简介：摘要目的确定1例由孟加拉国输入芜湖的登革热病例及登革病毒(dengue virus, DENV)的E基因分子特征。方法提取患者血清标本核酸，使用Real-time RT-PCR方法进行DENV核酸通用及1/2/3/4血清型筛查。测定E基因完整序列，采用MEGA7.0软件构建E基因系统进化树，并进行E基因核苷酸和氨基酸序列比对分析。结果患者血清呈现2型DENV核酸阳性。E基因序列系统进化分析显示属于Cosmopolitan基因型，与2014年马来西亚输入中国台湾分离株(D2/Malaysia/1408aTw)同源性最高，核苷酸同源性为99.60%，氨基酸同源性为99.80%，有6处核苷酸差异(42：G→A; 141：G→A; 490：G→A; 516：A→G; 954：A→G; 1344：C→T)，1处氨基酸差异(164：V→I)。E蛋白拥有弱毒株特征位点E126-E和强毒株特征位点E383～385-E-P-G。结论输入型患者为2型DENV感染且该病毒起源于马来西亚。

简介：摘要目的了解安徽省2020年柯萨奇A组10型（coxsackievirus A10，CV-A10）流行特征及VP1区基因特征。方法选取2020年1月至12月安徽省各市疾控中心上送的手足口病（hand，foot and mouth disease，HFMD）标本，接种人横纹肌肉瘤细胞进行病毒分离培养，采用荧光定量RT-PCR鉴定病毒分离物，对CV-A10毒株进行RT-PCR VP1区扩增及序列测定，使用软件对测序结果进行分析并构建系统进化树。结果共分离HFMD标本186份，阳性标本147株，其中CV-A10分离株13株，占8.84%（13/147），柯萨奇病毒A组16型（coxsackievirus A16，CV-A16）分离株4株，占2.72%（4/147），柯萨奇病毒A组6型（coxsackievirus A6，CV-A6）分离株130株，占88.44%（130/147），未分离到肠道病毒A组71型（enterovirusA71，EV-A71），总病毒分离率为79.03%。将13株CV-A10毒株进行VP1区全长扩增，共获得6条完整VP1序列。本研究中CV-A10毒株VP1区核苷酸同源性为97.9%~100.0%，氨基酸同源性为99.0%~100.0%；与CV-A10原型株（Kowalik）VP1区核苷酸同源性为76.3%~76.6%，氨基酸同源性为92.3%~100.0%。系统进化分析显示CV-A10可划分为分为A~I 9个基因型，2020年安徽省6株CV-A10均属于C基因型。结论2020年安徽省CV-A10毒株属于C基因型，为优势流行基因型，与国内其他地区毒株共进化。

简介：摘要目的了解安徽省急性胃肠炎疫情中GI组诺如病毒基因型别分布和进化特征。方法收集2020年5月至2021年4月急性胃肠炎聚集性疫情病例诺如病毒核酸阳性肛拭子标本，荧光定量PCR分型检测诺如病毒GI和GII基因组，采用RT-PCR扩增GI组诺如病毒聚合酶区（RNA-dependent RNA polymerase，RdRp）和VP1区部分基因片段并测序。运用诺如病毒在线分型工具鉴定基因型别，利用MEGA 6.0软件构建RdRp和VP1区基因系统进化树。结果45起疫情142份诺如病毒核酸阳性标本中检出23份为GI阳性，占19%（23/142）；119份为GII阳性，占81%（119/142）。20份GI阳性标本PCR扩增产物测序成功。获取的20株诺如病毒RdRp-VP1区序列有6种分型，包括2株GI.1[P1]、2株GI.3[P10]、5株GI.3[P13]、2株GI.4[P4]、7株GI.5[P4]、2株GI.6[P11]。系统进化树显示：GI.1[P1]型安徽株与韩国株（MZ021974）、法国株（MK956173）同属一个进化分支；GI.3[P10]和GI.3[P13]型安徽株与中国台湾株（MN922742）、四川株（MW255366）、韩国株（MZ022026）进化距离较近；GI.4[P4]和GI.5[P4]型安徽株与2019年湖南株（MN938461）、2021年广东株（OK562729）处于一个进化分支；GI.6[P11]型安徽株独立为一个进化簇，与陕西株（MW243609）、日本株（LC646339）进化距离较近。结论安徽省急性胃肠炎GI组诺如病毒基因型分布呈多样性，有必要开展感染性腹泻疫情分子溯源监测。