基于RNA测序对肺腺癌合并肺栓塞表达谱的生物信息学分析

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摘要 摘要目的分析肺腺癌合并肺栓塞患者的差异表达基因,探讨肺腺癌合并肺栓塞可能的发病机制。方法前瞻性研究。采用RNA测序技术检测新疆医科大学附属肿瘤医院2019年1~12月肺腺癌合并肺栓塞患者、肺腺癌患者及肺栓塞患者(每组均4例)外周血中RNA表达,使用生物信息学分析肺腺癌合并肺栓塞组对比肺腺癌组及肺栓塞组的差异表达基因。经Excel软件取交集,筛选两对比组共同差异基因,利用Metascape在线工具对共同差异基因进行基因本体(GO)富集分析及京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析。结果从两对比组差异基因中筛选出147个共同差异基因,其中80个上调差异基因,67个下调差异基因,其中P值最小的前5个共同差异基因分别为:CD177、S100P、HP、EPHA4、PRTN3。GO分析显示共同差异基因主要富集于中性粒细胞活化、轴突发育、白细胞分化、防御反应的负调控等过程,KEGG富集分析显示共同差异基因主要参与代谢途径、肺结核、癌症途径、血小板活化等通路。结论CD177、S100P、HP、EPHA4、PRTN3等基因可能参与肺腺癌合并肺栓塞的发生,中性粒细胞活化、血小板活化等生物学过程及通路也可能与肺腺癌合并肺栓塞相关。
出处 《国际呼吸杂志》 2021年11期
出版日期 2021年06月15日(中国期刊网平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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