿和健康婴儿血清存在蛋白质表达差异，这些结果可能为婴儿痉挛症的研究提供新的方向或目标。对细胞骨架蛋白的研究可能成为探究婴儿痉挛症发病机制的突破口，新的潜在的生物标志物如丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶和多巴胺β-羟化酶可能为婴儿痉挛症的诊治提供新的方向。

简介：摘要目的筛选预测维吾尔族局部晚期食管癌患者的血清差异蛋白。方法收集维吾尔族局部晚期的食管鳞癌患者28例，采集维吾尔族食管癌患者接受放化疗前后的静脉血，同时收集健康对照组血，对各组血清进行iTRAQ标记及蛋白质谱检测，最后通过蛋白分析软件筛选差异蛋白。结果放化疗前后食管癌患者与健康对照组比对，分别筛选出83个、112个差异蛋白，患者放化疗前组与放化疗后组比对，共筛选出24个差异蛋白。结论SAA、补体、组蛋白、CRP等，与既往研究结论相似，进一步证实了本研究结果可靠性。有些近年来研究热门的新蛋白如胰岛素样生长因子、甘油醛-3-磷酸脱氢酶(GAPDH)等，对诊断肿瘤及研究肿瘤侵袭性有很大意义，且IGF被认为与肿瘤的化疗抵抗相关。

简介：摘要目的通过非标记蛋白质组学技术研究肺腺癌中蛋白质表达。方法选取北京大学人民医院5例未经治疗的肺腺癌患者，提取肿瘤组织和配对癌旁组织的总蛋白，通过高效液相色谱-质谱联用技术进行质谱分析。质谱原始数据使用Maxquant软件进行查库和非标记定量分析。Maxquant所得的查库文件使用Perseus软件进行分析。肺腺癌肿瘤组织与配对癌旁组织进行配对t检验，筛选出差异表达蛋白后并对差异蛋白进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析，以P<0.05为差异有统计学意义。结果通过数据库比对获得11 295条多肽，分别对应于908个蛋白，其中312个蛋白在肺腺癌中存在显著差异表达，110个蛋白表达上调，212个蛋白表达下调。肺癌中上调倍数最高的为铁蛋白，下调倍数最高的为COL6A3。GO分析提示肺腺癌中差异表达的蛋白主要富集的分子功能为RNA binding。KEGG通路分析也证实剪接体通路在差异表达蛋白中显著富集。结论通过非标记蛋白质组学技术发现312个在肺腺癌中显著差异表达的蛋白质。

简介：目的应用蛋白质组学方法分析研究大鼠创伤性脑损伤后海马组织差异表达蛋白质．为筛选脑损伤早期诊断的生物学标志物提供理论依据。方法采用双向凝胶电泳分离总蛋白．硝酸银染色，PDQuest7．0图像分析软件分析获得的差异蛋白质点，基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱（MALDITOF—MS）对检测到的差异蛋白质点进行鉴定，获得肽质量指纹图谱，查阅蛋白质数据库得到所需蛋白质相关信息，分析大鼠创伤性脑损伤后4h、8h、12h、24h和48h海马组织中差异表达蛋白质．每组样品电泳重复3次，每帧图谱检测到1800余个蛋白质点；选择2个背景清晰、重复性及分辨力良好、在各组表达差异明显并呈现时序性变化的蛋白质点进行质谱分析。结果经双向凝胶电泳分离共获得18帧图．每组3帧，其中对照组及损伤后12h组蛋白质图谱显示分离效果良好，蛋白质点清晰，点染色程度较深，数目较多，横纹和纵纹较少，图谱平均匹配率〉80％。采用PDQuest7．0图像分析软件对蛋白质图谱进行定量分析证实，相对分子质量为58．00×10^3的差异蛋白质为葡萄糖调节蛋白（葡萄糖调节蛋白58），在损伤后4h、8h和12h表达水平上调；相对分子质量为28．40×10^3的差异蛋白质为蛋白酶体α亚单位3型，在损伤后4h、8h、12h、24h和48h表达水平均上调。结论葡萄糖调节蛋白58和蛋白酶体α亚单位3型可能与创伤性脑损伤的发生、发展密切相关，此为探讨脑损伤的发病机制提供了重要线索。

简介：通过比较肺癌患者癌组织和癌旁组织的二维凝胶电泳图谱（two-dimensionalelectrophoresis，2DE），以寻找肺癌相关蛋白、肺癌患者癌组织和癌旁组织，采用固相pH梯度（immobilizedpHgradient，IPG）2DE分离总蛋白质，凝胶经银染显后，ImageMaster2D图像分析软件进行比较分析、识别差异表达的蛋白质并进行质谱鉴定获取肺癌相关蛋白信息。结果分析得到肺癌组织蛋白点709个，癌旁组织蛋白点722个，选择表达量差异达3倍以上的40个，进行胶内酶解，基质辅助电离解析飞行时间质谱（MALDITOFMS）获得肽质量指纹图谱（PMF），搜寻蛋白质数据库，得到7个肺癌标志物的候选蛋白，但这些差异蛋白点在肺癌发生发展中的作用需要进一步研究。

简介：摘要目的根据IRES末端序列的不同，构建4个GFP表达强度不同的逆转录病毒载体，为后续流式检测或成像提供基础。方法利用脑心肌炎病毒IRES的转录效率依赖于其末端的基因序列，通过重叠PCR方法将IRES与EGFP融合成4个不同连接方式的片段，然后克隆至逆转录病毒载体pMSCV-NGFR中；PCR扩增NGFR片段，克隆至逆转录病毒载体pMSCV-IRES-EGFP前面；逆转录病毒载体pMSCV-NGFR-IRES-EGFP转染293T细胞，分析EGFP的表达比例和平均荧光强度(MFI)，同时分析NGFR的表达。结果成功构建4个逆转录病毒载体pMSCV-NGFR-IRES-EGFP；在293T细胞转染4个逆转录病毒载体，24 h和48 h时EGFP的表达效率没有明显差异，但荧光强度却有明显不同，同时NGFR的表达没有明显不同，说明IRES与EGFP之间加入不同的核苷酸序列，会使EGFP的荧光强度呈现明显差异。结论EGFP的表达强度受IRES与EGFP之间序列的影响，不同强度EGFP的逆转录病毒载体可以适用于不同的实验要求。

简介：

简介：IMP3（胰岛素生长因子Ⅱ的mRNA的结合蛋白3）是一个新发现的癌胚胎的RNA结合蛋白，研究发现其参与细胞生长和细胞迁移在胚胎发育的早期阶段．该研究利用实时定量逆转录PCR对IMP3在乳腺癌的诊断和治疗中的应用潜力进行了研究和评估．检测了不同类型乳腺癌样本中IMP3的表达情况，定量PCR结果分析中应用2也小。方法进行了归一化比较．研究结果表明，IMP3基因表达与乳腺癌病人肿瘤的大小及淋巴转移存在明显的相关性（P〈0．01）．不同的临床阶段和病理分期与IMP3的表达水平之间也存在一定的相关性，表明差异不显著（P〉0．05）．该研究表明IMP3作为一种新的肿瘤相关因子，其表达水平与乳腺癌也存在一定的相关性，显示了其作为一种潜在的肿瘤标志物的可能性．

简介：摘要目的分析维吾尔族、汉族局部晚期食管癌患者的血清差异蛋白相关通路。方法收集维吾尔族食管鳞癌患者28例、汉族食管鳞癌患者35例，同时收集健康体检者静脉血作为健康对照组，将收集的血标本均提取血清。对食管癌与健康对照组进行差异蛋白筛选并导入KEGG数据库，进行进一步分析。结果维吾尔族、汉族食管癌患者与健康对照组比对，分别筛选出83、46个差异蛋白，将维吾尔族、汉族食管癌差异表达的血清蛋白导入KEGG数据库后，分别得到127个、36个差异蛋白的KEGG通路，共筛选出肿瘤相关通路4个。结论Toll-likereceptors（TLR）通路、趋化因子信号通路分别在维吾尔族、汉族食管鳞癌中存在差异，不除外参与肿瘤的发生。

简介：

简介：摘要目的寻找颈椎后纵韧带骨化（OPLL）患者骨化后纵韧带组织与邻近未骨化的后纵韧带组织的差异表达蛋白，探讨OPLL发生的病理生理学机制。方法选取5例2018年1至3月在北京大学第三医院骨科接受颈椎前路减压手术的颈椎OPLL患者，手术中切除的骨化的后纵韧带组织作为OPLL组，手术中切除的临近未骨化的后纵韧带组织作为对照组，采用基于数据非依赖采集的蛋白质组学技术筛选差异表达的蛋白，通过文献查询明确差异表达蛋白功能，找到在OPLL发生发展中起作用的蛋白质。结果OPLL组与对照组相比，共有9个蛋白有差异表达（差异倍数≥2和P<0.05），在骨化后纵韧带组织中的表达均上调，主要与核苷酸转运与代谢、细胞外结构、翻译、核糖体结构与生物发生、一般功能预测、信号转导机制等相关。文献查询后发现其中5个蛋白的功能可能与OPLL的发生发展相关，包括胶原α-1（Ⅱ）链（COL2A1）、基质Gla蛋白（MGP）及信号肽、CUB和EGF-样结构域包含蛋白1（SCUBE1）、骨调节蛋白（OMD）、成纤维细胞生长因子结合蛋白2（FGFBP2）。结论本研究筛选到的与OPLL相关的差异表达蛋白，对OPLL病理生理学研究及其生物标志物的发现提供了基础。

简介：表达序列标签是一种快捷、高效的揭示基因组信息的方法。本研究以蓝塘猪与大白猪差异表达的5条EsT在各组织中的表达情况为目的．采用大白猪、蓝塘猪为实验材料，从成年种猪的10个组织中提取总RNA；运用RT—PCR方法分析，结果显示5条EST在猪的多数组织中均有表达；同源性比对后发现，在5条差异显示cDNA中，EST1、EST2与已知序列无同源性；电子表达谱分析表明EST1、EST2、EST4及ESt5在骨骼肌、肝脏组织中有表达。这为进一步研究该EST的功能奠定基础。

简介：摘要骨桥蛋白指的是在类骨质中由基质细胞产生的骨特异的、含唾液酸的蛋白质，其在细胞与基质无机物之间起到桥连作用，可与细胞外基质中的结构糖蛋白结合1。在心脏平滑肌形成粥样斑块时升高。

简介：摘要目的检测结肠癌间质差异表达蛋白质DCN，FN1，PKM2，HSP90B1的表达情况，寻找能用于结肠癌诊断的标志物。方法①采用免疫组化的方法检测DCN，FN1，PKM2和HSP90B1这4个蛋白质在结肠癌及正常结肠黏膜组织中的表达情况；②应用ROC曲线分析DCN，FN1，PKM2和HSP90B1单独或联合使用判别结肠癌的能力。结果①免疫组化结果DCN、PKM2和HSP90B1在结肠癌间质中表达下调，FN1在结肠癌间质中表达上调；②ROC曲线结果提示DCN、FN1、PKM2和HSP90B1蛋白联合检测较单项检测敏感性升高。结论①免疫组化结果DCN、PKM2和HSP90B1在结肠癌间质中表达下调，FN1在结肠癌间质中表达上调。②DCN、FN1和HSP90B1多指标联合检测比单指标检测提高了判别结肠癌的敏感性和特异性，为筛查结肠癌诊断的新的分子靶标提供了实验依据及新的靶标。

简介：摘要： 简单分析了英文中性别的表达方式，使用英语时要注意避免性别歧视

简介：摘要目的研究伴和不伴有桥本甲状腺炎(HT)的甲状腺乳头状癌(PTC)的蛋白表达差异。方法收集2014—2016年在中国医学科学院肿瘤医院诊治的PTC患者资料，其中伴HT患者103例，不伴HT患者109例。制备组织芯片，利用免疫组化法检测伴和不伴有HT的PTC中鼠类肉瘤滤过性病毒致癌基因同源体B1(BRAF)、血管内皮细胞生长因子(VEGF)、细胞周期蛋白D1(cyclin D1)、间皮细胞(MC)、CD56和半乳糖凝集素3(Galectin3)蛋白的表达水平，分析蛋白表达差异。结果BRAF蛋白在伴和不伴HT的PTC中的阳性表达率分别为55.4%(36/65)和63.6%(42/66)，差异无统计学意义(P＝0.336)。VEGF蛋白在伴和不伴HT的PTC中的阳性表达率分别为25.7%(19/74)和25.8%(17/66)，差异无统计学意义(P＝0.991)。cyclin D1在伴和不伴HT的PTC中的阳性表达率分别为93.4%(71/76)和97.6%(80/82)，差异无统计学意义(P＝0.206)。MC在伴和不伴HT的PTC中的阳性表达率分别为86.1%(62/72)和83.5%(71/85，)，差异无统计学意义(P＝0.654)。Galectin3在伴和不伴HT的PTC中的阳性表达率分别为98.7%(76/77)和97.5%(78/80)，差异无统计学意义(P＝0.583)。CD56在PTC组织和癌旁甲状腺滤泡上皮细胞中的阳性表达率分别为27.4%(32/117)和65.0%(76/117)，差异有统计学意义(P＝0.001)；在伴和不伴HT的PTC中的阳性表达率分别为35.5%(24/68)和16.5%(13/79)，差异有统计学意义(P＝0.009)。结论BRAF、VEGF、cyclin D1、MC和Galectin3蛋白在伴有HT的PTC的发病机制中未发挥明显特异作用；CD56的表达情况可以作为PTC诊断的参考指标；CD56可能与伴有HT的PTC的发生有关。

简介：用SDS-PAGE技术研究了不同时期条斑紫菜样品、高温下培养的丝状体以及不同季节收获的叶状体的总可溶性蛋白。结果表明,这些样品总可溶性蛋白的表达数量和种类相差很大。壳孢子中总可溶性蛋白的表达数量和种类明显比丝状体中多,但比膨大丝状体中少;高温条件下培养的丝状体比正常条件下培养的丝状体表达更多数量和种类的可溶性蛋白;所有样品中,以叶状体表达的溶性蛋白的表达数量和种类最多;上年收获的与本年度不同季节收获的叶状体在蛋白质表达图谱上差别很小。