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  • 简介:Thereareabout17chromosomesinyeastSaccharomycescerevisiae.Amiddlesizedchromosome,chromosomeV,waschoseninthisworkforstudyingandconstructingthephysi-calmaps.ChromosomeVfromstrainA364awasisolatedbypulsed-fieldgradientgelelectrophoresis(PFGE).GelslicescontainingchromosomeVDNAweredigestedwithtworarecuttingenzymes,NotⅠandSfiⅠ,andthree6-Ntrecognizingenzymes,SmaⅠ,SstⅡandApaⅠ.Severalstrategies-partialorcompletedigestions,digestionwithdifferentsetsoftwoenzymes,andhybrid-izationwithclonedgeneticallymappedprobes(CAN1,URA3,CEN5,PRO3,CHO1,SUP19,RAD51,RAD3)——wereusedtoaligntherestrictionfragments.Thereare9,9,15,17,and20sitesforNotⅠ,SfiⅠ,SmaⅠ,SstⅡandApaⅠrespectivelyinthemapoftheA364achromosomeV.Itstotallengthwascalculatedtobe620Kb(Kilo-bases).Thedistributionsofthecuttingsitesforthesefiveenzymesthroughthewholechromosomearenotuniform.Acomp-arisonbetweenthephysicalmapandthegeneticmapwasalsomade.

  • 标签: YEAST chromcsome V macro-physical map DNA
  • 简介:人口genomic途径,利用高产量的genotyping,还是强大的扫描为的昂贵的方法选择扫。因为它是大规模单个genotyping的一种划算的选择,分享DNA策略广泛地为协会研究被使用了。这里,我们执行了SNP地图(单个核苷酸多型性microarrays并且分享)使用的分析从欧亚大陆取样评估为选择在染色体宽的扫描分享策略的效率。由进行allelotype数据的模拟,我们首先证明有平均杂合现象(HET)的boxplot是一个有希望的方法检测强壮选择与分享错误的中等水平扫。基于这,我们使用了HET的滑动窗户分析通常认为地检测大连续区域(LCR)在下面选择从欧亚大陆数据集扫。这调查在一张欧洲人口识别了63LCR。这些信号被综合haplotype分数(iHS)进一步支持测试使用HapMapII数据。我们也证实从几的积极选择的欧洲人特定的签名以前识别了基因(KEL,TRPV5,TRPV6,EPHB6)。在摘要,我们的结果不仅在扫描为揭示了SNP地图策略的高可靠选择扫,而且提供了卓见进人口区别。

  • 标签: 基因组学方法 扫描策略 区域地图 SNP 应用 单核苷酸多态性
  • 简介:Heme(铁protoporphyrinIX)是为众多的生活有机体的一个必要分子。不仅它在酶担任一个修复术的组,它也充当控制从信号transduction到蛋白质建筑群汇编的多样的分子、细胞的进程的一个发信号的分子。缺乏他我合成或功能影响造血,肝并且在人的神经系统。最近的研究包括Hap1揭示了一系列调整heme的抄写因素和信号变换器,调停的一个激活heme的抄写因素在酵母Saccharomycescerevisiae的基因抄写上的氧的效果;Bach1,否定地被调整由的一个transcriptional抑压者他我在哺乳动物的房间;IRR,一个熨斗调停的规章的蛋白质铁家属规定他我在细菌Bradyrhizobium的合成日本嗯;并且调整heme的禁止者,协调蛋白质合成与的eucaryotic开始因素2alphakinase他我在网状细胞的可获得性。在这评论,我们总结的当前的知识他我控制这些transcriptional管理者的活动并且表明变换器,并且讨论与有缺陷者联系的疾病他我合成,降级和函数。房间研究(2006)16:681-692。做i:10.1038/sj.cr.7310086;出版联机2006年8月8日。

  • 标签: 血红素 信号分子 转录因子 血液
  • 简介:MembersofBcl-2familyofproteinsareregulatorsofcelldeaththatcanbegroupedintosubfamiliesofprosurvivalandproapoptoticmolecules.Theyarecharacterizedbythepresenceofseveralconservedmotifs,knownastheBcl-2homology(BH)domains,designatedBH1,BH2,BH3andBH4.MutagenesisandstructuralstudiesrevealedthattheBHdomainsareimportantfunctionaldomainsthatarealsorequiredfordimerizationfunction.Recently,asubfamilyofproapoptoticmoleculesonlycontainsBH3motifhasbeenidentifiedsuggestingBH3domainalonemaybesufficientformediatingproapoptoticfunctionamong

  • 标签: 前凋亡蛋白 map-1 多bcl-2同源域 bax相关蛋白 特性