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  • 简介:摘要目的通过转录组学确定结核表位疫苗MP3RT在源化动物模型上诱导的差异表达基因(DEG),为阐明MP3RT潜在的分子机制提供新思路。方法本研究于2019年8月开始至2022年2月完成。本研究采用edgeR软件以差异倍数≥1.5且P<0.05为筛选条件筛DEG,对筛选出的DEG进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析以及蛋白互作网络分析。并对上述DEG通过RT-qPCR进行实验验证,采用GraphPad Prism 8软件进行统计学分析。结果转录组学鉴定了367个DEG(214个上调,153个下调)。生物信息学分析发现,上述DEG的GO富集显著聚焦于细胞代谢、生长、凋亡、炎症等词条,KEGG富集显著聚焦于MAPK信号通路等炎症相关通路。蛋白互作网络分析显示,蛋白Abl1聚集度最大,聚集系数最高,连通性最好。RT-qPCR结果显示,与磷酸盐缓冲液(PBS)组相比,MP3RT疫苗组中cpne4(t=2.48, P=0.048 0)、h2-q10(t=2.95,P=0.025 6)、mef2c(t=2.87,P=0.028 4)、cr2(t=3.23,P=0.178)、ablim1(t=2.91,P=0.033 5)、dll1(t=2.70,P=0.027 3)和ms4a2(t=3.03,P=0.019 2)基因表达水平显著上调,cd163l1(t=2.56,P=0.043 0)、il1r1(t=2.91,P=0.022 7)和cd34(t=2.42,P=0.046 2)基因表达水平显著下调。结论MP3RT表位疫苗在源化动物模型上诱导了367个DEG,这些DEG与新陈代谢和免疫反应相关,p38 MAPK和JNK/MAPK信号通路在MP3RT疫苗分子机制中扮演着重要的角色。

  • 标签: 结核分枝杆菌 表位疫苗 MP3RT 转录组学 差异表达基因